Kohokohdat ja tärkeimmät otokset vuoden 2019 Bostonin bakteerikokouksesta (BBM)

Boston Bacterial Meeting (BBM) on vuosittainen konferenssi, joka kokoaa yhteen bakteriologian asiantuntijat Bostonin alueelta ja ympäri maailmaa. Sen 25 ^th iterointi tapahtui kesäkuun 6 ^th ja kesäkuun 7 ^th , 2019, tiedekeskuksessa Harvardin yliopistossa Bostonissa, ja siihen osallistui noin 550 tutkijaa yli 100 eri oppilaitoksesta ja biotekniikkayrityksestä. Konferenssin tavoitteena on tuoda esiin uusimmat aiheet, jotka liittyvät sekä perustavanlaatuiseen että soveltavaan bakteriologiaan.

Marcio Jose Bastos Silva | Shutterstock

Tämä vuosi, pääpuhuja oli tohtori Denise Monack, mikrobiologian ja immunologian professori Stanfordin yliopiston lääketieteellisestä korkeakoulusta ja Yhdysvaltain mikrobiologian akatemian jäsen.

Monack esitteli oivalluksia työstään bakteeripatogeeneihin liittyen Francisella tularensis ja Salmonella Typhimurium, erityisesti niiden sukua oleville eukaryoottisensoreille ja bakteeriyhteisöjen välisille vuorovaikutuksille, jotka pyrkivät muokkaamaan taudin kulkua. Hänen hiirimalliaan käytetään myös tutkimaan oireettomia ja pysyviä tarkkoja mekanismeja Salmonella -infektiot .

Pääpuheen ohella keskustelut esiteltiin bakteerien säätelyn ja fysiologian kategorioissa, antibioottiherkkyys, uudet antimikrobiset työkalut, mikrobimenetelmien edistyminen, mikrobiyhteisöt, signalointi ja patogeneesi.

Ensimmäistä kertaa, Lyhyen muodon flash-keskustelut otettiin käyttöön, jotta harjoittelijat voivat esitellä työnsä Bostonin bakteerikokouksen 2019 (BBM 2019) koko yleisön edessä. Siellä järjestettiin myös lukuisia keskusteluja paneelien kanssa, käsitellään erilaisia ​​tieteellisiä aiheita, monimuotoisuus, ja sisällyttäminen tieteeseen, urapolkuja, tieteellinen ulottuvuus, ja jopa bakteeritaidetta.

Mikrobilääkeresistenssi - yhä tärkeämpi aihe

Sukupuoliteitse tarttuvan taudinaiheuttajan herkkyys laajennetuille kefalosporiinilääkkeille (mukaan lukien keftriaksoni) on vähentynyt Neisseria gonorrhoeae . Koska selkeää seuraavan rivin edustajaa ei ole, tehokkaan gonorrean hoidon tulevaisuus on vaarassa.

BBM 2019:n aikana Samanthan palatsi et ai. raportoi ensimmäistä kertaa mekanismista, joka heikentää herkkyyttä laajennetun spektrin kefalosporiinilääkkeille kliinisissä gonokokki-isolaateissa ja joka ei liity penisilliiniä sitovan kohdeproteiinin geneettiseen vaihteluun.

Tämän tyyppisen resistenssimekanismin tunnistamisella on huomattavia vaikutuksia molekyylidiagnostiikkatestien kehittämiseen, mutta myös gonorrean mikrobilääkeresistenssin seuranta.

Jenna I. Wurster et ai. oletti, että isännän aineenvaihduntatila voi vaikuttaa merkittävästi antibioottiherkkyyteen mikrobiomissa aktivoimalla sekä sieto- että resistenssireitit, jotka liittyvät mikrobien aineenvaihduntaan (tai säätelevät sitä).

Hyödyntämällä streptotsotosiinin aiheuttamaa akuutin hyperglykemian mallia, nämä Brownin yliopiston ja Washingtonin yliopiston tutkijat yhdistivät kaksi lähestymistapaa tutkimaan antibioottihoidon vaikutusta hiiren mikrobiomiin:metagenominen taksonominen profilointi yhdessä koko yhteisön metatranskriptian/metabolomian kanssa.

Niiden tulokset viittaavat siihen, että elossa olevat taksonit hyperglykeemisissä yhteisöissä osoittavat tiettyä antibioottitoleranssia/herkistymistä, joka johtuu isäntäperäisten tekijöiden eroista, lopulta korostamalla mikrobiomin reagointikykyä isännän aineenvaihduntaan.

David Marchal | Shutterstock

Uusia antibiootteja luvassa ...

BBM:n suuri kansainvälinen tutkijaryhmä osoitti, kuinka bakteeriperheen edustajat Photorhabdus sisältävät genomissaan lukemattomia tutkimatonta biosynteettistä sekundaarisen metaboliitin geeniryhmää.

Photorhabdus spp. elävät symbioosissa hyönteisten sukkulamatojen kanssa ja tuottavat antibiootteja suojaamaan elintarvikelähteitä muilta mikro -organismeilta. Tutkijat osoittivat uuden antibiootin tehokkuuden gramnegatiivisia patogeenejä vastaan ​​(jopa kolistiiniresistenttejä vastaan) Escherichia coli ja Pseudomonas aeruginosa ).

Tuberkuloosi on erittäin tarttuva sairaus, joka tappaa 1,5 miljoonaa ihmistä vuosittain. Eachan O.Johnson ja hänen kollegansa MIT:n ja Harvardin laajasta instituutista, Weill Cornell Medical College, Harvardin TH Chanin kansanterveyskoulu ja Massachusettsin yliopiston lääketieteellinen koulu osoittivat, kuinka laajamittainen kemiallinen-geneettinen vuorovaikutusprofilointi voi tuottaa uusia inhibiittoriluokkia, jotka kohdistuvat erityisesti Mycobacterium tuberculosis , taudin aiheuttaja.

Tunnistamalla erityiset kemialliset ja geneettiset vuorovaikutukset, he ovat tunnistaneet uusia RNA -polymeraasin estäjiä ja toistaiseksi kuvaamatonta kohdetta, ulosvirtausproteiini EfpA.

Mikrobimenetelmien edistäminen ja mikrobiyhteisöjen seulonta

Viime vuosina, seuraavan sukupolven DNA-sekvensointi on paljastanut valtavia bakteeriperäisiä vaihteluita potilasnäytteissä ja ympäristössä. Teos:Max G.Schubert et ai. on osoittanut kuinka yksijuosteisen DNA:n tuotanto in vivo on taipumus tulla monipuoliseksi menetelmäksi viivakoodattujen mutanttikirjastojen luomiseksi Escherichia coli .

Lisäksi, novelli in vitro Stacie Clarkin perustama järjestelmä et ai. Bostonista mahdollistaa bakteerien kasvun dynamiikan analysoinnin kudoksissa ja mahdollistaa bakteerien alaryhmien tunnistamisen, jotka reagoivat kotimaisiin immuunisoluihin, jota oli aika vaikea havaita.

Vaikka mikrobiyhteisöillä on lukuisia mahdollisia sovelluksia lääketieteessä, biotekniikka, maatalous ja ympäristötiede, lajien välisten vuorovaikutusten ja riippuvuuksien tutkimisen tarkkuus on ollut rajallinen.

BBM 2019:n aikana Anthony Artiz et ai. paljasti kChipin-pisarapohjaisen alustan nopeaa, alhaalta ylös, synteettisten mikrobiyhteisöjen rinnakkainen rakentaminen ja seulonta. Tämäntyyppistä seulontamenetelmää voidaan käyttää perus- ja sovelletussa mikrobiologiassa ja se voi tunnistaa usean lajin konsortiot, joilla on optisesti mitattavissa oleva toiminto (kuten taudinaiheuttajien tukahduttaminen, biologisten torjunta-aineiden helpottaminen, sekä vastenmielisten alustojen hajoaminen).

Eri tutkimukset ovat viitanneet siihen, kuinka teollistuneet ihmiset ovat menettäneet tiettyjä suoliston mikrobeja, ja että tällainen mikrobien monimuotoisuuden häviäminen voi liittyä erilaisiin kroonisiin sairauksiin. Kuolleiden bakteerilajien löytämiseksi Marsha C.Wibowo ja hänen kollegansa suorittivat haulikon metagenomisen sekvensoinnin luodakseen tähän mennessä suurimman mikrobien genomien rekonstruktion paleofecesista (kaksi tuhatta vuotta vanha).

Wibowo kuvasi suoliston symbiontien evoluutiohistoriaa geenissä, genomi ja reittitasot, joka voi johtaa sukupuuttoon kuolleiden bakteerien löytämiseen, jotka voivat palauttaa ihmisten terveyden. Toisin sanoen, on olemassa mahdollisuus "herättää henkiin" vanhoja ystäviä, joista voi olla meille jälleen hyötyä.

• Miehet, jotka syövät jogurttia kahdesti viikossa, eivät todennäköisesti kehitä suolistosyöpää
• Fyysisen ja geneettisen kartan luominen Cannabis sativasta