Vedci opisujú zloženie mikrobiómov u pacientov trpiacich IBD a PSC

V roku 2012, Profesor Jeroen Raes (Mikrobiologické centrum VIB-KU Leuven) zahájil projekt Flámsky črevo. Sekvenovanie fekálnych vzoriek viac ako 3, 000 zdravých dobrovoľníkov, Profesor Raes a jeho tím definovali hranice normálneho, črevná mikrobiota spojená so zdravím. Ďalšie, tím sa obrátil na skupiny pacientov, aby identifikovali zmeny mikrobiómu spojené s chorobami. Nedávno opísali takzvaný B2 enterotyp, nedostatok niektorých protizápalových baktérií. Dnes, ich výsledky o vysokej prevalencii tohto konkrétneho enterotypu pri viacerých diagnózach sú publikované v Mikrobiológia prírody .

Porovnanie mikrobiómov

Zápalové ochorenie čriev (IBD) zoskupuje niekoľko stavov charakterizovaných chronickým zápalom črevného traktu, vrátane ulceróznej kolitídy a Crohnovej choroby. Primárna sklerotizujúca cholangitída (PSC) je chronické ochorenie pečene zahŕňajúce zápal a zjazvenie žlčovodu, často súbežné s IBD. V ich novej štúdii vedci VIB-KU Leuven opisujú zloženie mikrobiómov u pacientov trpiacich IBD a PSC.

Prof. Jeroen Raes, VIB-KU Leuven

V priebehu rokov, mnoho výskumných skupín na celom svete sa pokúsilo popísať zmeny mikrobioty súvisiace s chorobami. Zvlášť IBD je horúcou témou výskumu mikrobiómov. Naša štúdia sa líši od týchto predchádzajúcich pokusov na troch frontoch. Najprv, porovnali sme mikrobiotiku pacientov s profilmi od zdravých dobrovoľníkov z nášho viac ako 3 -ročného katalógu projektov Flámsky Gut Flora, 000 mikrobiómov. Za druhé, v našich analýzach, nepozreli sme sa len na percentá rôznych baktérií prítomných vo vzorkách stolice, ale tiež použil novú techniku ​​na kvantifikáciu ich početnosti. Po tretie, opravili sme naše výsledky o faktory, ako je riedka stolica, často symptomatické pri študovaných chorobách, ale má vplyv na výsledok mikrobiómových analýz. “

Mikrobiálny odtlačok choroby

Kombinácia ich jedinečných znalostí v kvantitatívnom profilovaní mikrobiómov s ich znalosťami variácií mikrobioty spojených so zdravím, vedci z Leuvenu identifikovali zmenenú konfiguráciu mikrobiómov - tiež známu ako enterotyp - s vysokou prevalenciou medzi skupinami pacientov. Aj keď bol tento enterotyp pozorovaný u 13% zdravých dobrovoľníkov, bolo ho možné identifikovať u 38 až 78% pacientov s PSC a IBD.

Prof. Séverine Vermeire, gastroenterológ na UZ Leuven/KU Leuven, ktorí sa zúčastnili výskumu, objasňuje:„Táto aberantná konfigurácia mikrobiómu, ktorý nazývame enterotyp B2, sa vyznačuje nízkym výskytom baktérií a biodiverzitou. Má výrazný nedostatok v niektorých protizápalových baktériách, ako je Faecalibacterium. V skutočnosti, zisťujeme vyššie hladiny zápalu čriev u pacientov s enterotypom B2. Aj medzi zdravými ľuďmi nositelia tohto enterotypu majú o niečo vyššie hladiny celkového zápalu nízkeho stupňa. “

Črevný zápal, mikróby, a depresie

Prekvapivo, len pred niekoľkými mesiacmi, laboratórium profesora Raesa popísalo podobnú zmenu mikrobioty, ktorá je spojená s nižšou kvalitou života a dokonca s depresiou.

Profesor Jeroen Raes hovorí:"Zdá sa, že v mikrobiómových zmenách dochádza k veľkému prekrývaniu v rôznych skupinách pacientov. Enterotyp B2 sme zistili u približne 26% depresívnych jedincov. Ukázalo sa, že črevná mikrobiota hrá úlohu vo vývoji chorôb." v, napríklad, ulcerózna kolitída a Crohnova choroba, pri depresii je to oveľa menej jasné. Avšak, v budúcich štúdiách podrobnejšie preskúmame asociáciu medzi enterotypom B2 a depresiou. “

Zatiaľ čo asi 13% zdravých jedincov možno klasifikovať ako nosiče enterotypu B2, vedci zdôrazňujú, že by to nemalo byť dôvodom na obavy.

Profesor Jeroen Raes:„V tomto bode, nemôžeme predpovedať citlivosť na choroby alebo riziká na základe enterotypu osoby. Navyše, enterotypy nie sú pevné a dajú sa zmeniť, napríklad, zmena stravy. Pozorované asociácie medzi chorobami a súhvezdím mikrobioty neznamená, že črevné baktérie skutočne spôsobujú ochorenie. Mnoho osobných, životný štýl, a environmentálne faktory sú spojené s enterotypom B2. Avšak, ako sa tiež ukazuje, že u niektorých jedincov je zápal faktorom spojeným s B2, určite sa budeme ďalej zaoberať potenciálnou kauzalitou. “

• Testy zápalových markerov nie sú dostatočne citlivé na to, aby sa vylúčili vážne stavy,
• Výskum poukazuje na potenciálne ciele, ktoré majú pomôcť v boji proti Crohnovej chorobe