Wetenschappers beschrijven de samenstelling van het microbioom bij patiënten die lijden aan IBD en PSC

Door de jaren heen, veel onderzoeksgroepen over de hele wereld hebben geprobeerd microbiota-veranderingen te beschrijven die verband houden met ziekten. Vooral IBD is een hot topic in microbioomonderzoek. Ons onderzoek verschilt op drie fronten van deze eerdere pogingen. Eerst, we vergeleken de microbiota van patiënten met profielen van gezonde vrijwilligers uit onze Vlaamse Gut Flora Project-catalogus van meer dan 3, 000 microbiomen. Tweede, in onze analyses, we hebben niet alleen gekeken naar de percentages verschillende bacteriën die aanwezig zijn in de ontlastingsmonsters, maar gebruikten ook een nieuwe techniek om hun abundanties te kwantificeren. Derde, we hebben onze resultaten gecorrigeerd voor factoren zoals dunne ontlasting, vaak symptomatisch bij de bestudeerde ziekten, maar die de uitkomst van microbioomanalyses beïnvloeden."

Een microbiële vingerafdruk van ziekte

Door hun unieke expertise in kwantitatieve microbioomprofilering te combineren met hun kennis over gezondheidsgerelateerde microbiotavariatie, de Leuvense wetenschappers identificeerden een veranderde microbioomconfiguratie - ook wel een enterotype genoemd - met een hoge prevalentie bij patiëntengroepen. Hoewel dit enterotype werd waargenomen bij 13% van de gezonde vrijwilligers, het kon worden geïdentificeerd bij 38 tot 78% van de PSC- en IBD-patiënten.

Prof. Séverine Vermeire, gastro-enteroloog bij UZ Leuven/KU Leuven, die deelnamen aan het onderzoek, verduidelijkt:"Deze afwijkende microbioomconfiguratie, die we het B2-enterotype noemen, wordt gekenmerkt door een lage bacteriële abundantie en biodiversiteit. Het heeft met name een tekort aan sommige ontstekingsremmende bacteriën zoals Faecalibacterium. In feite, we detecteren hogere niveaus van darmontsteking bij patiënten met het B2-enterotype. Ook bij gezonde mensen dragers van dit enterotype hebben iets hogere niveaus van algehele laaggradige ontsteking."

Darm ontsteking, microben, en depressie

Verrassend genoeg, nog maar een paar maanden geleden, het lab van Prof. Raes beschreef een gelijkaardige verandering van de microbiota die geassocieerd werd met een lagere kwaliteit van leven en zelfs depressie.

Prof. Jeroen Raes zegt:"Er lijkt een grote overlap te zijn in microbioomveranderingen die zijn waargenomen bij verschillende patiëntengroepen. We hebben het B2-enterotype gedetecteerd bij ongeveer 26% van de depressieve personen. Hoewel is aangetoond dat de darmmicrobiota een rol speelt bij de ontwikkeling van ziekten in, bijvoorbeeld, colitis ulcerosa en de ziekte van Crohn, dit is veel minder duidelijk voor depressie. Echter, we zullen de associatie tussen het B2-enterotype en depressie in toekomstige studies in meer detail onderzoeken."

Terwijl ongeveer 13% van de gezonde personen kan worden geclassificeerd als dragers van het B2-enterotype, de onderzoekers benadrukken dat dit geen reden tot zorg hoeft te zijn.

Prof. Jeroen Raes:"Op dit punt we kunnen geen voorspelling doen over ziektegevoeligheid of risico op basis van iemands enterotype. Bovendien, enterotypes staan ​​niet vast en kunnen worden gewijzigd door, bijvoorbeeld, het veranderen van uw dieet. De waargenomen associaties tussen ziekten en microbiota-constellaties impliceren niet dat de darmbacteriën de ziekte daadwerkelijk veroorzaken. Veel persoonlijke, levensstijl, en omgevingsfactoren zijn gekoppeld aan een B2-enterotype. Echter, aangezien ook ontsteking bij sommige individuen een B2-geassocieerde factor blijkt te zijn, we zullen zeker verder kijken naar mogelijke causaliteit."​

• Tests op ontstekingsmarkers zijn niet gevoelig genoeg om ernstige aandoeningen uit te sluiten,
• Onderzoek wijst op potentiële doelwitten om de ziekte van Crohn te helpen bestrijden