Patientgenetik associerad med sårmikrobiomsammansättning och läkning

I en första studie i sitt slag, forskare har fastställt att genetik kan spela en roll för hur sår läker. Caleb Phillips, en biträdande professor vid Texas Tech University och chef för Phillips Laboratory vid Institutionen för biologiska vetenskaper, och doktoranden Craig Tipton ledde studien, "Patientgenetik är kopplad till kronisk sårmikrobiomsammansättning och läkning, "publicerad torsdag (18 juni) i open-access, peer-reviewed medicinsk tidskrift PLOS Pathogens.

Phillips, som också fungerar som kurator för genetiska resurser vid Natural Science Research Laboratory (NSRL) Robert J. Baker Genetic Resources Collection, sade studien bestämde att vissa gener är associerade med antalet bakterier och överflöd av vanliga patogener i sår. Samlingen av mikrober, känd som ett "mikrobiom, "kan avgöra hur ett sår läker och hur lång tid den processen tar. Forskningen visade också att ju mer mångfald det finns inom ett sårmikrobiom, desto kortare tid tog det att läka.

Patienter som besökte Lubbocks Southwest Regional Wound Care Center (SWRWCC) för vård av ett infekterat sår i nedre extremiteter samtyckte till deltagande i studien och gav prover från sina sår och från en kindpinne. Studien använde mikrobiomprofilering, genomfingeravtryck, validering av vått laboratorium, bildbehandling och modellutveckling för att analysera prover och data, och inkluderade forskare från Texas Tech, Texas Tech University Health Science Center (TTUHSC), SWRWCC och University of North Texas Health Science Center i Fort Worth (UNTHSC).

Vi visade att det finns identifierbara platser i människors genom där, beroende på deras genotyp, de tenderar att få infektioner av specifika bakterier. De olika genomiska platserna som identifieras tenderar att vara relaterade när det gäller de typer av gener de är nära och kan reglera. En arbetshypotes som framgår av forskningen är att genetiska skillnader som påverkar gener som kodar för hur våra celler interagerar med miljön och varandra är viktiga för infektionsskillnader. "

Caleb Phillips, Assisterande professor, Texas Tech University

Även om det fortfarande finns arbete kvar innan forskningen direkt gynnar patienter, Tipton sa att studien är ett viktigt och lovande steg i den riktningen.

"Personlig medicin är ett aktuellt ämne inom modern vård, där målet är att identifiera inneboende skillnader inom individer som kan få dem att påverkas olika av sjukdomar och hitta behandlingar som är väl lämpade och skräddarsydda för individen och kan bidra till bättre patientresultat, "Tipton sa." Vårt projekt främjar två lika intressanta forskningsvägar med potentiell översättning till kliniken. I ett, det är vårt mål att utveckla robusta genomiska prediktiva modeller som kan hjälpa läkare att bestämma patientens risk för kronisk sårinfektion, särskilt för specifika bakterier.

"På sekunden, detta arbete hjälper till att informera om hur genetisk variation hos patienter kan påverka mikrobiom-värdinteraktioner och sårinfektionspatogenes. Genom att ytterligare studera infektionspatogenes och hur dessa komplexa mikrobiella samhällen interagerar, det kan vara möjligt att förbättra befintliga terapier eller att utveckla nya terapeutiska strategier helt och hållet. "

Phillips sa att han ser fram emot att fortsätta sin forskning vid Texas Tech. Hans laboratorium utvecklar en uppföljningsstudie som han hoppas kommer att samla in tillräckligt med information för att skapa exakta förutsägbara modeller. De arbetar också med en studie som undersöker hur en persons plats i USA formar skillnader i kroniska sårmikrobiomer.

"Texas Tech ger bra stöd för forskning och arbetar kontinuerligt för tillväxt, "Sa Phillips." Min forskning, som de flesta andra, har i allmänhet förstärkts av den akademiska frihet som tillhandahålls vid universitetet. Natural Science Research Laboratory är en förstklassig naturhistorisk samling, och proverna som arkiverades i Genetic Resources Collection har gjort det möjligt för mig att designa studier som den här som annars inte hade varit möjliga. Doktorand Craig Tiptons hårda arbete och kreativitet var avgörande för framgången med detta projekt, liksom samarbetet med laboratorierna hos Nicole Phillips vid UNTHSC och Kendra P. Rumbaugh på TTUHSC, Professor Todd Little vid Texas Tech College of Education, SWRWCC och NSRL. "

• Forskning visar att tungmikrobiom kan hjälpa till att diagnostisera hjärtsvikt
• Specifika förändringar i DNA påverkar förekomsten och mängden tarmbakterier,