Punti salienti e conclusioni chiave del Boston Bacterial Meeting (BBM) 2019

Il Boston Bacterial Meeting (BBM) è una conferenza annuale che riunisce esperti di batteriologia dell'area di Boston e di tutto il mondo. è 25 ^ns l'iterazione ha avuto luogo tra il 6 giugno ^ns e 7 giugno ^ns , 2019, nel Science Center dell'Università di Harvard a Boston, e ha visto la partecipazione di circa 550 ricercatori provenienti da oltre 100 diverse istituzioni accademiche e aziende biotecnologiche. La conferenza si propone di mettere in luce gli argomenti più avanzati riguardanti la batteriologia sia fondamentale che applicata.

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Quest'anno, un oratore principale è stata la dott.ssa Denise Monack, professore di microbiologia e immunologia presso la School of Medicine della Stanford University e membro eletto dell'American Academy of Microbiology.

Monack ha presentato approfondimenti dal suo lavoro sui patogeni batterici Francisella tularensis e Salmonella tifimuro, in particolare per quanto riguarda i loro affini sensori eucariotici e le interazioni all'interno delle comunità batteriche che tendono a modellare il decorso della malattia. Il suo modello murino viene anche utilizzato per studiare meccanismi esatti di asintomatici e persistenti Infezioni da salmonella .

Accanto al discorso di apertura, discorsi sono stati presentati nelle categorie di regolazione batterica e fisiologia, suscettibilità agli antibiotici, nuovi strumenti antimicrobici, progressi nei metodi microbici, comunità microbiche, segnalazione e patogenesi.

Per la prima volta, sono stati introdotti brevi flash talk per consentire ai tirocinanti l'opportunità di presentare il proprio lavoro di fronte all'intero pubblico del Boston Bacterial Meeting 2019 (BBM 2019). C'era anche una serie di sessioni di discussione con i relatori, affrontare diversi temi scientifici, diversità, e l'inclusione nella scienza, percorsi di carriera, divulgazione scientifica, e persino arte batterica.

Resistenza antimicrobica:un argomento sempre più rilevante

È emersa una ridotta suscettibilità ai farmaci cefalosporinici a spettro esteso (incluso il ceftriaxone) nei patogeni a trasmissione sessuale Neisseria gonorrhoeae . Poiché non esiste un chiaro agente di riga successiva, il futuro di un trattamento efficace per la gonorrea è in pericolo.

Durante BBM 2019, Palazzo Samantha et al. hanno riportato per la prima volta un meccanismo di ridotta suscettibilità ai farmaci cefalosporinici a spettro esteso negli isolati clinici di gonococchi che non è legato alla variazione genetica nella proteina bersaglio legante la penicillina.

L'identificazione di questo tipo di meccanismo di resistenza ha notevoli implicazioni per lo sviluppo di test diagnostici molecolari, ma anche la sorveglianza della resistenza antimicrobica della gonorrea.

Jenna I. Wurster et al. ipotizzato che lo stato metabolico dell'ospite possa avere un impatto significativo sulla suscettibilità agli antibiotici nel microbioma attivando sia percorsi di tolleranza che di resistenza che sono correlati (o regolati dal) metabolismo microbico.

Utilizzando un modello di iperglicemia acuta indotta da streptozotocina, questi ricercatori della Brown University e dell'Università di Washington hanno combinato due approcci per studiare l'impatto della terapia antibiotica sul microbioma del topo:il profilo tassonomico metagenomico insieme alla metatrascrittomica/metabolomica dell'intera comunità.

I loro risultati suggeriscono che i taxa sopravvissuti all'interno delle comunità iperglicemiche mostrano un grado di tolleranza/desensibilizzazione agli antibiotici guidato da differenze nei fattori derivati ​​dall'ospite, infine enfatizzando la reattività del microbioma al metabolismo dell'ospite.

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Nuovi antibiotici all'orizzonte...

Un grande gruppo internazionale di ricercatori della BBM ha mostrato come i rappresentanti di un genere batterico fotorabdo contengono una miriade di cluster di geni di metaboliti secondari biosintetici inesplorati nel loro genoma.

Photorhabdus spp. vivono in simbiosi con insetti nematodi e producono antibiotici per salvaguardare le fonti di cibo da altri microrganismi. I ricercatori hanno dimostrato l'efficacia di un nuovo antibiotico contro i patogeni Gram-negativi (anche contro i resistenti alla colistina Escherichia coli e Pseudomonas aeruginosa ).

La tubercolosi è una malattia altamente contagiosa che uccide 1,5 milioni di persone ogni anno. Eachan O. Johnson e i suoi colleghi del Broad Institute of MIT e Harvard, Weill Cornell Medical College, La Harvard TH Chan School of Public Health e la University of Massachusetts Medical School hanno dimostrato come la profilazione dell'interazione chimico-genetica su larga scala possa produrre nuove classi di inibitori mirati in modo specifico Mycobacterium tuberculosis , un agente eziologico della malattia.

Identificando specifiche interazioni chimico-genetiche, hanno identificato nuovi inibitori della RNA polimerasi e di un bersaglio finora non descritto, la proteina di efflusso EfpA.

Avanzamento dei metodi microbici e screening delle comunità microbiche

Negli ultimi anni, Il sequenziamento del DNA di nuova generazione ha svelato immense variazioni genetiche batteriche nei campioni dei pazienti e nell'ambiente. Opera di Max G. Schubert et al. ha mostrato come la produzione di un DNA a singolo filamento in vivo ha la propensione a diventare un metodo versatile per generare librerie mutanti con codici a barre di Escherichia coli .

Per di più, un romanzo in vitro sistema stabilito da Stacie Clark et al. di Boston consente l'analisi delle dinamiche di crescita batterica nei tessuti e consente l'identificazione di sottopopolazioni batteriche che rispondono alle cellule immunitarie residenti, che era piuttosto difficile da rilevare prima.

Sebbene le comunità microbiche abbiano una pletora di potenziali applicazioni in medicina, biotecnologia, agricoltura e scienze ambientali, l'accuratezza della ricerca sull'interazione e le dipendenze tra specie è stata limitata.

Durante BBM 2019, Anthony Artiz et al. ha rivelato il kChip, una piattaforma basata su goccioline per una rapida, dal basso verso l'alto, costruzione parallela e screening di comunità microbiche sintetiche. Questo tipo di approccio di screening può essere utilizzato nell'ecologia microbica di base e applicata e può individuare consorzi multispecie che hanno una funzione analizzabile otticamente (come la soppressione dei patogeni, facilitazione di agenti di biocontrollo, così come la degradazione dei substrati recalcitranti).

Diversi studi hanno suggerito come gli esseri umani industrializzati abbiano perso alcuni microbi intestinali, e che tale perdita di diversità microbica può essere collegata a varie malattie croniche. Per scoprire specie batteriche estinte, Marsha C. Wibowo e i suoi colleghi hanno eseguito il sequenziamento metagenomico shotgun per creare la più grande ricostruzione di genomi microbici da paleofeci (duemila anni) fino ad oggi.

Wibowo ha descritto la storia evolutiva dei simbionti intestinali nel gene, livelli del genoma e del percorso, che potrebbe portare alla scoperta di batteri estinti con il potenziale per ripristinare la salute umana. In altre parole, c'è la possibilità di "resuscitare" vecchi amici che possono essere utili per noi ancora una volta.

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