Genetika pacienta spojená so zložením a hojením mikrobiómu rany

V prvej štúdii svojho druhu vedci zistili, že genetika môže hrať úlohu v tom, ako sa rany hoja. Caleb Phillips, odborný asistent na Texas Tech University a riaditeľ Phillipsovho laboratória na Katedre biologických vied, a doktorand Craig Tipton viedol štúdiu, „Genetika pacienta je spojená s chronickým zložením mikrobiómu rany a hojením, “zverejnené vo štvrtok (18. júna) v otvorenom prístupe, recenzovaný lekársky časopis PLOS Pathogens.

Phillips, ktorý tiež slúži ako kurátor genetických zdrojov v Laboratóriu výskumu prírodných vied (NSRL) Robert J. Baker Collection Genetic Resources Collection, štúdia uvádza, že určité gény sú spojené s počtom baktérií a výskytom bežných patogénov v ranách. Zbierka mikróbov, známy ako „mikrobióm, "môže určiť, ako sa rana hojí a ako dlho trvá tento proces. Výskum tiež ukázal, že čím väčšia je rozmanitosť mikrobiómu rany, tým menej času trvalo liečenie.

Pacienti navštevujúci Lubbockovo juhozápadné regionálne centrum starostlivosti o rany (SWRWCC) za účelom starostlivosti o ranu infikovanú dolnými končatinami súhlasili s účasťou na štúdii a poskytli vzorky z ich rany (rán) a z tampónu na tvár. Štúdia použila profilovanie mikrobiómov, odtlačky prstov genómu, validácia mokrého laboratória, zobrazovanie a vývoj modelov na analýzu vzoriek a údajov, a zahŕňal výskumníkov z Texas Tech, Centrum zdravotníckej vedy Texas Tech University (TTUHSC), SWRWCC a Centrum zdravotníckych vied University of North Texas vo Fort Worth (UNTHSC).

Ukázali sme, že v genóme ľudí existujú identifikovateľné miesta, kde, v závislosti od ich genotypu, majú tendenciu sa nakaziť špecifickými baktériami. Rôzne identifikované genómové polohy majú tendenciu byť príbuzné z hľadiska typov génov, ku ktorým sú blízko a ktoré môžu regulovať. Pracovná hypotéza vyplývajúca z výskumu je, že genetické rozdiely ovplyvňujúce gény kódujúce spôsob, akým naše bunky interagujú s prostredím a navzájom, sú dôležité pre rozdiely v infekcii. “

Caleb Phillips, Odborný asistent, Technická univerzita v Texase

Aj keď je ešte potrebné urobiť veľa práce, kým bude výskum priamo prínosom pre pacientov, Tipton uviedol, že štúdia je dôležitým a sľubným krokom v tomto smere.

„Personalizovaná medicína je aktuálnou horúcou témou moderného zdravotníctva, kde je cieľom identifikovať vrodené rozdiely medzi jednotlivcami, ktoré môžu spôsobiť, že budú rôznym spôsobom ovplyvnení chorobou, a nájsť liečebné postupy, ktoré sú vhodné a prispôsobené jednotlivcovi a môžu prispieť k lepším výsledkom pacienta, „Tipton povedal.“ Náš projekt podporuje dve rovnako zaujímavé cesty výskumu s potenciálnym prekladom na kliniku. V jednom, Našim cieľom je vyvinúť robustné genomické prediktívne modely, ktoré by mohli lekárom pomôcť určiť riziko pacienta pre chronickú infekciu rany, najmä na špecifické baktérie.

„V druhom, táto práca pomáha informovať, ako môžu genetické variácie u pacientov ovplyvniť interakcie mikrobióm-hostiteľ a patogenézu infekcie rany. Ďalším štúdiom infekčnej patogenézy a toho, ako tieto komplexné mikrobiálne komunity interagujú, môže byť možné zlepšiť existujúce terapie alebo úplne vyvinúť nové terapeutické stratégie. “

Phillips povedal, že sa teší na pokračovanie svojho výskumu v spoločnosti Texas Tech. Jeho laboratórium vyvíja následnú štúdiu, v ktorej dúfa, že zhromaždí dostatok informácií na vytvorenie presných prediktívnych modelov. Pracujú tiež na štúdii, ktorá skúma, ako umiestnenie osoby v USA formuje rozdiely v mikrobiómoch chronických rán.

„Texas Tech poskytuje dobrú podporu pre výskum a neustále pracuje na raste, „Povedal Phillips.“ Môj výskum, ako väčšina ostatných, bola vo všeobecnosti posilnená akademickou slobodou poskytovanou na univerzite. Laboratórium výskumu prírodných vied je prvotriednou zbierkou prírodnej histórie, a vzorky archivované v zbierke genetických zdrojov mi umožnili navrhnúť štúdie, ako je táto, ktoré by inak neboli možné. Tvrdá práca a kreativita doktoranda Craiga Tiptona boli nevyhnutné pre úspech tohto projektu, ako bola spolupráca s laboratóriami Nicole Phillipsovej z UNTHSC a Kendry P. Rumbaughovej z TTUHSC, Profesor Todd Little z Texas Tech College of Education, SWRWCC a NSRL. “

• Výskum ukazuje, že mikrobióm jazyka by mohol pomôcť diagnostikovať srdcové zlyhanie
• Špecifické zmeny v DNA ovplyvňujú existenciu a množstvo črevných baktérií,