Leopoldo N. Segal és munkatársai azt sugallják, hogy a tüdő mikrobái előre jelezhetik a súlyos COVID -fertőzést és az antitestrezisztenciát.
"Ezek az adatok rávilágítanak arra, hogy a SARS-CoV-2 bősége az alsó légutakban a halálozás előrejelzője, és a gazdasejt transzkriptomájának jelentős hozzájárulása, amely tükrözi az alsó légúti sejtek fertőzésre adott válaszát, " - írták a kutatók.
Az eredmények segíthetnek azonosítani azokat a betegeket, akik a leginkább veszélyeztetettek a rossz klinikai eredmények miatt, és korai szakaszban alternatív kezelést nyújthatnak.
A "Mikrobiális aláírások a mechanikusan lélegeztetett COVID19 -es betegek alsó légútjaiban rossz klinikai eredményekkel járó tanulmány" előzetes nyomtatványként elérhető. medRxiv * szerver, míg a cikk szakértői értékelésen megy keresztül.
A COVID-19 fertőzésből szellőztetett betegektől gyűjtött alsó légúti mintákat az első hullám során New Yorkban. Légúti mintákat gyűjtöttek 142 COVID-19 fertőzött betegtől.
A metagenomika segítségével, a kutatók a tüdő mikrobiómájában élő mikrobákat a betegek klinikai eredményeivel kötötték össze.
Az eredmények azt mutatták, hogy nagy mennyiségű Mycoplasma salivarium magasabb SARS-CoV-2 vírusterheléssel járt. Továbbá, korlátozott immunglobulin válasz az alsó légutakban korrelált a megnövekedett halálozási kockázattal.
"Az itt bemutatott adatok közvetlen kvantitatív módszerek (RT-PCR) és félkvantitatív, nem célzott megközelítés (metatranscriptome szekvenálás) használatával alátámasztják azt a hipotézist, hogy a SARS-CoV-2 vírusterhelés az alsó légutakban kritikus szerepet játszik a klinikai progresszióban súlyosan beteg COVID-19 betegek, " - írták a kutatók.
Míg a legtöbb beteg széles spektrumú antibiotikumokat és gombaellenes szereket kapott, nem volt bizonyíték a bakteriális fertőzés együttes fertőzésének súlyosbodó hatásaira, vírusos, és a gombák légúti kórokozói.
A COVID-19 fertőzés okozta halálozás kockázatának vizsgálata érdekében, a csapat 589 beteg laboratóriumi kultúráját elemezte súlyos COVID-19 fertőzés miatt.
Az eredmények azt mutatták, hogy a rossz klinikai kimenetelű betegek nem vetették alá magukat más légúti fertőzéseknek. Szintén nem volt kapcsolat a pozitív mikrobák tenyésztése és a súlyos COVID-19 fertőzések halálozása között.
A kultúrapozitivitás és a klinikai eredmény közötti összefüggések. Az esélyhányadosok és a megfelelő 95% -os megbízhatósági intervallumok a kultúrpozitivitás arányára vonatkozóan a teljes csoportban (n =589) a kórházi kezelés alatt (balra) és a kórházi kezelés első 2 hetében (jobbra).Túl a mikrobákon, az alsó légutakban magas volt a SARS-CoV-2 jelenléte, ami a halállal társult. A betegek egy kis mintája influenza A vagy B vírussal rendelkezett, valószínűtlen, hogy az influenza a koronavírus -fertőzéssel egyidejűleg jelentkezett.
Amikor baktériumokat figyel az alsó légutakban, metatranskriptómiai adatok szerint a fágok aktívan jelen vannak. A kutatók azt sugallják, hogy ez bizonyíték lehet arra, hogy a bakteriális mikrobiomban változások történhetnek súlyos COVID-19 fertőzésben szenvedő betegeknél.
Változásokat figyeltek meg ben Staphylococcus fágok, és Mycoplasma salivarium aktívan jelen volt a lélegeztetést igénylő betegeknél több mint 28 -nál, és azoknál a betegeknél, akik meghaltak a 28 napnál rövidebb ideig lélegeztetett betegekhez képest.
A rossz klinikai kimenetelű betegek olyan utakat fejeztek ki, amelyek aktiválták a degradációval kapcsolatos géneket, szállítás, valamint az antimikrobiális rezisztencia gének kifejezése és a jelátvitel.
A kutatók ezt írják:
"Ezek a különbségek fontos funkcionális különbségeket jelezhetnek, amelyek eltérő metabolikus környezethez vezetnek az alsó légutakban, és amelyek befolyásolhatják a gazdaszervezet immunválaszát. Ez is reprezentálhatja a magasabb vírusterhelésű és különböző gyulladásos környezetben szenvedő betegek mikrobiális nyomásának különbségeit."
A Sirtuin és a Ferroptosis jelátviteli utakon is volt szabályozás a legsúlyosabban beteg COVID-19 esetekben. Ez egybeesett az inaktivált immunválasz jellemzőivel, beleértve a fagocitákat, neutrofilek, granulociták, és leukociták. Az immunglobulin expressziós szintjének lecsökkenését és a mitokondriális diszfunkciót is megfigyelték.
Az adatok alapján, a csapat azt javasolja, hogy a kritikusan beteg betegek tüdeje, amely szellőzést igényel a COVID-19 fertőzés miatt, kiegyensúlyozatlan állapotot fejez ki, nem pedig fokozott gyulladást. Úgy tűnik, hogy ez előre jelzi a rosszabb prognózisokat.
További elemzések az interferon válaszokban a túléléssel összefüggő különbségeket találtak. Az I. típusú interferon aktiválása prediktív tényező volt a megnövekedett mortalitás szempontjából.
"Bár további longitudinális adatokra lesz szükség az interferon jelátvitel betegségben betöltött szerepének tisztázásához, az itt bemutatott adatok azt sugallják, hogy a mikrobiális és a gazdaszervezet aláírásának kombinálása segíthet megérteni a súlyos halálozási kockázatot a kritikusan beteg COVID-19 betegekben. "
medRxiv előzetes tudományos jelentéseket tesz közzé, amelyeket nem vizsgálnak felül, és ezért, nem tekinthető döntőnek, irányítja a klinikai gyakorlatot/az egészséggel kapcsolatos viselkedést, vagy megállapított információként kezelik.