Leopoldo N.Segal ja hänen kollegansa ehdottavat, että keuhkojen mikrobit voivat ennustaa vakavan COVID -infektion ja vasta -aineresistenssin.
"Nämä tiedot korostavat SARS-CoV-2 -määrän merkitystä alemmissa hengitysteissä kuolleisuuden ennustajana, ja isäntäsolun transkriptomin merkittävä osuus, joka kuvastaa alempien hengitysteiden soluvastetta infektioon, "kirjoittavat tutkijat.
Tulokset voivat auttaa tunnistamaan potilaat, jotka ovat eniten vaarassa saada huonoja kliinisiä tuloksia, ja tarjota vaihtoehtoisia hoitoja varhaisessa vaiheessa.
Tutkimus "Mikrobiologiset allekirjoitukset mekaanisesti tuuletettujen COVID19 -potilaiden alemmissa hengitysteissä, jotka liittyvät huonoon kliiniseen tulokseen" on saatavana esipainona medRxiv * palvelin, kun artikkeli on vertaisarvioitu.
Kerätyt alempien hengitysteiden näytteet potilailta, jotka hengittivät COVID-19-infektiota ensimmäisen aallon aikana New Yorkissa. He keräsivät hengitysteidenäytteitä 142 potilaalta, joilla oli COVID-19-infektio.
Metagenomiikan avulla tutkijat linkittivät keuhkojen mikrobiomissa elävät mikrobit potilaiden kliinisiin tuloksiin.
Tulokset osoittivat, että suuria määriä Mycoplasma salivarium liittyi suurempaan SARS-CoV-2:n viruskuormaan. Lisäksi, rajoitettu immunoglobuliinivaste alemmissa hengitysteissä korreloi kuolleisuuden lisääntymisen kanssa.
"Tässä esitetyt tiedot suorien kvantitatiivisten menetelmien (RT-PCR) ja puolikvantitatiivisen kohdistamattoman lähestymistavan (metatranskriptisekvensointi) avulla tukevat hypoteesia, jonka mukaan SARS-CoV-2-viruskuormalla alemmissa hengitysteissä on kriittinen rooli kliinisessä etenemisessä vakavasti sairaista COVID-19-potilaista, "kirjoittavat tutkijat.
Vaikka useimmat potilaat saivat laajakirjoisia antibiootteja ja sienilääkkeitä, ei ollut näyttöä bakteerien samanaikaisen infektion pahentavista vaikutuksista, virus, ja sienet hengityselinten patogeenit.
Jos haluat tarkastella COVID-19-infektion aiheuttaman kuolleisuuden riskiä, ryhmä analysoi laboratorioviljelmiä 589 potilaalta, jotka olivat sairaalahoidossa vaikean COVID-19-infektion aiheuttaman hengitysvajeen vuoksi.
Tulokset osoittivat, että potilaat, joiden kliiniset tulokset olivat huonot, eivät antautuneet muihin hengitystieinfektioihin. Myöskään positiivisten mikrobiviljelmien ja vakavien COVID-19-infektioiden kuolleisuuden välillä ei ollut yhteyttä.
Kulttuuripositiivisuuden ja kliinisen tuloksen väliset yhteydet. Kertoimet ja vastaavat 95%:n luottamusvälit kulttuuripositiivisuuden määrille koko kohortilla (n =589) sairaalahoidon aikana (vasemmalla) ja kahden ensimmäisen sairaalaviikon aikana (oikealla). Katsomalla mikrobeja pidemmälle, alemmissa hengitysteissä esiintyi runsaasti SARS-CoV-2:ta, joka liittyi kuolemaan. Pienellä näytteellä potilaista oli influenssa A- tai B -viruksia, viittaa siihen, että on epätodennäköistä, että flunssa olisi esiintynyt samanaikaisesti koronavirusinfektion kanssa.
Kun havaitset bakteereja alemmissa hengitysteissä, metatranskriptitiedoista löytyi aktiivisesti läsnä olevia faageja. Tutkijat ehdottavat, että tämä voisi olla todiste siitä, että bakteerien mikrobiomin vaihtelut voivat tapahtua potilailla, joilla on vaikea COVID-19-infektio.
Muutoksia havaittiin vuonna Staphylococcus faagit, ja Mycoplasma salivarium oli aktiivisesti läsnä ilmanvaihtoa tarvitsevilla potilailla yli 28 ja kuolleilla potilailla verrattuna potilaisiin, joita tuuletettiin alle 28 päivää.
Potilaat, joiden kliiniset tulokset olivat huonot, ilmaisivat polkuja, jotka aktivoivat hajoamiseen liittyviä geenejä, kuljetus, sekä antimikrobisen resistenssin geenien ilmentäminen ja signalointi.
Tutkijat kirjoittavat:
"Nämä erot voivat viitata tärkeisiin toiminnallisiin eroihin, jotka johtavat erilaiseen aineenvaihduntaympäristöön alemmissa hengitysteissä, jotka voivat vaikuttaa isännän immuunivasteisiin. Se voi myös edustaa eroja mikrobipaineessa potilailla, joilla on suurempi viruskuormitus ja erilaiset tulehdusympäristöt."
Sirtuin- ja Ferroptosis-signalointireiteissä tapahtui myös korkeamman sääntelyn vakavimmin sairaita COVID-19-tapauksia. Tämä tapahtui samanaikaisesti inaktivoitujen immuunivasteominaisuuksien kanssa, mukaan lukien fagosyytit, neutrofiilit, granulosyytit, ja leukosyytit. Myös immunoglobuliinin ilmentymistasojen alenemista ja mitokondrioiden toimintahäiriöitä havaittiin.
Tietojen perusteella tiimi ehdottaa, että kriittisesti sairaiden potilaiden keuhkot, jotka tarvitsevat ilmanvaihtoa COVID-19-infektiosta, ilmaisevat epätasapainoisen tilan korotetun tulehduksen sijaan. Tämä näyttää ennustavan ennusteiden huononemista.
Lisäanalyysi havaitsi selviytymiseen liittyviä eroja interferonivasteissa. Tyypin I interferonin aktivointi oli ennustava tekijä kuolleisuuden lisääntymiselle.
"Vaikka tarvitaan lisää pitkittäistietoja interferonin signaloinnin roolin selvittämiseksi taudissa, Tässä esitetyt tiedot viittaavat siihen, että mikrobien ja isäntien allekirjoitusten yhdistäminen voisi auttaa ymmärtämään kriittisesti sairaiden COVID-19-potilaiden kuolleisuuden lisääntyneen riskin. "
medRxiv julkaisee alustavia tieteellisiä raportteja, joita ei ole vertaisarvioitu, ja siksi, ei pidä pitää ratkaisevana, ohjaa kliinistä käytäntöä/terveyteen liittyvää käyttäytymistä, tai käsitellään vakiintuneina tietoina.
Kotitalouksien desinfiointiaineet voivat edistää lasten lihavuuden riskiä
Kanadalaiset tutkijat ovat osoittaneet, että yleisesti käytetyt kotitalouksien puhdistusaineet voivat saada lapset ylipainoisiksi muuttamalla suoliston mikroflooraa. Sergei Mironov | Shutt
Ultravioletti B -valo on hyvä suoliston mikrobiomille
Pieni tutkimus julkaistu lehdessä Rajat immunologiassa lokakuuta 24, 2019, osoittaa, että altistuminen ultravioletti B (UVB) -valolle, joka yleensä saavutetaan auringonvalolla, voi aiheuttaa erityis
Uusi työkalu suoliston mikrobiomin tulkitsemiseen
Suolistossa olevilla miljoonilla bakteereilla on erittäin tärkeä rooli terveydelle ja sairauksille. Kuitenkin, Jatkuva ongelma on ollut ymmärryksen puute terveen ihmisen suolen mikrobiomin todellisest
