Леопольдо Н. Сигал и его коллеги предполагают, что легочные микробы могут быть предиктором тяжелой инфекции COVID и устойчивости к антителам.
<цитата>«Эти данные подчеркивают важность распространенности SARS-CoV-2 в нижних дыхательных путях как предиктора смертности, и значительный вклад транскриптома клетки-хозяина, что отражает реакцию клеток нижних дыхательных путей на инфекцию, "написали исследователи.
Полученные данные могут помочь выявить пациентов, подвергающихся наибольшему риску неблагоприятных клинических исходов, и на ранней стадии предложить альтернативные методы лечения.
Исследование «Микробные сигнатуры в нижних дыхательных путях у пациентов с COVID19 на механической вентиляции, связанные с плохим клиническим исходом» доступно в виде препринта на medRxiv * сервер, пока статья проходит рецензирование.
Собранные образцы нижних дыхательных путей у пациентов на искусственной вентиляции легких от инфекции COVID-19 во время первой волны в Нью-Йорке. Они собрали образцы дыхательных путей у 142 пациентов с инфекцией COVID-19.
Используя метагеномику, исследователи связали микробы, живущие в микробиоме легких, с клиническими исходами пациентов.
Результаты показали, что наличие большого количества Микоплазма саливарий был связан с более высокой вирусной нагрузкой SARS-CoV-2. Кроме того, ограниченный иммуноглобулиновый ответ в нижних дыхательных путях коррелировал с повышенным риском смертности.
<цитата>"Данные, представленные здесь с помощью прямых количественных методов (ОТ-ПЦР) и полуколичественного нецелевого подхода (секвенирование метатранскриптома), подтверждают гипотезу о том, что вирусная нагрузка SARS-CoV-2 в нижних дыхательных путях играет критическую роль в клиническом прогрессе. тяжелобольных пациентов с COVID-19, "написали исследователи.
Хотя большинству пациентов давали антибиотики широкого спектра действия и противогрибковые препараты, не было доказательств ухудшения эффектов от сочетанной инфекции с бактериальными, популярный, и респираторные возбудители грибов.
Чтобы посмотреть на риск смерти от инфекции COVID-19, Команда проанализировала лабораторные культуры 589 пациентов, госпитализированных по поводу дыхательной недостаточности из-за тяжелой инфекции COVID-19.
Результаты показали, что пациенты с плохими клиническими исходами не страдали от других респираторных инфекций. Также не было никакой связи между положительными микробными культурами и смертностью при тяжелых инфекциях COVID-19.
Связь между положительным посевом и клиническим исходом. Отношения шансов и соответствующие 95% доверительные интервалы для показателей положительности посева для всей когорты (n =589) в течение срока их госпитализации (слева) и в течение первых 2 недель госпитализации (справа). Помимо микробов, нижние дыхательные пути показали высокое присутствие SARS-CoV-2, что было связано со смертью. Крошечная выборка пациентов была заражена вирусами гриппа A или B, Это свидетельствует о маловероятности того, что грипп произошел одновременно с коронавирусной инфекцией.
Наблюдая за бактериями в нижних дыхательных путях, данные метатранскриптома показали, что фаги активно присутствуют. Исследователи предполагают, что это может быть доказательством того, что изменения в бактериальном микробиоме могут происходить у пациентов с тяжелой инфекцией COVID-19.
Изменения наблюдались в Стафилококк фаги, а также Микоплазма саливарий активно присутствовал у пациентов, нуждающихся в вентиляции более 28 дней, и у умерших пациентов по сравнению с пациентами, которым вентиляция была менее 28 дней.
У пациентов с плохими клиническими исходами выявлены метаболические пути, активирующие гены, связанные с деградацией, транспорт, а также экспрессирующие гены устойчивости к противомикробным препаратам и передачу сигналов.
Исследователи пишут:
<цитата>«Эти различия могут указывать на важные функциональные различия, ведущие к различной метаболической среде в нижних дыхательных путях, что может повлиять на иммунные ответы хозяина. Это также может быть репрезентативным для различий в микробном давлении у пациентов с более высокой вирусной нагрузкой и различной воспалительной средой».
Также наблюдалась повышенная регуляция сигнальных путей сиртуина и ферроптоза в наиболее тяжелых случаях COVID-19. Это совпало с признаками инактивированного иммунного ответа, в том числе фагоциты, нейтрофилы, гранулоциты, и лейкоциты. Также наблюдались снижение уровня экспрессии иммуноглобулинов и митохондриальная дисфункция.
Исходя из данных, команда предполагает, что легкие критически больных пациентов, которым требуется вентиляция из-за инфекции COVID-19, выражают несбалансированное состояние, а не повышенное воспаление. Это, по-видимому, указывает на ухудшение прогноза.
Дальнейший анализ выявил различия в ответах на интерферон, связанные с выживаемостью. Активация интерферона I типа была прогностическим фактором повышения смертности.
<цитата>"Хотя потребуются дальнейшие продольные данные, чтобы прояснить роль передачи сигналов интерферона в заболевании, данные, представленные здесь, предполагают, что объединение микробных сигнатур и сигнатур хозяина может помочь понять повышенный риск смертности у тяжелобольных пациентов с COVID-19 ».
medRxiv публикует предварительные научные отчеты, не прошедшие рецензирование, и, следовательно, не следует рассматривать как окончательный, руководить клинической практикой / поведением, связанным со здоровьем, или рассматриваться как установленная информация.
Ученые извлекли полный геном человека из «жевательной резинки» возрастом тысячи лет.
Ксилит и экстракт семян грейпфрута обещают предотвратить заражение SARS-CoV-2,
Тип бактерий верхних дыхательных путей может влиять на тяжесть астмы
Дырявый кишечник и космический полет - раскрыт механизм
Исследования говорят о собачьей инфекции SARS-CoV-2,
Сельская и городская микробиота отличается с юного возраста,
Как справиться с синдромом раздраженного кишечника
Считается, что синдром раздраженного кишечника (СРК) поражает от 25 до 45 миллионов американцев, в основном женщины в возрасте от позднего подросткового возраста до начала 40-х годов. Состояние предст
Исследование показывает противовирусные эффекты куркумина
Куркумин, натуральное соединение, содержащееся в специи куркумы, может помочь устранить определенные вирусы, исследование нашло. Исследование, опубликованное в Журнал общей вирусологии показали, ч
Сильный микробиом в раннем возрасте связан с меньшим количеством респираторных инфекций
В разных частях тела человека, в том числе в носу, есть колонии микроскопических бактерий. рот, кишечник и легкие. Коллективно эти бактерии известны как микробиота организма. Исследования показали,