Génétique des patients associée à la composition et à la cicatrisation du microbiome de la plaie

Dans une étude inédite, les chercheurs ont déterminé que la génétique peut jouer un rôle dans la façon dont les plaies guérissent. Caleb Phillips, professeur assistant à la Texas Tech University et directeur du Phillips Laboratory au Département des sciences biologiques, et le doctorant Craig Tipton a dirigé l'étude, "La génétique des patients est liée à la composition et à la cicatrisation du microbiome des plaies chroniques, " publié jeudi (18 juin) en libre accès, revue médicale à comité de lecture PLOS Pathogens.

Philippe, qui est également conservateur des ressources génétiques à la collection de ressources génétiques Robert J. Baker du Natural Science Research Laboratory (NSRL), a déclaré que l'étude a déterminé que certains gènes sont associés au nombre de bactéries et à l'abondance d'agents pathogènes communs dans les plaies. La collection de microbes, connu sous le nom de « microbiome », " peut déterminer comment une plaie guérit et combien de temps ce processus prend. La recherche a également montré que plus le microbiome d'une plaie est diversifié, moins il a fallu de temps pour guérir.

Les patients visitant le centre régional de soins des plaies du sud-ouest de Lubbock (SWRWCC) pour les soins d'une plaie infectée des membres inférieurs ont consenti à participer à l'étude et ont fourni des échantillons de leur(s) plaie(s) et d'un écouvillonnage de la joue. L'étude a utilisé le profilage du microbiome, empreintes génétiques, validation en laboratoire humide, imagerie et développement de modèles pour analyser les échantillons et les données, et inclus des chercheurs de Texas Tech, le Texas Tech University Health Science Center (TTUHSC), le SWRWCC et le Centre des sciences de la santé de l'Université du Nord du Texas à Fort Worth (UNTHSC).

Nous avons montré qu'il existe des emplacements identifiables dans le génome des personnes où, selon leur génotype, ils ont tendance à contracter des infections par des bactéries spécifiques. Les différentes localisations génomiques identifiées ont tendance à être liées en termes de types de gènes dont elles sont proches et peuvent réguler. Une hypothèse de travail émergeant de la recherche est que les différences génétiques influençant les gènes codant la façon dont nos cellules interagissent avec l'environnement et entre elles sont importantes pour les différences d'infection. »

Caleb Phillips, Maître assistant, Université de technologie du Texas

Bien qu'il reste encore du travail à faire avant que la recherche ne profite directement aux patients, Tipton a déclaré que l'étude est une étape importante et prometteuse dans cette direction.

"La médecine personnalisée est un sujet brûlant d'actualité dans les soins de santé modernes, où l'objectif est d'identifier les différences inhérentes au sein des individus qui peuvent les amener à être affectés différemment par la maladie et de trouver des traitements qui sont bien adaptés et adaptés à l'individu et peuvent contribuer à de meilleurs résultats pour les patients, " Tipton a déclaré. "Notre projet favorise deux voies de recherche tout aussi intéressantes avec une traduction potentielle à la clinique. Dans une, notre objectif est de développer des modèles prédictifs génomiques robustes qui pourraient aider les médecins à déterminer le risque d'infection chronique d'une plaie chez un patient, en particulier à des bactéries spécifiques.

"Dans la seconde, ce travail aide à expliquer comment la variation génétique chez les patients peut influencer les interactions microbiome-hôte et la pathogenèse des infections des plaies. En étudiant davantage la pathogenèse de l'infection et la façon dont ces communautés microbiennes complexes interagissent, il peut être possible d'améliorer les thérapies existantes ou de développer complètement de nouvelles stratégies thérapeutiques. »

Phillips a déclaré qu'il était impatient de poursuivre ses recherches à Texas Tech. Son laboratoire développe une étude de suivi qui, espère-t-il, recueillera suffisamment d'informations pour créer des modèles prédictifs précis. Ils travaillent également sur une étude explorant comment l'emplacement d'une personne aux États-Unis façonne les différences dans les microbiomes des plaies chroniques.

"Texas Tech apporte un bon support à la recherche et travaille en permanence pour la croissance, " a déclaré Phillips. " Mes recherches, comme celui de la plupart des autres, a été généralement renforcée par la liberté académique offerte à l'université. Le Laboratoire de recherche en sciences naturelles est une collection d'histoire naturelle de premier plan, et les échantillons archivés à la Collection des ressources génétiques m'ont permis de concevoir des études comme celle-ci qui n'auraient pas été possibles autrement. Le travail acharné et la créativité du doctorant Craig Tipton ont été essentiels à la réussite de ce projet, tout comme la collaboration avec les laboratoires de Nicole Phillips à UNTHSC et Kendra P. Rumbaugh à TTUHSC, Le professeur Todd Little du Texas Tech College of Education, le SWRWCC et le NSRL."

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