Patientgenetik forbundet med sårmikrobiomsammensætning og heling

I en første undersøgelse af sin art, forskere har fastslået, at genetik kan spille en rolle i, hvordan sår heler. Caleb Phillips, en adjunkt ved Texas Tech University og direktør for Phillips Laboratory i Institut for Biologiske Videnskaber, og doktorand Craig Tipton ledede undersøgelsen, "Patientgenetik er forbundet med kronisk sårmikrobiomsammensætning og helbredelse, "offentliggjort torsdag (18. juni) i open-access, peer-reviewed medicinsk journal PLOS Pathogener.

Phillips, der også fungerer som kurator for genetiske ressourcer ved Natural Science Research Laboratory's (NSRL) Robert J. Baker Genetic Resources Collection, sagde undersøgelsen fastslået, at visse gener er forbundet med antallet af bakterier og overflod af almindelige patogener i sår. Samlingen af ​​mikrober, kendt som et "mikrobiom, "kan bestemme, hvordan et sår heler, og hvor lang tid den proces tager. Undersøgelsen viste også, at jo mere mangfoldigheden i et sårmikrobiom, jo mindre tid det tog at helbrede.

Patienter, der besøgte Lubbocks Southwest Regional Wound Care Center (SWRWCC) til pleje af et inficeret sår i den nedre ekstremitet, gav samtykke til deltagelse i undersøgelsen og leverede prøver fra deres sår og fra en kindpind. Undersøgelsen brugte mikrobiomprofilering, genomets fingeraftryk, validering af vådt laboratorium, billeddannelse og modeludvikling til analyse af prøver og data, og omfattede forskere fra Texas Tech, Texas Tech University Health Science Center (TTUHSC), SWRWCC og University of North Texas Health Science Center i Fort Worth (UNTHSC).

Vi viste, at der er identificerbare steder i folks genom, hvor, afhængigt af deres genotype, de har en tendens til at få infektioner af bestemte bakterier. De forskellige genomiske steder, der identificeres, har en tendens til at være relateret til de gener, de er tæt på og kan regulere. En arbejdshypotese, der stammer fra forskningen, er, at genetiske forskelle, der påvirker gener, der koder for vores celles interaktion med miljøet og hinanden, er vigtige for infektionsforskelle. "

Caleb Phillips, Assisterende professor, Texas Tech University

Selvom der stadig er arbejde, der skal udføres, før forskningen direkte gavner patienter, Tipton sagde, at undersøgelsen er et vigtigt og lovende skridt i den retning.

"Personlig medicin er et aktuelt emne inden for moderne sundhedspleje, hvor målet er at identificere iboende forskelle inden for individer, der kan få dem til at blive påvirket forskelligt af sygdom og finde behandlinger, der er velegnede og skræddersyet til den enkelte og kan bidrage til bedre patientresultater, "Tipton sagde." Vores projekt fremmer to lige så interessante forskningsveje med potentiel oversættelse til klinikken. I en, det er vores mål at udvikle robuste genomiske forudsigelsesmodeller, der kan hjælpe læger med at bestemme en patients risiko for kronisk sårinfektion, især for bestemte bakterier.

"I det andet, dette arbejde hjælper med at informere om, hvordan genetisk variation hos patienter kan påvirke mikrobiom-vært-interaktioner og sårinfektionspatogenese. Ved yderligere at studere infektionspatogenese og hvordan disse komplekse mikrobielle samfund interagerer, det kan være muligt at forbedre eksisterende terapier eller helt at udvikle nye terapeutiske strategier. "

Phillips sagde, at han ser frem til at fortsætte sin forskning på Texas Tech. Hans laboratorium udvikler en opfølgende undersøgelse, som han håber vil indsamle nok information til at skabe præcise forudsigelsesmodeller. De arbejder også på en undersøgelse, der undersøger, hvordan en persons placering i USA former forskelle i kroniske sårmikrobiomer.

"Texas Tech yder god støtte til forskning og arbejder konstant på vækst, "Sagde Phillips." Min forskning, ligesom de fleste andre, er generelt blevet forstærket af den akademiske frihed på universitetet. Natural Science Research Laboratory er en førende naturhistorisk samling, og prøverne arkiveret i Genetic Resources Collection har givet mig mulighed for at designe undersøgelser som denne, som ellers ikke ville have været mulige. Doktorand Craig Tiptons hårde arbejde og kreativitet var afgørende for dette projekts succes, ligesom samarbejdet med laboratorierne fra Nicole Phillips ved UNTHSC og Kendra P. Rumbaugh på TTUHSC, Professor Todd Little ved Texas Tech College of Education, SWRWCC og NSRL. "

• Forskning viser, at tungenmikrobiom kan hjælpe med at diagnosticere hjertesvigt
• Specifikke ændringer i DNA påvirker eksistensen og mængden af ​​tarmbakterier,