Usporedba mikrobioma
Upalne bolesti crijeva (IBD) grupiraju nekoliko stanja koja karakteriziraju kronična upala crijevnog trakta, uključujući ulcerozni kolitis i Crohnovu bolest. Primarni sklerozirajući kolangitis (PSC) je kronično stanje jetre koje uključuje upalu i ožiljke na žučnom kanalu, često istodobno s IBD -om. U svom novom istraživanju, znanstvenici VIB-KU iz Leuvena opisuju sastav mikrobioma u pacijenata koji boluju od IBD-a i PSC-a.
Prof. Jeroen Raes, VIB-KU Leuven
Tijekom godina, mnoge su istraživačke skupine diljem svijeta pokušale opisati promjene mikrobiote povezane s bolestima. Posebno je IBD vruća tema u istraživanju mikrobioma. Naša se studija razlikuje od ovih prethodnih pokušaja na tri fronta. Prvi, uspoređivali smo mikrobiotu pacijenata sa profilima zdravih dobrovoljaca iz našeg kataloga projekta Flaman Gut Flora Project od preko 3, 000 mikrobioma. Drugi, u našim analizama, nismo gledali samo postotke različitih bakterija prisutnih u uzorcima stolice, ali su također koristili novu tehniku za kvantificiranje njihovog obilja. Treći, korigirali smo naše rezultate za čimbenike poput rijetke stolice, često simptomatski kod proučavanih bolesti, ali utječu na ishod analiza mikrobioma. "
Mikrobni otisak prsta bolesti
Kombinirajući svoju jedinstvenu stručnost u kvantitativnom profiliranju mikrobioma sa znanjem o varijacijama mikrobiote povezanih sa zdravljem, znanstvenici iz Leuvena identificirali su promijenjenu konfiguraciju mikrobioma - također poznatu kao enterotip - s visokom prevalencijom među skupinama pacijenata. Dok je ovaj enterotip uočen u 13% zdravih dobrovoljaca, mogao bi se identificirati u 38 do 78% pacijenata sa PSC i IBD.
Prof. Séverine Vermeire, gastroenterolog u UZ Leuven/KU Leuven, koji su sudjelovali u istraživanju, pojašnjava:"Ova aberantna konfiguracija mikrobioma, koji nazivamo enterotip B2, karakterizira niska brojnost bakterija i bioraznolikost. Osobito mu nedostaju neke protuupalne bakterije, poput Faecalibacterium. Zapravo, otkrivamo veće razine crijevne upale u bolesnika s B2 enterotipom. Čak i među zdravim pojedincima, nositelji ovog enterotipa imaju nešto višu razinu ukupne upale niskog stupnja. "
Upala crijeva, mikrobi, i depresije
Iznenađujuče, prije samo nekoliko mjeseci, laboratorij prof. Raesa opisao je sličnu promjenu mikrobiote koja je povezana s nižom kvalitetom života, pa čak i depresijom.
Profesor Jeroen Raes kaže:"Čini se da postoji veliko preklapanje u promjenama mikrobioma uočenih u različitim skupinama pacijenata. Otkrili smo B2 enterotip u oko 26% depresivnih osoba. Dok je pokazano da crijevna mikrobiota igra ulogu u razvoju bolesti u, na primjer, ulcerozni kolitis i Crohnova bolest, ovo je daleko manje jasno za depresiju. Međutim, detaljnije ćemo u budućim studijama istražiti povezanost enterotipa B2 i depresije. "
Dok se oko 13% zdravih osoba može klasificirati kao nositelji enterotipa B2, istraživači naglašavaju da to ne bi trebao biti razlog za zabrinutost.
Prof. Jeroen Raes:"U ovom trenutku, ne možemo predvidjeti osjetljivost na bolest ili rizik na temelju enterotipa osobe. Štoviše, enterotipovi nisu fiksni i mogu se promijeniti, na primjer, promjenu prehrane. Uočena povezanost između bolesti i sazviježđa mikrobiote ne znači da crijevne bakterije zapravo uzrokuju bolest. Mnogi osobni, stil života, a čimbenici okoliša povezani su s enterotipom B2. Međutim, budući da se također pokazalo da je upala faktor povezan s B2 kod nekih pojedinaca, zasigurno ćemo dalje istraživati potencijalnu uzročnost. "