Pasientgenetikk assosiert med sårmikrobiomsammensetning og helbredelse

I en første studie i sitt slag, forskere har fastslått at genetikk kan spille en rolle i hvordan sår leges. Caleb Phillips, en assisterende professor ved Texas Tech University og direktør for Phillips Laboratory i Institutt for biologiske vitenskaper, og doktorgradsstudent Craig Tipton ledet studien, "Pasientgenetikk er knyttet til kronisk sårmikrobiomsammensetning og helbredelse, "publisert torsdag (18. juni) i åpen tilgang, fagfellevurderte medisinske tidsskriftet PLOS Pathogens.

Phillips, som også fungerer som kurator for genetiske ressurser ved Natural Science Research Laboratory (NSRL) Robert J. Baker Genetic Resources Collection, sa at studien bestemte at visse gener er forbundet med antall bakterier og overflod av vanlige patogener i sår. Samlingen av mikrober, kjent som et "mikrobiom, "kan bestemme hvordan et sår heler og hvor lang tid den prosessen tar. Forskningen viste også at jo mer mangfoldet i et sårmikrobiom, jo mindre tid det tok å helbrede.

Pasienter som besøkte Lubbocks Southwest Regional Wound Care Center (SWRWCC) for behandling av et infisert sår i nedre ekstremiteter samtykket i deltakelse i studien og ga prøver fra sårene og fra en kinnpinne. Studien brukte mikrobiomprofilering, genomfingeravtrykk, validering av våte laboratorier, bildebehandling og modellutvikling for å analysere prøver og data, og inkluderte forskere fra Texas Tech, Texas Tech University Health Science Center (TTUHSC), SWRWCC og University of North Texas Health Science Center i Fort Worth (UNTHSC).

Vi viste at det er identifiserbare steder i folks genom der, avhengig av genotype, de har en tendens til å få infeksjoner av spesifikke bakterier. De forskjellige identifiserte genomiske stedene har en tendens til å være relatert når det gjelder typer gener de er i nærheten av og kan regulere. En arbeidshypotese som kommer fra forskningen er at genetiske forskjeller som påvirker gener som koder måten cellene våre samhandler med miljøet og hverandre er viktige for infeksjonsforskjeller. "

Caleb Phillips, Assisterende professor, Texas Tech University

Selv om det fortsatt er arbeid som må gjøres før forskningen kommer pasienter direkte til gode, Tipton sa at studien er et viktig og lovende skritt i den retningen.

"Personlig medisin er et aktuelt tema i moderne helsevesen, hvor målet er å identifisere iboende forskjeller mellom individer som kan føre til at de påvirkes ulikt av sykdom og finne behandlinger som er godt tilpasset og tilpasset den enkelte og kan bidra til bedre pasientutfall, "Tipton sa." Prosjektet vårt fremmer to like interessante forskningsveier med potensiell oversettelse til klinikken. I en, det er vårt mål å utvikle robuste genomiske prediktive modeller som kan hjelpe leger med å bestemme pasientens risiko for kronisk sårinfeksjon, spesielt for spesifikke bakterier.

"I det andre, dette arbeidet bidrar til å informere om hvordan genetisk variasjon hos pasienter kan påvirke mikrobiom-vert-interaksjoner og patogenese av sårinfeksjoner. Ved å studere infeksjonens patogenese og hvordan disse komplekse mikrobielle samfunnene samhandler, Det kan være mulig å forbedre eksisterende terapier eller å utvikle nye terapeutiske strategier helt. "

Phillips sa at han ser frem til å fortsette sin forskning ved Texas Tech. Laboratoriet hans utvikler en oppfølgingsstudie som han håper vil samle inn nok informasjon til å lage nøyaktige prediktive modeller. De jobber også med en studie som undersøker hvordan en persons beliggenhet i USA former forskjeller i kroniske sårmikrobiomer.

"Texas Tech gir god støtte til forskning og jobber kontinuerlig for vekst, "Sa Phillips." Min forskning, som de fleste andre, har generelt blitt forsterket av den akademiske friheten ved universitetet. Natural Science Research Laboratory er en fremste naturhistorisk samling, og prøvene som ble arkivert i Genetic Resources Collection har tillatt meg å designe studier som denne som ellers ikke hadde vært mulig. Arbeidet og kreativiteten til doktorand Craig Tipton var avgjørende for å lykkes med dette prosjektet, som var samarbeid med laboratoriene til Nicole Phillips ved UNTHSC og Kendra P. Rumbaugh ved TTUHSC, Professor Todd Little ved Texas Tech College of Education, SWRWCC og NSRL. "

• Forskning viser at tungemikrobiom kan hjelpe til med å diagnostisere hjertesvikt
• Spesifikke endringer i DNA påvirker eksistensen og mengden av tarmbakterier,