Forskere beskriver mikrobiomsammensætning hos patienter, der lider af IBD og PSC

I 2012, Professor Jeroen Raes (VIB-KU Leuven Center for Mikrobiologi) lancerede det flamske tarmflora-projekt. Sekvensering af fækale prøver på over 3, 000 raske frivillige, Prof. Raes og hans team definerede grænserne for en normal, sundhedsrelateret tarmmikrobiota. Næste, teamet henvendte sig til patientgrupper for at identificere mikrobiomændringer forbundet med sygdomme. For nylig, de beskrev den såkaldte B2-enterotype, mangler i nogle antiinflammatoriske bakterier. I dag, deres resultater om den høje forekomst af denne særlige enterotype på tværs af flere diagnoser er offentliggjort i Naturmikrobiologi .

Sammenligning af mikrobiomer

Inflammatorisk tarmsygdom (IBD) grupperer flere tilstande karakteriseret ved kronisk betændelse i tarmkanalen, herunder ulcerøs colitis og Crohns sygdom. Primær skleroserende cholangitis (PSC) er en kronisk leversygdom, der involverer betændelse og ardannelse i galdegangen, ofte samtidig med IBD. I deres nye undersøgelse, VIB-KU Leuven-forskerne beskriver mikrobiomsammensætning hos patienter, der lider af IBD og PSC.

Prof. Jeroen Raes, VIB-KU Leuven

I årenes løb, mange forskningsgrupper verden over har forsøgt at beskrive mikrobiotaændringer forbundet med sygdomme. Især IBD er et varmt emne inden for mikrobiomforskning. Vores undersøgelse adskiller sig fra disse tidligere forsøg på tre fronter. Først, vi sammenlignede mikrobiota af patienter med profiler fra raske frivillige fra vores Flemish Gut Flora Project -katalog på over 3, 000 mikrobiomer. Sekund, i vores analyser, vi kiggede ikke kun på procentdele af forskellige bakterier, der er til stede i afføringsprøverne, men brugte også en ny teknik til at kvantificere deres overflod. Tredje, vi korrigerede vores resultater for faktorer som løs afføring, ofte symptomatisk i de undersøgte sygdomme, men påvirker resultatet af mikrobiomanalyser. "

Et mikrobielt fingeraftryk af sygdom

Kombinerer deres unikke ekspertise inden for kvantitativ mikrobiomprofilering med deres viden om sundhedsrelateret mikrobiota-variation, Leuven -forskerne identificerede en ændret mikrobiokonfiguration - også kendt som en enterotype - med høj forekomst blandt patientgrupper. Mens denne enterotype blev observeret hos 13% af raske frivillige, det kunne identificeres hos 38 til 78% af PSC- og IBD -patienter.

Prof. Séverine Vermeire, gastroenterolog hos UZ Leuven/KU Leuven, der deltog i undersøgelsen, præciserer:"Denne afvigende mikrobiom -konfiguration, som vi kalder B2 -enterotypen, er kendetegnet ved lave bakterier og biodiversitet. Det er især mangelfuldt i nogle antiinflammatoriske bakterier såsom Faecalibacterium. Faktisk, vi opdager højere niveauer af tarmbetændelse hos patienter med B2 -enterotypen. Selv blandt raske individer, bærere af denne enterotype har lidt højere niveauer af generel lavgradig betændelse. "

Tarmbetændelse, mikrober, og depression

Overraskende, kun et par måneder siden, Raes laboratorium beskrev en lignende mikrobiotaændring, der var forbundet med lavere livskvalitet og endda depression.

Professor Jeroen Raes siger:"Der ser ud til at være et stort overlap i mikrobiomændringer observeret på tværs af forskellige patientgrupper. Vi opdagede B2 -enterotypen hos omkring 26% af deprimerede individer. Mens tarmmikrobiota har vist sig at spille en rolle i sygdomsudvikling i, for eksempel, ulcerøs colitis og Crohns sygdom, dette er langt mindre klart for depression. Imidlertid, Vi vil undersøge sammenhængen mellem B2 -enterotypen og depression mere detaljeret i fremtidige undersøgelser. "

Mens omkring 13% af raske individer kan klassificeres som bærere af B2 -enterotypen, forskerne understreger, at dette ikke bør være en grund til bekymring.

Professor Jeroen Raes:"På dette tidspunkt, vi kan ikke foretage nogen forudsigelse om sygdomsfølsomhed eller risiko baseret på en persons enterotype. I øvrigt, enterotyper er ikke faste og kan ændres ved, for eksempel, ændre din kost. De observerede sammenhænge mellem sygdomme og mikrobiota -konstellationer betyder ikke, at tarmbakterierne faktisk forårsager sygdommen. Mange personlige, livsstil, og miljøfaktorer er knyttet til en B2 -enterotype. Imidlertid, da også inflammation viser sig at være en B2-associeret faktor hos nogle individer, vi vil helt sikkert se nærmere på potentiel årsagssammenhæng. "

• Inflammatoriske markørtest er ikke følsomme nok til at udelukke alvorlige tilstande,
• Forskning fremhæver potentielle mål for at hjælpe med at bekæmpe Crohns sygdom