Am Mäerz 2012, Fëscher an enger Fjord vun Northern Fonctionnementskäschten Norwegen gemellt Atlantik Bacalhau opfälleg, e gebiertege Fësch eng ekonomesch wichteg Marine Fëscherei an dëser Regioun, mat ongewéinlech Kaz an hir Mamm grënnen. Et gouf spekuléiert, datt dës Atlantik Saumon ginn hätt, déi bei dëser Zäit vum Joer an de Séien Zon net typesch Kaz fir Bacalhau ass. Dës Observatioune goufen dowéinst op d'norwegesche Direktioun vun fënnt Rapport als presuméiert Gespréich tëscht enger lokal Fësch Bauerenhaff an dëser kommerziell Fëscherei. Statistique Analysë vun genetesch Donnéeën aus 17 microsatellite lues genotyped op 36 deelweis-deforméiert Kaz Echantillon vun Saumon vun engem lokal Fësch Bauerenhaff, an Echantillon vun den nooste wëll Populatioun erlaabt dësen Conclusioune: 1. D'Kaz Atlantik Saumon waren, 2. Dës Saumon net aus der lokal wëll Populatioun stamen, an 3. d'lokal Bauerenhaff war déi probabel Quell vun dësen Kaz. Weider Tester bewisen, datt 21 vun de 36 Kaz sech mat piscine reovirus infizéiert. Iwwerdeems d'Potential Lien tëscht piscine reovirus an d'Krankheet Häerz a Vullen Muskel inflammation nach ënner wëssenschaftlech Debatt ass, déi dës Krankheet veruerteelt vun grousser Zuel vun Saumon vun der Bauerenhaff an de Mount virun de Observatioune d'Fëscher verursaacht. Dës Analyse déi nei Abléck an Interaktiounen tëschent domestizéiert a Wëllschwäin Fësch VerfÜgung
Fro:. Glover KA, Sørvik AGE, Karlsbakk E, Zhang Z, Skaala O (2013) cuisine genetesch Analys vun Mo. Inhalt verréid Wild Atlantik Cod Verfiddere op Piscine Reovirus (PRV) Krankheet Atlantik Salmon ursprünglech aus engem Commercial Fish Farm. PLoS NËMMEN 8 (4): e60924. Doi: 10.1371 /journal.pone.0060924 VerfÜgung
Redakter: Martin Krkosek, Universitéit vun Toronto, Kanada VerfÜgung
Arnaque: 3 Oktober 2012; Akzeptéiert: 4 Mäerz 2013; Publizéiert: April 19, 2013 VerfÜgung
Copyright: © 2013 Glover et al. Dëst ass eng oppen-Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der Lizenz BY Creative Commons verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt d'Original Auteur an d'Quell Kaiser sinn VerfÜgung
Funding:. Dës Etude war vun der norwegesche Chiffer vun fënnt finanzéiert. D'funders hu keng Roll am Etude Design, Daten Kollektioun an Analyse, Décisioun, oder Virbereedung vun der mëttelalterlech Handschrëft ze publizéieren VerfÜgung
Wettsträit Interessen:.. D'Auteuren hunn deklaréiert, datt keng Competitioun Interessen existéieren VerfÜgung
eng vun den Tip ökologeschen Erausfuerderunge verbonne mat der kommerziellen Kultur vum Atlantik Saumon ( Salmo salar VerfÜgung L.) zu Marine net Stëfter ass well. An Norwegen, wou Statistike fir d'Zuel vun gemellt escapees vum norwegesche Direktioun vun fënnt opgeholl ginn (NDF), den alljährlechen Zuelen vun escapees huet fir déi meescht Joer am honnertdausende schonn zu der Zäit 2000-2011 [1]. Allerdéngs huet de richtege Chiffer Zuel vun escapees am Millioune wéinst underreporting gin gouf geschat [2]. Geziicht escapees kann laang Distanzen disperse iwwer [3], [4], kann gitt Flëss [5], an enger Rei vun ekologesch Ecran kënnt [6] a genetesch Interaktioune [7] - [12] mat Wëld conspecifics. Soumat ass et allgemeng ugeholl, datt geziicht escapees eng potentiell Gefor fir d'Integritéit vun déem Populatiounsschichte vertrieden. VerfÜgung D'Applikatioun vun molekulare-genetesch Methode fir Aklang Conservatioun an Fëschereipolitik Gestioun Zwecker, dorënner PDSA Fäll fir Rechtsapparat a Regulatioun ass Ausbau [13]. Typesch Aklang PDSA Uwendungen Gamme vun Déierenarten identifications fir morphologically identlfizéiert Stoffer an Echantillonen, fir Bevëlkerung vun Urspronk identifications fir Privatpersounen verdächtegt fir aus Plaze geholl goufen wou Recolte reglementéiert ass oder illegal [14], oder souguer Bunga hat [15]. Analyse vun Mo. an faeces Inhalt vun Feinde huet och extensiv gehaal ginn, an Identifikatioun vun Kaz heizou um Arten gëtt [16] -. [20], Famill [21], a souguer eenzel Prouf Niveau [22] VerfÜgung d'NDF gi fir d'Entwécklung an Ëmsetzung vun aquaculture Regulatioun vun Norwegen responsabel. Iwwerdeems escapement vun Fësch aus kommerziell aquaculture Installatiounen net illegal an Norwegen ass, sinn Baueren legal zu Rapport escapement aus hirem Häff gebonnen. Trotz dëser, stellt underreporting eng grouss vun der NDF konfrontéiert Erausfuerderung. An enger Äntwert op dës Situatioun, déi genetesch Methode fir d'Identifikatioun vun escapees zréck ze hire Bauerenhaff vun Urspronk gegrënnt gouf an schéinen Stroffen fir an rou Reglementer fonnt Betriber [23], [24]. VerfÜgung Am Mäerz 2012 , lokal Fëscher an enger Fjord an Norwegen Fonctionnementskäschten gemellt Atlantik Bacalhau ( Gadus morhua VerfÜgung L.) Prisonnéier, déi eng wichteg kommerziell Fëscherei an dëser Regioun Formen, mat ongewéinlech Kaz Fësch an hir Mamm. Déi meescht vun dëse Kaz dass ongeféier 30-35 cm laang waren, waren deelweis oder staark deforméiert, a sou wéi et war eng Erausfuerderung all vun hinnen morphologically z'identifizéieren (Figebam. 1). Trotzdem, si huet Wanterschlof net wéi Herring ( Clupea harengus VerfÜgung L.) oder kleng gadoid Aarten déi e wichtege Bestanddeel vun der an dëser Regioun Nahrung d'Bacalhau Form [25], [26], an et gouf vun e puer spekuléieren Fëscher datt dës konnt Atlantik Saumon ginn. Iwwerdeems Atlantik Bacalhau bekannt gewiescht Atlantik Saumon smolts op Migratioun aus frëscht an estuarine an Séifaart Ëmwelt [27], [28], bannent e puer Woche vun Gaang der Séifaart Ëmwelt an de spéide Fréijoer an fréie Summer zu schléckt, smolts hunn Fjord typesch lénks Beräicher a Richtung oceanic erofzesetzen weinst opgeholl. Well esou, Bacalhau wëll Saumon vun der observéiert Gréisst an Zäit vun engem Joer op dëser Plaz war ingesting vun der lokal Fëscher ongewéinlech geduecht, an der Situatioun Rapport also zu der NDF als presuméiert Gespréich tëscht enger lokal Saumon Bauerenhaff an dëser kommerziell Fëscherei. Hei, mir d'Analyse vun der Kaz fir Rapport folgend Froen un d'Adress: 1. Wat Arten dës Kaz sinn, 2. Wann se gesprongen sinn, ass et méiglech hinnen als Wëld ze identifizéieren oder geziicht (dh, ass dëst eng rare natierlech Phänomener oder ass et e Mënsch entschlof), an 3. Wann se geziicht Atlantik gesprongen sinn, si vun enger lokal Bauerenhaff stamen gemaach? VerfÜgung Archipel Approche VerfÜgung déi heiteg Etude konzipéiert déi dräi Froen zu der Aféierung presentéiert zu Adress. Diagnostice lues fir Identifikatioun vun dësem deforméiert Atlantik Saumon an Reeboufrell ( Oncorhynchus mykiss VerfÜgung) Stoffer goufen kuerzem entwéckelt [29]. Allerdéngs war den éischte Versuch vun Identifikatioun vun der Kaz mat héich polymorphic microsatellite lues gehaal Toast am Atlantik Saumon Populatioun Genetik Projeten ëmgesat. Déi dofir fir dës huet zwou-fantastesch. Éischt, fir Froen 2 an 3, eng allele-Frequenz Profil an Äntwert géif fir jiddereng vun der Kaz an Uerdnung gin waren géint d'allele Frequenz Profiler vun geziicht a Wëllschwäin Saumon vun der Regioun ze markéieren. Zweet, eng Kombinatioun vun denen leschten Erfahrungen mat dëse microsatellite lues op deelweis deforméiert Echantillonen, zesumme mat Inspektioun vun der Kaz ugeholl, datt wann se jo Atlantik Saumon waren, et méiglech kann erfollegräich mat dëse microsatellites d'Echantillonen zu genotype. VerfÜgung Echantillon VerfÜgung Dës Etude an engem Fjord an Norwegen wellkomm baséiert. Fir legal Grënn, an dëser Etude der geneeër Plaze vun der Bacalhau ageholl, an déi lokal Fësch Bauerenhaff aus deem Echantillon waren, anonym bleiwen. Ënnert der Opsiicht vun der NDF, aus Bacalhau Mamm vun lokal Fëscher (1-3 Kaz pro Bacalhau Mo, all Bacalhau Arc an der Period Mäerz bis Abrëll 2012) flächeméisseg Ganzen 36 Kaz waren. Dës Bacalhau sech als Deel vun enger kommerziell Recolte ageholl an sech dout op hir Mamm anerer ginn. Soumat huet keng spezifesch Genehmegungen verlaangt de Bacalhau Mamm vun dëser Etude fir probéieren. Béid Norden Osten Arktis Bacalhau (NEAC) an norwegesche betreffend Bacalhau (NCC) bekannt sinn op dëser Zäit vum Joer an dëser Regioun d'Grondlag vun dëser kommerziell Fëscherei ze Form. keen Echantillon vun nach Daten Allerdéngs goufen aus dëse Bacalhau opgeholl an als esou ass et net méiglech dës Fësch vun entweder Typ vir. VerfÜgung All Bacalhau sech op ee vun de sechs Plazen an der direkter Ëmgéigend vun der nëmmen Fësch Arc Bauerenhaff an der Regioun Saumon phpNuke zu Gréisst mat der Kaz mat, oder bis zu engem Maximum vun 20 km weider am Fjord. Nieft der Kaz 36 an Bacalhau Mamm ageholl, eng eenzeg Saumon Post smolt, an d'Iwwerwaachung net direkt an dëser Regioun nieft der nëmmen Saumon Bauerenhaff wellkomm Arc, war anerer (dëst eenzelne Fësch ass verdéngt bezeechent als "de escapee" a war gläicht d'Kaz am Gréisst). Vun all dësen Echantillonen, zwee Otemschwieregkeeten Echantillon pro eenzelne sech fir spéider genetesch Analyse geholl. VerfÜgung Echantillon vun Saumon vun der nëmmen Bauerenhaff zu dësem Fjord datt Fësch phpNuke zu Gréisst mat der Kaz enthale sech och gesammelt. Dës Fësch waren déi Leit bei der NDF ugestallten anerer. Nee spezifesch iwwereg waren néideg dës Fësch ze Echantillonen, obwuel de Fësch Bauer Zougank zu hire Bauerenhaff huet. Déi nooste alternative Bauerenhaff virgesinn Fësch phpNuke zu Gréisst mat der Kaz ass iwwer 100 km läit ewech (120 km ewech fir déi wäit Zoustand vun de Bacalhau) an net als wahrscheinlech Quell gesinn, an dofir net anerer. Vun der lokal Bauerenhaff, am Ganzen dräi Echantillonen, all aus ronn 47 Fësch, sech aus dräi separat Käfeg geholl. Dëst representéiert der dräi genetesch Gruppe vu Fësch op der Bauerenhaff, an ass mat der probéieren Protokoll konsequent eng genetesch baseline fir Identifikatioun vun escapees zréck ze hire Bauerenhaff vun Urspronk fir mise [23], [24]. VerfÜgung A Prouf vun wëll Atlantik Saumon, ursprünglech aus der noosten Floss an an der direkter Ëmgéigend un, wou de Bacalhau mat Kaz an hir Mamm ageholl huet sech och an dëser Etude mat abegraff. Dat wëll Saumon Prouf Arc vun 101 Erwuessener bestoung vun der Saison vun 2007 an der Baach angling an 2008. Well dës Fësch ageholl huet an dono fir Konsum vun Sport Fëscher ëmbruecht, keng Genehmegungen fir spazeieren Skala Echantillon aus dëse dout Fësch goufen néideg. Genau Status op der Bauerenhaff VerfÜgung Heart a Vullen Muskel inflammation (HSMI) ass eng ustiechend Krankheet [30] déi grousss inflammation an multifocal necrosis vun myocytes am Häerz a rout musculature charakteriséiert [31]. E Roman Virus, piscine reovirus (PRV) huet viru kuerzem zu Fësch mat HSMI nogewise ginn. Dëse Virus ass mat der Krankheet assoziéiert, weist nik Haren opbauen an diseased Fësch, an as potenziell responsabel fir d'Krankheet [32], [33]. Allerdéngs sinn PRV Aids an geziicht Saumon an Norwegen gemeinsam, an huet och an gesond Fësch dorënner wëll Saumon [34] dokumentéiert ginn. Dofir, bleift d'Roll vun PRV zu HMSI ënner Debatt [34]. VerfÜgung An der Period Januar bis Februar 2012 (dh, e puer Woche virun der Entdeckung vun Saumon-wëll Kaz vun der Mamm vun wëll Bacalhau) déi lokal Bauerenhaff, gemellt Perte vun ongeféier 55000 Fësch (Donnéeën aus NDF Bauerenhaff Biomass umellen). D'causative Krankheet gouf als HMSI am Februar 2012 war baséiert op Medeziner Analysë vun Fësch aus der Zuucht vun engem lokal veterinary Offizéier, Dëst Diagnos festgestallte a gouf duerch den norwegesche Veterinary Institut benotzt histopathology (also, d'Presenz oder Feele vun PRV confirméiert zu dësen diseased Fësch ass onbekannt). VerfÜgung duerch den Hannergrond Informatiounen iwwert d'Krankheet Status op der Bauerenhaff Echantillon vun der Kaz an Bacalhau Mamm ageholl, an der eenzeger escapee, sech fir d'Präsenz vun PRV analyséiert. Dëst gouf op der Basis datt PRV presentéieren an d'Kaz gin hätt an der escapee wann se aus der Bauerenhaff entstanen wou HMSI veruerteelt ëmmer haten. PRV ass och präsent an Wëllschwäin norwegesche Saumon (och am Fësch HMSI net hunn), dato op engem nidderegen Frequenz wéi zu geziicht Flucht Saumon (13.4% vs. 55,2% prevalence bzw.) [34]. Während dëser Virus typesch zu Häerz oder Chef-Nier Echantillon Kloeren ass, wéinst der deforméiert Staat vun der Kaz, waren nëmmen Fleesch Echantillon fir dësen Test sinn. Analysen goufen vun engem Real Time Hinnen alleguer Analyse Firma gehaal, PatoGen legitim AS, uner- no international Norm ISO 17025. De Echantillon waren fir PRV RNS um PatoGen am Aklang mat hirer zu-Haus Methode fir Real Time Hinnen alleguer mat enger assay analyséiert ( "PRV -ST ') de L3 Gentherapie gezielt, Nepgen virdrun [32]. De Message vun der vir an ëmgedréint primers fir dës assay sinn 5'-TCAACCACCTCCACACAAAAGA-3 'an 5'-AACGAGTTGTGCGTGTGCC-3 "ofginn, an de Studiebäihëllefe VIC-5'-TTGGGATGTCGACGTTCT-3". D'Norm rop baséiert op sech dilutions zu triplicates eng Schréiegt vun -3.25 (R cuisine genetesch Analyse VerfÜgung DNA Extraktioun war am 96-gutt Format eng kommerziell sinn Kit (; Ray Kit QIAGEN DNeasy®96 Blood &) benotzt gehaal. All 96-gutt zappen dorënner zwee eidel Wells als negativ kontrolléiert. Iddi genotyping Kontroll spillt e Liewesniveau Roll an genotyping am Labo bei IMR [35], [36]. Sou, jiddereng vun den eenzelne Kaz an der escapee sech zweemol isoléiert genotyping Konstanz ze kontrolléieren. DNA Quantitéit a Qualitéit war net gemooss. VerfÜgung All Echantillon mat engem Set vu 18 microsatellites zu genotyping Thema waren dat fir Atlantik Saumon Genetik Projeten am Labo benotzt ginn. Dës loci sech zu dräi multiplexes Implikatioune verstärkt, benotzt Standard Ëmwelt- fir frësch Stoffer (voll genotyping Konditiounen sinn aus Auteuren op Ufro); SSsp3016 VerfÜgung (Genbank keen. AY372820), SSsp2210 VerfÜgung, SSspG7 VerfÜgung, SSsp2201 VerfÜgung, SSsp1605 VerfÜgung, SSsp2216 VerfÜgung [37], Ssa197 VerfÜgung, Ssa171 VerfÜgung, Ssa202 VerfÜgung [38], SsaD157 VerfÜgung, SsaD486 VerfÜgung, SsaD144 VerfÜgung [39], Ssa289 VerfÜgung, Ssa14 VerfÜgung [40], SsaF43 VerfÜgung [41], SsaOsl85 VerfÜgung [42 ], MHC ech VerfÜgung [43] an MHC II VerfÜgung [44]. Hinnen alleguer Produiten sech op eng Abi 3730 genetesch Analyser analyséiert a Gréisst vun engem 500LIZ ™ Gréisst-Norm. D'Matière Donnéeën war manuell zweemol ier exportéieren fir statistesch Analyse kontrolléiert haten. Nee genotyping hei waren ënnert deenen s-analyséiert Echantillon observéiert. VerfÜgung statistique Analyse VerfÜgung Wann war eng DNA Profil fir déi eenzel Kaz, déi eenzeg escapee, déi lokal Bauerenhaff an Wëllschwäin Saumon vun engem Erfolleg etabléierten Bevëlkerung an der Regioun, e puer statistesch Tester, ëmgesat Toast an Etuden Genetik Bevëlkerung, sech op dës Donnéeën gehaal. Dat war fir virun allem dräi Froen zu der Aféierung zougemaach zu Adress. Fir dës Tester, war den eenzegen escapee mat der Kaz Fësch op Pilot Analys baséiert hinzeginn dokumentéiert et fir d'Kaz (cf. Resultater) genetesch ganz ähnlech ze ginn. Sou, fir dësen Analyse, och der Kaz Prouf eenzecht escapee abegraff. VerfÜgung Éischt, goufen d'Donnéeën an eng Bevëlkerung Genetik Programm arrangéiert (MSA) [45], dee benotzt gouf e Sortiment vu Resumé Statistike fir auszerechnen, an Infor- Fichieren fir aner Programmer. Doropshin huet sech d'Donnéeën an Genepop V3.3 analyséiert [46] Gentherapie diversities, Hardy Weinberg Gläichgewiicht, an linkage disequilibrium tëscht Puer loci bannent Echantillon fir auszerechnen. De Kallek genau Test (demorization 10 000; 100 Terrainen; 5000 Ben) war fir statistesch Bedeitung fir Test ëmgesat. De Programm LDNE [47] Den benotzt innepolitesch Populatioun Gréisst ( Ne VerfÜgung) fir jiddereng vun den Echantillon fir auszerechnen. Dëse Programm benotzt een-Prouf Approche zu estimating Ne VerfÜgung op d'Mooss vun LD bannent enger Prouf observéiert baséiert. VerfÜgung genetesch Identifikatioun vun der Kaz gouf vun zwou verschiddene mee mëch Archipel Approche gehaal. Éischt, genetesch Identitéitskaarten mat der Rannala & Mountain Method vun Berechnung [48] wéi am Programm ëmgesat GeneClass2 [49] war gehaal. Hei, d'Echantillon vun den Häff a vun der Wëllschwäin Fësch sech als Pre-alles potentiell Quelle vun der Kaz (i.e., déi genetesch baseline) benotzt. Sou gouf, gouf direkt genetesch Identitéitskaarten gehaal. Dës Method Plazen all onbekannt Fësch (i.e., déi eenzel Kaz Fësch) an der baseline Prouf datt et gläicht am meeschten. Eng Begrenzung mat direktem Aufgab ass, datt et eng potentiell Quell Populatioun zu jidderengen vun den onbekannten Echantillon Ennerscheed zu der absoluter Ofschloss vun Ähnlechkeet Arméischoul. Dëst kann zu "zougemaach Systemer" wou all méiglech Quelle vun der onbekannt Echantillon vertruede sinn, awer, an Situatiounen wéi den haitegen akzeptabel gin, wou net all Potential Quelle vun der baseline abegraff sinn, ass et wichteg eng Estimatioun vun der Ofschloss ze kréien vun Ähnlechkeet tëscht der onbekannt Prouf (s) an all baseline Prouf. Dëst ass déi Exklusioun erreecht, an eenzelne ass fir all baseline Prouf Verglach, an enger Wahrscheinlechkeet vun der Zougehéieregkeet (oder méi korrekt, Wahrscheinlechkeet net gehéiert) ass berechnen. An der konkreter Situatioun hei, Ofleenung vun all baseline Echantillon géif virschloen, datt d'Kaz aus enger Quell entstanen net anerer. VerfÜgung Déi zweet Approche d'Kaz ze identifizéieren war admixture fir auszerechnen (och fir den Bayesian Stärekoup Analyse genannt) benotzt Programm Struktur 2.2 [50], [51]. Individuell admixture Genehmegungen der Identifikatioun an Aufgab vun eenzelne Fësch ze genetesch Kéip (i.e., Populatiounsschichte oder genetesch Gruppen) ouni "Welpen" iwwert d'Bevëlkerung oder Lag vun deenen eenzelne Prouf entstanen. Dëst erméiglecht, zum Beispill, Identifikatioun vun Individuen, déi vun deer genetesch Urspronk sinn, an Identifikatioun vun Individuen, wou an Echantillon Kannerbetreiung vun anere genetesch Gruppe gemëscht. De Programm gouf mat enger admixture Modell mat soll allele Ofstänn a keen Welpen lafen. Leeft bestoung vun engem verbrennen-a vun 250 000 MCMC Schrëtt, déi vun 250 000 Träppleker gefollegt. De Programm Course war mat all Echantillon detailléierte abegraff, mat der Zuel vun de Populatiounen Formatioun tëschent k VerfÜgung = 1-8 mat 3 leeft pro k VerfÜgung. D'Wahrscheinlechkeet vun der Donnéeën war opgezeechent hat, an déi entspriechend k VerfÜgung war um Punkt alles wou Graph engem Plateau erreecht [50]. VerfÜgung Trotz deelweis als verdaut (Figebam. 1), waren microsatellite DNA Profiler vun all 36 Kaz aus de Bacalhau Mamm anerer Erfolleg kritt, an der eenzeger escapee vun der Iwwerwachung net ausserhalb der lokal Bauerenhaff Faarwe ageholl. Während e puer lues net an e puer vun den DNA isolations Faarwen waren, wann Donnéeë vu béide isolates (no Kräiz-Check genotyping Konstanz ze validéieren) kombinéiert, nëmmen zwee genotypes aus engem Ganzen 629 Potential genotypes fir déi 37. Fësch um 17 microsatellite analyséiert goufen vermësst loci (dh, > 99% genotyping duerginn). Dat gëtt souwuel mer eis Beweis datt d'Kaz jo Atlantik Saumon waren, an erlaabt déi nächst Schrëtt vun hier Identifikatioun enger Populatioun Genetik statistesch Approche benotzt. VerfÜgung Satz war fir d'kombinéiert Prouf vun der Kaz (deen eenzegen escapee abegraff Arc an net), en Echantillon vun der lokal Bauerenhaff an der Baach beweisen puer Trends (Table 1). All Echantillon vun der Bauerenhaff ugewisen manner genetesch Diversitéit wéi der kënnt vun der Baach, wéi déi entweder d'Gesamtzuel vun alleles gemooss, oder allelic Räichtum deen d'Problemer vun mussen verschidden Zuel vu Persounen vertrëtt all Prouf circumvents. Ënneschten Variant um polymorphic genetesch lues ass typesch fir Bauerenhaff Echantillon am Verglach mat Wëld Echantillon [52], [53], an ass op d'Tatsaach Hausnummeren, datt d'Fësch an engem eenzege Cage anerer oft eng limitéiert Zuel vun Elteren hunn [54]. Bal all Echantillon vun HWE goufen, awer, war LD an observéiert souwuel d'Prouf Farm 1c, an d'Prouf vun Kaz Fësch. Ne VerfÜgung war an der Prouf vun der Kaz an zwou vun der Echantillon vun Häff Ganz niddereg. Am Géigesaz, war Ne VerfÜgung vill méi héich an d'Prouf vun wëll Saumon an Bauerenhaff Prouf 1B. Fir all vun dësen Resumé Statistiken, d'Kaz der Bauerenhaff Echantillon Beruff ganz staark, virun allem 1c hierkommen, si ganz verschidden Parameteren fir d'Wëld Prouf ugewisen. VerfÜgung F ass ST Moyenne Miessung vun genetesch Ähnlechkeet tëschent Gruppe vun Echantillon oder Populatiounen. Geholl kollektiv, goufen d'Kaz genetesch staark Frae fir d'Wëld Saumon, a liicht anescht un d'Echantillonen Bauerenhaff 1A an 1B (Table 2). Dës Kaz huet genetesch ähnlech zu der Bauerenhaff Prouf 1c. All Bauerenhaff Echantillon waren genetesch z'ënnerscheedde zu der Wëllschwäin Echantillonen, ënnerstëtz Observatioune vun der BBC war domatter virun presentéiert. VerfÜgung Self-Identitéitskaarten Simulatioune dorënner Echantillon vun der Bauerenhaff an der Wëllschwäin Populatioun bewisen, dass allgemeng, 70% vun de Fësch an dësem Formatioun vun Echantillon richteg un d'Prouf unerkannten wier aus deem se entstanen. Miss-Aufgab war bal ausschliesslech geziicht Fësch ëmmer nees eng Alternativ Bauerenhaff Prouf mat geluecht ginn, déi de phpNuke genetesch Profil tëscht dësen Käfeg reflektéiert. Keen vun den Zuchtdéieren Fësch goufen zu der Wëllschwäin Bevëlkerung mat zougewisen, an nëmmen 3 vun den 101 Wëll Saumon huet mat kengem vun den Zuchtdéieren Echantillon uechtzéng (all ze Farm 1B unerkannten goufen). Sou, vermëttelt dës Simulatioune bal komplett Potential ze identifizéieren ob d'Kaz méi wahrscheinlech sinn fir aus dëser lokal Bauerenhaff Ursprong hunn (an domat e Mënsch-entschlof event) oder déi lokal wëll Bevëlkerung (an deemno eng ongewéinlech natierlech event). VerfÜgung Direct Identitéitskaarten (deen dat onbekannt Prouf Plazen, déi an dësem Fall ass et de 36. Kaz an der ee Saumon escapee an engem net ausserhalb der Bauerenhaff ageholl, an d'genetesch stäerkste ähnlechen baseline Beispill) seng Faarwe mat all vun der Kaz an der eenzeger escapee an Bauerenhaff Echantillonen, an keen an d'Wëld Prouf (Figebam. 2). Exklusioun Tester ënnerstëtzt dës Musiktherapie- datt d'Majoritéit vun der Kaz an der eenzeger escapee konnt conclusively aus der Prouf vun wëll Saumon ausgeschloss ginn, wat jo nëmmen 1 Kaz kennt aus all vun der geziicht Echantillon ausgeschloss ginn hätt (an dësem Fall d'Wëld Prouf och ). VerfÜgung Umeldung vun der Kaz an der eenzeger escapee war och an de Programm Structure (Figebam. 3) benotzt admixture Analyse gehaal. Dëse Programm heescht huelen net un all "priors" fir d'Echantillonen an eenzelne kann eng Mëschung vun genetesch Gruppen oder Stärekéip vertrieden. D'Wahrscheinlechkeet vun der Donnéeën war opgezeechent hat, an déi entspriechend Zuel vu Stärekéip k VerfÜgung, war 4 (de Punkt, wou d'Schréiegt engem Plateau erreecht) gin sech [50]. Confirméiert Resultater aus anere statistesch Tester virun virgestallt, bewisen admixture Analyse, datt et e grousse genetesch Differenzen tëscht der geziicht Saumon war an der Wëllschwäin Saumon vun dëser Datesaz, a wichteg, datt all vun der Kaz, dorënner d'Single Saumon escapee, huet enk verbonne mat genetesch Stärekéip an de Saumon vun der lokal norwegesche Bauerenhaff vertrueden, an net déi lokal wëll Populatioun. Donnéeën fir aner Nummere vu Stärekéip (dh, k VerfÜgung Formatioun tëschent 2-8) huet identesch Resultater (Donnéeën net virgestallt). VerfÜgung Real-Zäit Hinnen alleguer analyséiert (PRV-ST assay) fonnt PRV Virus RNS zu 22 vun den 37 Kaz Echantillon. De positiven Echantillon representéiert 21. Kaz Elementer aus Bacalhau Mamm an eenzegen Saumon vun der Iwwerwachung net ausserhalb vum norwegesche Bauerenhaff Faarwe ageholl. C T Wäerter gounge vun 27.8-35.3 (mengen 33.0). VerfÜgung cuisine-genetesch Handwierksgeschir der aquaculture Gebei ze identifizéieren an an e puer Fäll esouguer déi spezifesch Cage vun Urspronk vum Atlantik Saumon [23], [24], Atlantik Bacalhau [55], [56] an geziicht Reeboufrell [57] escapees entwéckelt goufen. Mä, stellt de Moment studéieren eng nei Uwendung vun molekulare-genetesch Methode fir Gestioun Autoritéiten mat der Méiglechkeet, fir kommerziell aquaculture a seng Interaktioun mat der natierlecher Ëmwelt ze kontrolléieren. Zousätzlech, dës Etude stellt nei Abléck an Interaktiounen tëschent domestizéiert a Wëllschwäin Fësch VerfÜgung Véier kann Haaptgrond Conclusiounen aus dësen Analyse opgesat ginn:. 1. D'deelweis verdaut an morphologically schwéier Kaz ze identifizéieren sech verroden Atlantik Saumon ze ginn, 2. op verschiddene onofhängeg genetesch Parameteren Opgrond, goufen dës Saumon Kaz als geziicht identifizéiert an net aus der lokal wëll Populatioun, also dëst Musiktherapie- engem Mënsch entschlof gin, an natierlech Phänomener géint esou, 3. Trotz partiell unzereegen, d'Majoritéit vun der Kaz , déi eenzeg escapee dorënner, duerchgefouert Magnéitfeld Niveau vun PRV. PRV ass mat der Krankheet verbonne HSMI [32], [33]. Dës Krankheet bedeitendst veruerteelt vun Saumon op d'lokal Bauerenhaff an der direkter Zäit-Period virun der Kaz an der Wëllschwäin Bacalhau ageholl Wiesen, 4. D'genetesch Profil vun der Saumon Kaz, an der eenzeger escapee verursaacht huet, stemmt staark d'genetesch Profil vun de Fësch an der lokaler Bauerenhaff. Obwuel genetesch Ähnlechkeet net däitlech Beweis vun Hierkonft [23], andeems een den nooste alternative Bauerenhaff, datt dës Persounen Réimech entstanen hätt kéinten aus méi wéi 100 km ewech vun aneren Fjord etabléiert huet, gëtt dësen Analyse der NDF mat genuch "Inneminister Beweiser" ze lancéieren eng Enquête vun der Entreprise op der Basis vun Potential ännert-Gestioun dëser kommerziell aquaculture Gebei Besëtz. VerfÜgung d'Saumon Bauerenhaff an der Etude gekësst huet mat HSMI just Woche virun der Opkommen vun geziicht Saumon am Mo vun der lokal festgestallte Bacalhau. Dofir, d'Kaz aus Bacalhau Mamm zréckhaten sech fir d'Präsenz vun PRV iwwerpréift, obwuel Virus Niveauen no enger Epidemie Réckgang kann [58]. Trotz partiell Verdauung vun der Kaz, an de Fait, dass nëmmen Fleesch Echantillon waren sinn, huet PRV Virus nach fonnt. Trotzdem, baséiert op d'Analysë hei gehaal, ass et net méiglech ze unequivocally klären, wéi de PRV Krankheet geziicht Saumon der natierlecher Ëmwelt aginn. Si hätt dout Fësch an d'Mier verschéckt diseased ginn (wat eng illegal Praxis an Norwegen bedeiten géif) an duerno duerch de Bacalhau aus dem Mier-Bett ingested, oder se goufen escapees predated upon vun de Bacalhau. Tatsaach, datt de Bauerenhaff bedeitendst veruerteelt Fësch erlieft haten (55000) duerch HMSI an der Period direkt virun der Saumon vun der Bacalhau Mamm ageholl goufen, weisen, datt de fréiere Erklärung d'Wahrscheinlechkeet ass. VerfÜgung Onofhängeg vun wéi de Fësch der natierlecher Ëmwelt, dës Etude weist trophic Transmissioun als Mechanismus fir Interaktioun tëscht Saumon Landwirtschaft a Wëllschwäin Populatiounsschichte aginn. Iwwerdeems Atlantik Bacalhau op Wëllschwäin Atlantik Saumon smolts dokumentéiert goufen aus frëscht un d'Mier [27], [28], Atlantik gesprongen ass op der Zäit vum Joer vun Bacalhau an déi net typesch predated wanderen ze predate déi aktuell Étude huet [25 ], [26]. Ausserdeem, fir eis Kenntnisser, stellt dës Etude den éischte Dokumentatioun vum Atlantik Bacalhau Atlantik Saumon vun engem Fësch Bauerenhaff ingesting. Sou, ass et méiglech, datt de Bacalhau propagéieren hei, a bei dëser Zäit vum Joer en Deel vun der Populatioun an der Etude Beräich ze grënnen, muss PRV ausgesat ginn. D'Kapazitéit vun PRV Virus op nei dorophin via Nossallergie vun Krankheet Kaz ass, am Moment onbekannt iwwerdroen gin als waat Atlantik Bacalhau fir de Virus ass. Allerdéngs, PRV war net zu 78 Bacalhau nogewise nach 850 aner gadoids datt fir dëst Virus [59] an Norwegen an opgefouert kuerzem anerer goufen. Zanter PRV Aids an wëll gemeinsam ginn an geziicht Saumon an Norwegen, a se och zu wëll Mier Frällen ( Salmo trutta VerfÜgung L.) [34], et ass wahrscheinlech dass d'gemeinsam PRV Typ ze salmonids spezifesch ass, an datt Bacalhau ass net ufälleg. VerfÜgung Analys vum Déier Mo. Inhalter oder faeces molekulare genetesch Methode benotzt gouf, fir eng Rei vun taxa a biologescher Froen vereelst [19], [60]. Dës Methode hunn allem gehaal ginn Kaz heizou zu engem taxonomic Klassifikatioun z'identifizéieren, dacks Arten, meeschtens mat der Analyse vun enger eenzeger oder héich Zuel vun Genen déi néideg taxonomic Méiglechen stoussen fir déi potentiell Deckung zu Fro suergt [17], [18], [20]. Méi kuerzem, hunn Schrett an déi nächst Generatioun sequencing mächteg Bausténg fir dës Approche erlaabt, fir all Kéiers wat den DNA metabarcoding Limburg ass [61]. Während der presentéieren Etude net eng technologesch Viraus fir wéi molekulare genetesch Methoden vertrieden, fir d'Applikatioun vun microsatellite DNA Analyse an Ernährung Analyse Identifikatioun doriwwer eraus eng taxonomic Klassifikatioun Roman ass. Hei, et ass méiglech, net nëmme bäidréit, datt d'Kaz war Atlantik seng Géigespiller gesprongen, mä datt déi probabel Quell eng lokal Bauerenhaff war an net eng lokal wëll Saumon Populatioun. Endlech, et war och méiglech ze beweisen, datt d'Kaz engem Virus gedroen, datt mat enger Krankheet assoziéiert gouf dat bedeitendst veruerteelt vun geziicht Saumon bewierkt. Dofir, stellt dës Etude eng Extensioun vun der biologescher Froen, déi via molekulare genetesch Analyse vun Mo. Inhalter Adress kënnen. Aner Beispiller vun Ernährung Analyse iwwer Aarten identifications elo och Analyse zu der Famill Niveau filial cannibalism am Wildwest [21], an predation veruerteelt vum Atlantik Saumon vun geziicht, Hybrid a Wëllschwäin parentage zu engem natierlechen Floss System (Skaala Engels) beweisen. Och, Identifikatioun vun Kaz Artikelen déi eenzel Niveau gouf gehaal, wou microsatellite Analyse vun Ernährung aus GREENLAND sharks ( Somniosus microcephalus VerfÜgung), zesumme mat enger Sich vun engem DNA Umeldung fir all minke Walen ( Balaenoptera acutorostrata VerfÜgung) ënnert kommerziell Recolte vun Norwegen Arc [62] Waffeschmuggel geridden an Shark ëmklammen souwuel zu Zäit a Raum Treffer souwuel ze verstoen hir Bewegung an Ernährung Gewunnechten [22]. VerfÜgung fir méi wéi engem Jorzéngt, de Chiffer gemellt escapement vun Saumon vun norwegesche Fësch Häff huet an der Zénger oder honnertdausende [1] gouf. Dat ass wahrscheinlech eng Ënnerschätzt wéinst underreporting, an an der Period 1998 bis 2004 ze ginn, ass et ugeholl, datt d'mengen alljährlechen Zuel vun escapees huet 2,4 Milliounen [2], déi ass méi héich wéi de Chiffer Zuel vun wëll Saumon fir de norwegesche zréckgoen Léisegeld an der selwechter Period ze reproduzéieren. Iwwerdeems Opmierksamkeet huet den Impakt vun escapees Ëmfeld allem lieweg Géigesaz zu deenen ginn wéi bis dout [7], [9], [63], weist déi heiteg Etude dass Virus-Krankheet geziicht Fësch duerch eng Method fir d'Ëmwelt Hit kann oder aneren. D'Analysë vun de Kado Fall Highlight de Potential ze identifizéieren an Événementer Streck. der Gréisst vun escapement aus kommerziell Fësch Häff entscheet, stellt dat eent vun de bemierkenswäert Mënsch-entschlof Invasioune vun déem Populatiounen vun enger Planz déi an ausgewielte Südhallefkugel Sujet gouf. Dofir, brauch dës Situatioun fir net nëmmen ekologesch [6] a genetesch [7] iwwerwaacht ginn -. [12] Interaktiounen, mä och Krankheet Interaktioune VerfÜgung Tor Arne Helle, an aner
spontan a Methode VerfÜgung
Resultater VerfÜgung
Diskussioun VerfÜgung
Arbeschterlidder VerfÜgung
Sinn DNA-baséiert Diaken a personaliséiert medizinesch Liewensmëttel d'Zukunft fir Gewiichtsverloscht?
Probiotika kënnen therapeutesch Virdeeler fir biopolare Patienten ubidden
Bluttest fir mikrobiell DNA kéint vu Kriibs warnen
Frae gebuer mam Cesarean hu méi e grousse Risiko fir Adipositas an Diabetis
Planzbaséiert Diät kéint Är rheumatoide Arthritis heelen
Erstellt eng kierperlech a genetesch Kaart vu Cannabis sativa
Genetik kann d'Kompositioun vum Mikrobiom méi beaflossen wéi Ëmweltfaktoren
Fuerscher déi Mais um Technion-Israel Institute of Technology studéieren hu festgestallt datt de Mikrobiom vun der Genetik vill méi beaflosst ass wéi et vun der Mammegebuert Ëmwelt ass. Kat
Fëschschlamm kéint eng potenziell Quell vun Antibiotike fënnt Studie
Mam Opkommen vu multidrogenresistente Bakterien a Mangel un neien Antibiotike, Fuerscher sinn op der Sich no neie Molekülle gewiescht, déi géint dës Pathogenen kämpfe kënnen. En Team vu Fuerscher hunn
Mathematesche Modell weist de Risiko vun der SARS-CoV-2 Infektioun no fecaler Mikrobiota Transplantatioun op
An hirem neie Pabeier verfügbar op bioRxiv* Virdruck Server, US Fuerscher vun der OpenBiome Nonprofit Organisatioun hunn e mathematesche Modell benotzt fir dNëtzlechkeet vu verschiddenen Teststrateg