Leopoldo N. Segal ir jo kolegos teigia, kad plaučių mikrobai gali numatyti sunkią COVID infekciją ir atsparumą antikūnams.
„Šie duomenys pabrėžia SARS-CoV-2 gausos svarbą apatiniuose kvėpavimo takuose kaip mirtingumo prognozę, ir reikšmingas ląstelės šeimininkės transkripto indėlis, atspindi apatinių kvėpavimo takų ląstelių reakciją į infekciją, “ - rašė tyrėjai.
Išvados galėtų padėti nustatyti pacientus, kuriems labiausiai gresia blogi klinikiniai rezultatai, ir anksti pasiūlyti alternatyvų gydymą.
Tyrimas „Mikrobiologiniai parašai mechaniškai vėdinamų COVID19 sergančių pacientų apatiniuose kvėpavimo takuose, susiję su blogais klinikiniais rezultatais“ yra parengtas kaip atspaudas medRxiv * serveris, kol straipsnis yra tarpusavyje vertinamas.
Surinkti apatinių kvėpavimo takų mėginiai iš pacientų, vėdinamų nuo COVID-19 infekcijos per pirmąją bangą Niujorke. Jie surinko kvėpavimo takų mėginius iš 142 pacientų, sergančių COVID-19 infekcija.
Naudojant metagenomiką, tyrėjai susiejo plaučių mikrobiome gyvenančius mikrobus su pacientų klinikiniais rezultatais.
Rezultatai parodė, kad turint didelius kiekius Mikoplazmos seilių buvo susijęs su didesne SARS-CoV-2 viruso apkrova. Papildomai, ribotas imunoglobulino atsakas apatiniuose kvėpavimo takuose koreliuoja su padidėjusia mirtingumo rizika.
„Čia pateikti duomenys, naudojant tiesioginius kiekybinius metodus (RT-PCR) ir pusiau kiekybinį netikslinį metodą (metatranskripto sekos nustatymas), patvirtina hipotezę, kad SARS-CoV-2 viruso apkrova apatiniuose kvėpavimo takuose vaidina svarbų vaidmenį klinikinėje progresijoje. sunkiai sergančių COVID-19 pacientų, “ - rašė tyrėjai.
Nors daugumai pacientų buvo skiriami plataus spektro antibiotikai ir priešgrybeliniai vaistai, nebuvo įrodymų, kad dėl infekcijos su bakterijomis blogėtų poveikis, virusinis, ir grybeliniai kvėpavimo takų patogenai.
Norėdami įvertinti mirtingumo nuo COVID-19 infekcijos riziką, komanda išanalizavo 589 pacientų laboratorines kultūras, hospitalizuotas dėl kvėpavimo nepakankamumo dėl sunkios COVID-19 infekcijos.
Rezultatai parodė, kad pacientai, kurių klinikiniai rezultatai prasti, nepasidavė kitoms kvėpavimo takų infekcijoms. Taip pat nebuvo ryšio tarp teigiamų mikrobų kultūrų ir mirtingumo nuo sunkių COVID-19 infekcijų.
Asociacijos tarp kultūros pozityvumo ir klinikinių rezultatų. Šansų koeficientai ir atitinkami 95% pasitikėjimo intervalai kultūros teigiamumo rodikliams visoje kohortoje (n =589) jų hospitalizacijos metu (kairėje) ir per pirmąsias 2 hospitalizacijos savaites (dešinėje).Žvelgiant ne tik į mikrobus, apatiniuose kvėpavimo takuose buvo daug SARS-CoV-2, kuris buvo susijęs su mirtimi. Nedidelis pacientų mėginys sirgo A ar B gripo virusais, tai rodo, kad mažai tikėtina, kad gripas susirgo kartu su koronaviruso infekcija.
Stebint bakterijas apatiniuose kvėpavimo takuose, metatranskripto duomenys nustatė, kad fagai yra aktyviai. Mokslininkai teigia, kad tai gali būti įrodymas, kad pacientams, sergantiems sunkia COVID-19 infekcija, gali pasikeisti bakterijų mikrobiomas.
Pastebimi pokyčiai Stafilokokas fagai, ir Mikoplazmos seilių aktyviai dalyvavo pacientams, kuriems reikalinga ventiliacija daugiau nei 28, ir pacientams, kurie mirė, palyginti su pacientais, kurie buvo vėdinami mažiau nei 28 dienas.
Pacientai, kurių klinikiniai rezultatai prasti, išreiškė kelius, kurie suaktyvino genus, susijusius su degradacija, transportas, taip pat išreikšti atsparumo antimikrobinėms medžiagoms genus ir signalizuoti.
Mokslininkai rašo:
"Šie skirtumai gali reikšti svarbius funkcinius skirtumus, lemiančius skirtingą metabolinę aplinką apatiniuose kvėpavimo takuose, kurie gali turėti įtakos šeimininko imuniniam atsakui. Tai taip pat gali atspindėti mikrobų slėgio skirtumus pacientams, kuriems yra didesnė viruso apkrova ir skirtinga uždegiminė aplinka."
Sirtuino ir Ferroptozės signalizacijos keliai taip pat buvo sureguliuoti sunkiausiai sergantiems COVID-19 atvejams. Tai sutapo su inaktyvuotomis imuninio atsako savybėmis, įskaitant fagocitus, neutrofilai, granulocitai, ir leukocitai. Taip pat buvo pastebėtas sumažėjęs imunoglobulino ekspresijos lygis ir mitochondrijų disfunkcija.
Remiantis duomenimis, komanda siūlo, kad sunkiai sergančių pacientų plaučiai, kuriems reikalinga ventiliacija nuo COVID-19 infekcijos, išreikštų nesubalansuotą būseną, o ne padidėjusį uždegimą. Atrodo, kad tai darys blogėjančias prognozes.
Tolesnė analizė nustatė su išgyvenimu susijusius interferono atsakų skirtumus. I tipo interferono aktyvinimas buvo prognozuojantis padidėjusio mirtingumo veiksnys.
„Nors norint išsiaiškinti interferono signalizacijos vaidmenį ligai, reikės papildomų išilginių duomenų, čia pateikti duomenys rodo, kad mikrobų ir šeimininkų parašų derinimas gali padėti suprasti padidėjusią mirtingumo riziką sunkiai sergantiems COVID-19 pacientams “.
medRxiv skelbia preliminarias mokslines ataskaitas, kurios nėra recenzuojamos ir todėl, neturėtų būti laikomas galutiniu, vadovauti klinikinei praktikai/su sveikata susijusiam elgesiui, arba traktuojama kaip nustatyta informacija.