Mikrobi bi lahko napovedali smrtne izide pri bolnikih s prezračevanjem COVID-19

Prisotnost Mycoplasma salivarium v spodnjih dihalnih poteh bolnikov s prezračevanjem z okužbo s COVID-19 je povezana s povečano verjetnostjo smrti. Rezultat je bil del molekularne raziskave, ki je preučila, kako mikrookolje dihalnih poti vplivajo na hud akutni respiratorni sindrom (SARS-CoV-2).

Leopoldo N. Segal in sodelavci kažejo, da bi lahko pljučni mikrobi napovedali hudo okužbo s COVID in odpornost protiteles.

"Ti podatki poudarjajo pomen številčnosti SARS-CoV-2 v spodnjih dihalnih poteh kot napovedovalca smrtnosti, in pomemben prispevek transkriptoma celice gostitelja, ki odraža odziv celic spodnjih dihalnih poti na okužbo, «so zapisali raziskovalci.

Ugotovitve bi lahko pomagale prepoznati bolnike, ki so najbolj ogroženi zaradi slabih kliničnih izidov, in že zgodaj ponuditi alternativno zdravljenje.

Študija "Mikrobni podpisi v spodnjih dihalnih poteh pri bolnikih z mehansko prezračevano COVID19, povezanih s slabim kliničnim izidom" je na voljo kot prednatis na medRxiv * strežnik, medtem ko je članek podvržen strokovnemu pregledu.

Razvrstitev mikrobnih podpisov

Zbrani vzorci spodnjih dihalnih poti pri bolnikih na prezračevanju zaradi okužbe s COVID-19 med prvim valom v New Yorku. Zbrali so vzorce dihalnih poti pri 142 bolnikih z okužbo s COVID-19.

Mycoplasma salivarium v dihalnih poteh je povezana s slabšimi kliničnimi izidi

Z uporabo metagenomike, raziskovalci so mikrobe, ki živijo v pljučnem mikrobiomu, povezali s kliničnimi rezultati bolnikov.

Rezultati so pokazali, da imajo velike količine Mycoplasma salivarium je bil povezan z večjo virusno obremenitvijo SARS-CoV-2. Poleg tega omejen imunoglobulinski odziv v spodnjih dihalnih poteh, povezan s povečanim tveganjem smrtnosti.

"Podatki, predstavljeni tukaj z uporabo neposrednih količinskih metod (RT-PCR) in polkvantitativnega neciljnega pristopa (zaporedje metatranskriptomov), podpirajo hipotezo, da ima virusna obremenitev SARS-CoV-2 v spodnjih dihalnih poteh ključno vlogo pri kliničnem napredovanju kritično bolnih bolnikov s COVID-19, «so zapisali raziskovalci.

Ni dokazov o slabših kliničnih izidih sočasne okužbe z dihalnimi patogeni

Medtem ko je večina bolnikov prejemala antibiotike širokega spektra in protiglivična zdravila, ni bilo dokazov o poslabšanju učinkov sočasne okužbe z bakterijo, virusno, in glivičnih patogenov dihal.

Če pogledamo tveganje smrti zaradi okužbe s COVID-19, skupina je analizirala laboratorijske kulture 589 bolnikov, hospitaliziranih zaradi odpovedi dihanja zaradi hude okužbe s COVID-19.

Rezultati so pokazali, da bolniki s slabimi kliničnimi izidi niso podlegli drugim okužbam dihal. Prav tako ni bilo povezave med pozitivnimi mikrobnimi kulturami in smrtnostjo pri hudih okužbah s COVID-19.

Povezave med pozitivnostjo kulture in kliničnim izidom. Razmerja verjetnosti in ustrezni 95 -odstotni intervali zaupanja za stopnjo pozitivnosti kulture za celotno kohorto (n =589) v času njihove hospitalizacije (levo) in v prvih 2 tednih hospitalizacije (desno).

Bakterijske spremembe, opažene pri bolnikih, ki so bili zračeni več kot 28 dni

Če pogledamo onkraj mikrobov, spodnje dihalne poti so pokazale visoko prisotnost SARS-CoV-2, ki je bila povezana s smrtjo. Majhen vzorec bolnikov je imel viruse gripe A ali B, kar nakazuje, da ni verjetno, da se je gripa pojavila hkrati z okužbo s koronavirusom.

Ko opazujemo bakterije v spodnjih dihalnih poteh, metatranskriptomski podatki, ki jih najdemo aktivno prisotne. Raziskovalci menijo, da je to lahko dokaz, da bi se pri bolnikih s hudo okužbo s COVID-19 lahko zgodile zamenjave bakterijskega mikrobioma.

Spremembe so bile opažene v Stafilokoki fagi, in Mycoplasma salivarium je bil aktivno prisoten pri bolnikih, ki potrebujejo prezračevanje več kot 28 let, in bolnikih, ki so umrli v primerjavi z bolniki, ki so bili prezračeni manj kot 28 dni.

Mikrobni vpliv na imunski odziv

Bolniki s slabimi kliničnimi izidi so izrazili poti, ki so aktivirale gene, povezane z razgradnjo, prevoz, kot tudi izražanje genov za protimikrobno odpornost in signalizacijo.

Raziskovalci pišejo:

"Te razlike lahko kažejo na pomembne funkcionalne razlike, ki vodijo do drugačnega presnovnega okolja v spodnjih dihalnih poteh, kar bi lahko vplivalo na imunski odziv gostitelja. Lahko bi bilo tudi reprezentativno za razlike v mikrobnem tlaku pri bolnikih z višjo virusno obremenitvijo in različnimi vnetnimi okolji."

Prav tako je prišlo do večje regulacije signalnih poti Sirtuin in Ferroptosis v najhuje bolnih primerih COVID-19. To je sovpadalo z inaktiviranimi funkcijami imunskega odziva, vključno s fagociti, nevtrofilci, granulociti, in levkociti. Opazili so tudi znižanje ravni izražanja imunoglobulina in mitohondrijsko disfunkcijo.

Na podlagi podatkov, ekipa predlaga, da pljuča kritično bolnih bolnikov, ki potrebujejo prezračevanje zaradi okužbe s COVID-19, izražajo neravnovesje in ne povečano vnetje. Zdi se, da to početje napoveduje poslabšanje napovedi.

Nadaljnja analiza je pokazala, da so v preživetju povezane razlike v odzivih na interferon. Aktivacija interferona tipa I je bila napovedni dejavnik za povečano smrtnost.

"Čeprav bodo potrebni dodatni longitudinalni podatki za pojasnitev vloge signalizacije interferona pri bolezni, tukaj predstavljeni podatki kažejo, da bi združevanje mikrobnih in gostiteljskih podpisov lahko pomagalo razumeti povečano tveganje smrtnosti pri kritično bolnih bolnikih s COVID-19. "

* Pomembno obvestilo

medRxiv objavlja predhodna znanstvena poročila, ki niso recenzirana in, zato, ne velja za dokončno, vodi klinično prakso/vedenje, povezano z zdravjem, ali se obravnavajo kot uveljavljeni podatki.

• Študija:Črevesni mikrobiom lahko napoveduje spremembe pri uravnavanju glukoze, povezane s sladkorno boleznijo tipa 2
• Študija kaže neposredno povezavo med črevesnim mikrobiomom in Alzheimerjevim vedenjem