Micróbios podem predizer resultados fatais em pacientes ventilados com COVID-19

A presença de Mycoplasma salivarium nas vias aéreas inferiores de pacientes ventilados com infecção por COVID-19 está associada a maior probabilidade de morrer. O resultado foi parte de uma investigação molecular que analisou como os microambientes das vias aéreas afetavam a síndrome respiratória aguda grave (SARS-CoV-2).

p Leopoldo N. Segal e colegas sugerem que os micróbios pulmonares podem ser preditivos de infecção COVID grave e resistência a anticorpos.

p "Esses dados destacam a importância da abundância de SARS-CoV-2 nas vias aéreas inferiores como um preditor de mortalidade, e a contribuição significativa do transcriptoma da célula hospedeira, que reflete a resposta das células das vias aéreas inferiores à infecção, "escreveram os pesquisadores.

p As descobertas podem ajudar a identificar os pacientes com maior risco de desfechos clínicos ruins e fornecer tratamentos alternativos desde o início.

p O estudo "Assinaturas microbianas nas vias aéreas inferiores de pacientes com COVID19 ventilados mecanicamente associadas a resultados clínicos insatisfatórios" está disponível como uma pré-impressão no medRxiv * servidor, enquanto o artigo é submetido à revisão por pares.

Classificação de assinaturas microbianas

p As amostras coletadas das vias aéreas inferiores de pacientes em ventilação devido à infecção por COVID-19 durante a primeira onda na cidade de Nova York. Eles coletaram amostras das vias aéreas de 142 pacientes com infecção por COVID-19.

Mycoplasma salivarium nas vias respiratórias está ligada a resultados clínicos piores

p Usando metagenômica, os pesquisadores relacionaram os micróbios que vivem no microbioma pulmonar com os resultados clínicos dos pacientes.

p Os resultados mostraram que ter grandes quantidades de Mycoplasma salivarium foi associado a uma carga viral mais elevada de SARS-CoV-2. Além disso, uma resposta limitada de imunoglobulina nas vias aéreas inferiores correlacionada com aumento do risco de mortalidade.

p "Os dados apresentados aqui através do uso de métodos quantitativos diretos (RT-PCR) e uma abordagem semiquantitativa não direcionada (sequenciamento do metatranscriptoma) apóiam a hipótese de que a carga viral da SARS-CoV-2 nas vias aéreas inferiores desempenha um papel crítico na progressão clínica de pacientes com COVID-19 gravemente enfermos, "escreveram os pesquisadores.

Nenhuma evidência de resultados clínicos piores da coinfecção com patógenos respiratórios

p Enquanto a maioria dos pacientes recebeu antibióticos e antifúngicos de amplo espectro, não houve evidência de agravamento dos efeitos da coinfecção com bactérias, viral, e patógenos respiratórios de fungos.

p Para examinar o risco de mortalidade por infecção por COVID-19, a equipe analisou culturas de laboratório de 589 pacientes hospitalizados por insuficiência respiratória de infecção COVID-19 grave.

p Os resultados mostraram que os pacientes com resultados clínicos ruins não sucumbiram a outras infecções respiratórias. Também não houve ligação entre culturas microbianas positivas e mortalidade em infecções graves por COVID-19.

Associações entre positividade da cultura e evolução clínica. Odds ratios e respectivos intervalos de confiança de 95% para as taxas de positividade da cultura para toda a coorte (n =589) durante a duração da hospitalização (esquerda) e durante as primeiras 2 semanas de hospitalização (direita).

Alterações bacterianas observadas em pacientes ventilados por mais de 28 dias

p Olhando além dos micróbios, as vias aéreas inferiores mostraram uma alta presença de SARS-CoV-2, que estava associado à morte. Uma pequena amostra de pacientes tinha vírus influenza A ou B, sugerindo que é improvável que a gripe tenha ocorrido simultaneamente com a infecção por coronavírus.

p Ao observar bactérias nas vias aéreas inferiores, dados de metatranscriptoma encontrados fagos ativamente presentes. Os pesquisadores sugerem que isso pode ser uma evidência de que alterações no microbioma bacteriano podem estar acontecendo em pacientes com infecção grave por COVID-19.

p Mudanças foram observadas em Estafilococo fagos, e Mycoplasma salivarium estava ativamente presente em pacientes que precisavam de ventilação por mais de 28 dias e em pacientes que morreram em comparação com pacientes que foram ventilados por menos de 28 dias.

Impacto microbiano na resposta imunológica

p Pacientes com resultados clínicos ruins expressaram caminhos que ativaram genes relacionados à degradação, transporte, bem como expressar genes de resistência antimicrobiana e sinalização.

p Os pesquisadores escrevem:

p "Essas diferenças podem indicar diferenças funcionais importantes que levam a um ambiente metabólico diferente nas vias aéreas inferiores que podem impactar as respostas imunes do hospedeiro. Também pode ser representativo das diferenças na pressão microbiana em pacientes com cargas virais mais altas e diferentes ambientes inflamatórios."

p Houve também uma regulação positiva nas vias de sinalização da Sirtuína e da Ferroptose nos casos de COVID-19 mais gravemente enfermos. Isso coincidiu com recursos de resposta imune inativados, incluindo fagócitos, neutrófilos, granulócitos, e leucócitos. Uma regulação negativa dos níveis de expressão de imunoglobulinas e disfunção mitocondrial também foram observados.

p Com base nos dados, a equipe sugere que os pulmões de pacientes criticamente enfermos que requerem ventilação devido à infecção por COVID-19 expressam um estado de desequilíbrio em vez de inflamação elevada. Fazer isso parece ser preditivo de piora do prognóstico.

p Uma análise posterior encontrou diferenças associadas à sobrevivência nas respostas do interferon. A ativação do interferon tipo I foi um fator preditivo para aumento da mortalidade.

p "Embora mais dados longitudinais sejam necessários para esclarecer o papel da sinalização do interferon na doença, os dados apresentados aqui sugerem que a combinação de assinaturas microbianas e do hospedeiro pode ajudar a compreender o aumento do risco de mortalidade em pacientes com COVID-19 em estado crítico. "

* Notícia importante

p medRxiv publica relatórios científicos preliminares que não são revisados ​​por pares e, Portanto, não deve ser considerado conclusivo, orientar a prática clínica / comportamento relacionado à saúde, ou tratadas como informações estabelecidas.

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