Leopoldo N. Segal en collega's suggereren dat longmicroben voorspellend kunnen zijn voor ernstige COVID-infectie en antilichaamresistentie.
"Deze gegevens benadrukken het belang van de overvloed aan SARS-CoV-2 in de lagere luchtwegen als voorspeller voor mortaliteit, en de significante bijdrage van het gastheerceltranscriptoom, die de reactie van de lagere luchtwegcellen op infectie weerspiegelt, ’, schreven de onderzoekers.
De bevindingen kunnen helpen bij het identificeren van patiënten die het meeste risico lopen op slechte klinische resultaten en in een vroeg stadium alternatieve behandelingen bieden.
De studie "Microbial signatures in the lower airways of mechanisch geventileerde COVID19-patiënten geassocieerd met een slecht klinisch resultaat" is beschikbaar als preprint op de medRxiv * server, terwijl het artikel peer review ondergaat.
De verzamelde monsters van de onderste luchtwegen van patiënten op beademing van COVID-19-infectie tijdens de eerste golf in New York City. Ze verzamelden luchtwegmonsters van 142 patiënten met een COVID-19-infectie.
Met behulp van metagenomica, de onderzoekers koppelden de microben die in het longmicrobioom leven aan de klinische resultaten van patiënten.
De resultaten toonden aan dat het hebben van grote hoeveelheden Mycoplasma speeksel werd geassocieerd met een hogere virale belasting van SARS-CoV-2. In aanvulling, een beperkte immunoglobulinerespons in de lagere luchtwegen correleerde met een verhoogd sterfterisico.
"De gegevens die hier worden gepresenteerd door het gebruik van directe kwantitatieve methoden (RT-PCR) en een semi-kwantitatieve niet-gerichte benadering (metatranscriptoomsequencing) ondersteunen de hypothese dat de SARS-CoV-2-virale belasting in de lagere luchtwegen een cruciale rol speelt in de klinische progressie van ernstig zieke COVID-19-patiënten, ’, schreven de onderzoekers.
Terwijl de meeste patiënten breedspectrumantibiotica en antischimmelmiddelen kregen, er was geen bewijs van verergerende effecten van co-infectie met bacteriële, viraal, en schimmels respiratoire pathogenen.
Om te kijken naar het risico op sterfte door COVID-19-infectie, het team analyseerde laboratoriumculturen van 589 patiënten die in het ziekenhuis waren opgenomen vanwege respiratoire insufficiëntie door een ernstige COVID-19-infectie.
De resultaten toonden aan dat patiënten met slechte klinische resultaten niet bezweken aan andere luchtweginfecties. Er was ook geen verband tussen positieve microbiële culturen en sterfte bij ernstige COVID-19-infecties.
Associaties tussen cultuurpositiviteit en klinische uitkomst. Odds ratio's en bijbehorende 95%-betrouwbaarheidsintervallen voor kweekpositiviteit voor het hele cohort (n=589) tijdens de duur van hun ziekenhuisopname (links) en tijdens de eerste 2 weken van ziekenhuisopname (rechts). Verder kijken dan microben, de lagere luchtwegen vertoonden een hoge aanwezigheid van SARS-CoV-2, die met de dood in verband werd gebracht. Een kleine steekproef van patiënten had influenza A- of B-virussen, wat suggereert dat het onwaarschijnlijk is dat de griep gelijktijdig met een coronavirusinfectie plaatsvond.
Bij het observeren van bacteriën in de lagere luchtwegen, metatranscriptoomgegevens vonden dat fagen actief aanwezig waren. De onderzoekers suggereren dat dit een bewijs zou kunnen zijn dat er veranderingen in het bacteriële microbioom kunnen optreden bij patiënten met een ernstige COVID-19-infectie.
Veranderingen werden waargenomen in Stafylokokken fagen, en Mycoplasma speeksel was actief aanwezig bij patiënten die meer dan 28 dagen beademd moesten worden en patiënten die stierven in vergelijking met patiënten die minder dan 28 dagen werden beademd.
Patiënten met slechte klinische resultaten vertoonden routes die genen activeerden die verband houden met afbraak, vervoer, evenals het tot expressie brengen van antimicrobiële resistentiegenen en signalering.
De onderzoekers schrijven:
"Deze verschillen kunnen wijzen op belangrijke functionele verschillen die leiden tot een andere metabole omgeving in de lagere luchtwegen die de immuunresponsen van de gastheer kunnen beïnvloeden. Het kan ook representatief zijn voor verschillen in microbiële druk bij patiënten met hogere virale lasten en verschillende inflammatoire omgevingen."
Er was ook een opregulatie in de Sirtuin- en Ferroptosis-signaalroutes in de meest ernstig zieke gevallen van COVID-19. Dit viel samen met geïnactiveerde immuunresponskenmerken, inclusief fagocyten, neutrofielen, granulocyten, en leukocyten. Een neerwaartse regulatie van immunoglobuline-expressieniveaus en mitochondriale disfunctie werden ook waargenomen.
Op basis van de gegevens, het team suggereert dat de longen van ernstig zieke patiënten die beademing nodig hebben vanwege een COVID-19-infectie, een onevenwichtige toestand uitdrukken in plaats van een verhoogde ontsteking. Dit lijkt voorspellend te zijn voor verslechterende prognoses.
Verdere analyse vond overlevingsgerelateerde verschillen in interferonresponsen. Activering van type I interferon was een voorspellende factor voor verhoogde mortaliteit.
"Hoewel verdere longitudinale gegevens nodig zullen zijn om de rol van interferonsignalering op de ziekte te verduidelijken, de hier gepresenteerde gegevens suggereren dat het combineren van microbiële en gastheersignaturen zou kunnen helpen het verhoogde risico op sterfte bij ernstig zieke COVID-19-patiënten te begrijpen."
medRxiv publiceert voorlopige wetenschappelijke rapporten die niet peer-reviewed zijn en, daarom, mag niet als definitief worden beschouwd, begeleiden klinische praktijk/gezondheidsgerelateerd gedrag, of behandeld als gevestigde informatie.
Perfectus Biomed exposeert op IPS-conferentie in Liverpool
Nieuwe studie kan dodelijke infecties bij baby's helpen voorkomen
Microbioom kan helpen bij het identificeren van pre-kankerrisico bij vrouwen met HPV
Zijn op DNA gebaseerde diëten en gepersonaliseerde medische voeding de toekomst voor gewichtsverlies?
Onderzoek koppelt SARS-CoV-2-prevalentie,
Waterstofademhaling komt niet van Bikini-atol
Veelvoorkomende genetische variant verklaart waarom immunotherapie vaak faalt bij de ziekte van Crohn
De reden waarom een veelgebruikte reeks geneesmiddelen niet effectief is bij sommige patiënten met de ziekte van Crohn, is tot nu toe niet vastgesteld. Echter, een samenwerking tussen de Universitei
Visslijm kan een potentiële bron van antibiotica zijn, blijkt uit onderzoek
Met de komst van multiresistente bacteriën en het gebrek aan nieuwe antibiotica, onderzoekers zijn op zoek geweest naar nieuwe moleculen die deze ziekteverwekkers kunnen bestrijden. Een team van onder
Veranderingen in de darmbacteriën beïnvloeden de resultaten van de lupusbehandeling tijdens de zwangerschap
Het verloop van de zwangerschap, zoals die van ware liefde, loopt niet altijd soepel als je lupus hebt, terecht systemische lupus erythematosus (SLE) genoemd. Deze auto-immuunziekte is een soms geweld