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Cette année, une conférencière d'honneur était la Dre Denise Monack, professeur de microbiologie et d'immunologie de la faculté de médecine de l'université de Stanford et membre élu de l'American Academy of Microbiology.
Monack a présenté des aperçus de son travail sur les agents pathogènes bactériens Francisella tularensis et Salmonelle Typhimurium, en particulier en ce qui concerne leurs capteurs eucaryotes apparentés et les interactions au sein des communautés bactériennes qui ont tendance à façonner l'évolution de la maladie. Son modèle murin est également utilisé pour étudier les mécanismes exacts des troubles asymptomatiques et persistants. Infections à salmonelles .
Parallèlement au discours d'ouverture, des exposés ont été présentés dans les catégories de la régulation bactérienne et de la physiologie, sensibilité aux antibiotiques, de nouveaux outils antimicrobiens, les progrès des méthodes microbiennes, communautés microbiennes, signalisation et pathogenèse.
Pour la première fois, des présentations éclair de format court ont été introduites pour permettre aux stagiaires de présenter leur travail devant l'ensemble du public du Boston Bacterial Meeting 2019 (BBM 2019). Il y avait aussi une série de sessions en petits groupes avec des panélistes, aborder différents sujets scientifiques, la diversité, et l'inclusion dans la science, possibilités de carrière, vulgarisation scientifique, et même l'art bactérien.
Une sensibilité réduite aux céphalosporines à spectre étendu (y compris la ceftriaxone) est apparue chez les agents pathogènes sexuellement transmissibles Neisseria gonorrhoeae . Puisqu'il n'y a pas d'agent de prochaine ligne clair, l'avenir d'un traitement efficace contre la gonorrhée est en péril.
Pendant le BBM 2019, Palais de Samantha et al. ont rapporté pour la première fois un mécanisme de sensibilité réduite aux céphalosporines à spectre étendu dans des isolats cliniques de gonocoques qui n'est pas lié à une variation génétique de la protéine cible de liaison à la pénicilline.
L'identification de ce type de mécanisme de résistance a des implications notables pour le développement de tests de diagnostic moléculaire, mais aussi la surveillance de la résistance antimicrobienne de la gonorrhée.
Jenna I. Wurster et al. ont émis l'hypothèse que l'état métabolique de l'hôte peut avoir un impact significatif sur la sensibilité aux antibiotiques dans le microbiome en activant à la fois les voies de tolérance et de résistance qui sont liées (ou régulées par) le métabolisme microbien.
En utilisant un modèle d'hyperglycémie aiguë induit par la streptozotocine, ces chercheurs de l'Université Brown et de l'Université de Washington ont combiné deux approches pour étudier l'impact de l'antibiothérapie sur le microbiome de la souris :le profilage taxonomique métagénomique ainsi que la métatranscriptomique/métabolomique de l'ensemble de la communauté.
Leurs résultats suggèrent que les taxons survivants au sein des communautés hyperglycémiques présentent un degré de tolérance/désensibilisation aux antibiotiques entraîné par des différences dans les facteurs dérivés de l'hôte, mettant finalement l'accent sur la réactivité du microbiome au métabolisme de l'hôte.
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Un grand groupe international de chercheurs du BBM a montré comment des représentants d'un genre bactérien Photorhabdus contiennent une myriade de groupes de gènes de métabolites secondaires biosynthétiques inexplorés dans leur génome.
Photorhabdus spp. vivent en symbiose avec les insectes nématodes et produisent des antibiotiques pour protéger les sources de nourriture des autres micro-organismes. Les chercheurs ont démontré l'efficacité d'un nouvel antibiotique contre les pathogènes à Gram négatif (même contre les bactéries résistantes à la colistine Escherichia coli et Pseudomonas aeruginosa ).
La tuberculose est une maladie hautement contagieuse qui tue 1,5 million de personnes chaque année. Eachan O. Johnson et ses collègues du Broad Institute du MIT et de Harvard, Collège médical Weill Cornell, La Harvard TH Chan School of Public Health et la University of Massachusetts Medical School ont démontré comment le profilage à grande échelle des interactions chimiques-génétiques peut produire de nouvelles classes d'inhibiteurs qui ciblent spécifiquement Mycobacterium tuberculosis , un agent causal de la maladie.
En identifiant des interactions chimiques-génétiques spécifiques, ils ont identifié de nouveaux inhibiteurs de l'ARN polymérase et d'une cible jusqu'alors inconnue, la protéine d'efflux EfpA.
Dans les années récentes, le séquençage de l'ADN de nouvelle génération a révélé d'immenses variations génétiques bactériennes dans les échantillons de patients et dans l'environnement. uvre de Max G. Schubert et al. a montré comment la production d'un ADN simple brin in vivo a la propension à devenir une méthode polyvalente pour générer des bibliothèques de mutants à code-barres de Escherichia coli .
Par ailleurs, un roman in vitro système établi par Stacie Clark et al. de Boston permet l'analyse de la dynamique de croissance bactérienne dans les tissus et permet l'identification de sous-populations bactériennes qui répondent aux cellules immunitaires résidentes, ce qui était assez difficile à détecter auparavant.
Bien que les communautés microbiennes aient une pléthore d'applications potentielles en médecine, biotechnologie, sciences de l'agriculture et de l'environnement, l'exactitude des recherches sur les interactions et les dépendances entre les espèces a été limitée.
Pendant le BBM 2019, Antoine Artiz et al. a révélé la kChip - une plate-forme à base de gouttelettes pour rapide, de bas en haut, construction et criblage parallèles de communautés microbiennes synthétiques. Ce type d'approche de dépistage peut être utilisé dans l'écologie microbienne de base et appliquée et peut identifier des consortiums multi-espèces qui ont une fonction optiquement dosable (telle que la suppression des agents pathogènes, facilitation des agents de lutte biologique, ainsi que la dégradation des substrats récalcitrants).
Différentes études ont laissé entendre comment les humains industrialisés ont perdu certains microbes intestinaux, et qu'une telle perte de diversité microbienne peut être liée à diverses maladies chroniques. Pour découvrir des espèces bactériennes éteintes, Marsha C. Wibowo et ses collègues ont effectué un séquençage métagénomique au fusil de chasse pour créer la plus grande reconstruction de génomes microbiens à partir de paléofeces (vieux de deux mille ans) à ce jour.
Wibowo a décrit l'histoire évolutive des symbiotes intestinaux au niveau du gène, niveaux du génome et des voies, ce qui pourrait conduire à la découverte de bactéries éteintes ayant le potentiel de restaurer la santé humaine. En d'autres termes, il existe une possibilité de « ressusciter » de vieux amis qui peuvent nous être à nouveau bénéfiques.
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