Genetika pacienta, povezana s sestavo in celjenjem mikrobiomov ran

V prvi tovrstni študiji, Raziskovalci so ugotovili, da ima genetika lahko vlogo pri zdravljenju ran. Caleb Phillips, docent na Texas Tech University in direktor laboratorija Phillips na Oddelku za biološke znanosti, in doktorski študent Craig Tipton je vodil študijo, "Genetika pacienta je povezana s sestavo mikrobioma kronične rane in celjenjem, "objavljeno v četrtek (18. junij) v odprtem dostopu, recenzirana medicinska revija PLOS Pathogens.

Phillips, ki je tudi kustos genetskih virov v zbirki genetskih virov naravoslovnega raziskovalnega laboratorija (NSRL), Robert J. Baker, je študija ugotovila, da so nekateri geni povezani s številom bakterij in številčnostjo pogostih patogenov v ranah. Zbirka mikrobov, znan kot "mikrobiom", "lahko določi, kako se rana zaceli in kako dolgo traja ta proces. Raziskava je pokazala tudi, da večja raznolikost znotraj mikrobioma rane, manj časa je trajalo, da se ozdravi.

Bolniki, ki so obiskovali Lubbockov jugozahodni regionalni center za oskrbo ran (SWRWCC) za nego rane na spodnjih okončinah, so privolili v sodelovanje v študiji in dali vzorce iz rane (-ov) in iz brisa ličnic. Študija je uporabila profiliranje mikrobiomov, prstni odtis genoma, mokro laboratorijsko potrjevanje, slikanje in razvoj modelov za analizo vzorcev in podatkov, in vključeval raziskovalce iz Texas Tech, Zdravstveni znanstveni center Univerze v Teksasu (TTUHSC), SWRWCC in Zdravstveni znanstveni center Univerze v Severnem Teksasu v Fort Worthu (UNTHSC).

Pokazali smo, da v genomu ljudi obstajajo prepoznavne lokacije, kjer, odvisno od njihovega genotipa, ponavadi okužijo posebne bakterije. Različne identificirane genomske lokacije so običajno povezane z vrstami genov, ki so jim blizu in jih lahko urejajo. Delovna hipoteza, ki izhaja iz raziskave, je, da so genetske razlike, ki vplivajo na gene, ki kodirajo način medsebojnega delovanja naših celic z okoljem in med seboj, pomembne za razlike v okužbi. "

Caleb Phillips, Docent, Texas Tech University

Čeprav je treba še opraviti veliko dela, preden bo raziskava neposredno koristila bolnikom, Tipton je dejal, da je študija pomemben in obetaven korak v tej smeri.

"Osebna medicina je trenutno vroča tema v sodobnem zdravstvu, kadar je cilj ugotoviti inherentne razlike pri posameznikih, ki bi lahko povzročile drugačen vpliv bolezni, in iskanje zdravljenja, ki je posamezniku primerno in prilagojeno ter lahko prispeva k boljšim rezultatom pacienta, "Je dejal Tipton." Naš projekt spodbuja dve enako zanimivi poti raziskav s potencialnim prevodom na kliniko. V enem, naš cilj je razviti robustne genomske napovedne modele, ki bi zdravnikom lahko pomagali ugotoviti bolnikovo tveganje za kronično okužbo ran, zlasti za posebne bakterije.

"V drugem, To delo pomaga ugotoviti, kako lahko genetske variacije pri bolnikih vplivajo na interakcije mikrobioma-gostitelja in patogenezo okužbe ran. Z nadaljnjim proučevanjem patogeneze okužbe in medsebojnega delovanja teh kompleksnih mikrobnih skupnosti, morda bo mogoče izboljšati obstoječe terapije ali v celoti razviti nove terapevtske strategije. "

Phillips je dejal, da se veseli nadaljevanja raziskav na Texas Tech. Njegov laboratorij razvija nadaljnjo študijo, za katero upa, da bo zbrala dovolj informacij za ustvarjanje natančnih modelov napovedovanja. Delajo tudi na študiji, ki raziskuje, kako lokacija osebe v ZDA oblikuje razlike v mikrobiomih kroničnih ran.

"Texas Tech zagotavlja dobro podporo za raziskave in si nenehno prizadeva za rast, "Je rekel Phillips." Moje raziskave, tako kot večina drugih, je na splošno okrepila akademska svoboda na univerzi. Naravoslovni raziskovalni laboratorij je vrhunska zbirka naravoslovja, in vzorci, arhivirani v zbirki genetskih virov, so mi omogočili oblikovanje študij, kot je ta, ki sicer ne bi bila mogoča. Trdo delo in ustvarjalnost doktoranda Craiga Tiptona sta bili bistveni za uspeh tega projekta, tako kot sodelovanje z laboratoriji Nicole Phillips na UNTHSC in Kendra P. Rumbaugh na TTUHSC, Profesor Todd Little na Texas Tech College of Education, SWRWCC in NSRL. "

• Raziskave kažejo, da bi mikrobiom jezika lahko pomagal pri diagnosticiranju srčnega popuščanja
• Posebne spremembe v DNK vplivajo na obstoj in količino črevesnih bakterij,