Генетика пациента, связанная с составом микробиома раны и заживлением

В первом в своем роде исследовании исследователи определили, что генетика может играть роль в заживлении ран. Калеб Филлипс, доцент Техасского технологического университета и директор лаборатории Филлипса Департамента биологических наук, и докторант Крейг Типтон провели исследование, "Генетика пациента связана с составом микробиома хронической раны и ее заживлением, »опубликовано в четверг (18 июня) в открытом доступе, рецензируемый медицинский журнал PLOS Pathogens.

Филлипс, который также является куратором генетических ресурсов в коллекции генетических ресурсов Роберта Дж. Бейкера Лаборатории естественных исследований (NSRL), сказанное исследование определило что определенные гены связаны с числом бактерий и обилием общих патогенов в ранах. Сбор микробов, известный как "микробиом", «может определить, как заживает рана и сколько времени занимает этот процесс. Исследование также показало, что большее разнообразие в микробиоме раны, тем меньше времени потребовалось на заживление.

Пациенты, посещающие Юго-Западный региональный центр лечения ран Лаббока (SWRWCC) для лечения инфицированной раны нижней конечности, дали согласие на участие в исследовании и предоставили образцы из своей раны (ран) и мазка из щеки. В исследовании использовалось профилирование микробиома, дактилоскопия генома, проверка влажной лаборатории, создание изображений и моделей для анализа образцов и данных, и включали исследователей из Техасского технологического института, Центр медицинских наук Техасского технологического университета (TTUHSC), SWRWCC и Центр медицинских наук Университета Северного Техаса в Форт-Уэрте (UNTHSC).

<цитата>

Мы показали, что в геноме людей есть идентифицируемые участки, где, в зависимости от их генотипа, они имеют тенденцию заражаться определенными бактериями. Выявленные различные местоположения генома имеют тенденцию быть связаны с точки зрения типов генов, к которым они близки и могут регулировать. Рабочая гипотеза, вытекающая из исследования, заключается в том, что генетические различия, влияющие на гены, кодирующие то, как наши клетки взаимодействуют с окружающей средой и друг с другом, важны для различий в инфекциях ".

Калеб Филлипс, Доцент, Техасский технический университет

Хотя еще предстоит проделать работу, прежде чем исследование принесет прямую пользу пациентам, Типтон сказал, что это исследование является важным и многообещающим шагом в этом направлении.

«Персонализированная медицина - актуальная тема в современном здравоохранении, где цель состоит в том, чтобы выявить внутренние различия между людьми, которые могут привести к тому, что болезнь по-разному влияет на них, и найти методы лечения, которые хорошо подходят и адаптированы для каждого человека и могут способствовать улучшению результатов лечения пациентов, - сказал Типтон. - Наш проект развивает два одинаково интересных направления исследований с потенциальным переводом в клинику. В одном, наша цель - разработать надежные модели прогнозирования генома, которые могут помочь врачам определить риск хронической раневой инфекции у пациента, особенно к конкретным бактериям.

"Во-вторых, Эта работа помогает понять, как генетические вариации у пациентов могут влиять на взаимодействия микробиома и хозяина и патогенез раневой инфекции. Путем дальнейшего изучения патогенеза инфекции и того, как взаимодействуют эти сложные микробные сообщества, возможно, удастся улучшить существующие методы лечения или вообще разработать новые терапевтические стратегии ».

Филлипс сказал, что с нетерпением ждет продолжения своих исследований в Texas Tech. Его лаборатория разрабатывает дополнительное исследование, которое, как он надеется, соберет достаточно информации для создания точных прогнозных моделей. Они также работают над исследованием, изучающим, как местоположение человека в США влияет на различия в микробиомах хронических ран.

"Texas Tech обеспечивает хорошую поддержку исследований и постоянно работает над развитием, - сказал Филлипс. - Мои исследования, как и у большинства других, в целом была улучшена академической свободой, предоставляемой в университете. Лаборатория естественных наук - это главная коллекция естествознания, а образцы, заархивированные в Коллекции генетических ресурсов, позволили мне разработать исследования, подобные этому, которые в противном случае были бы невозможны. Тяжелая работа и креативность докторанта Крейга Типтона сыграли важную роль в успехе этого проекта. а также сотрудничество с лабораториями Николь Филлипс в UNTHSC и Кендры П. Рамбо в TTUHSC, Профессор Тодд Литтл из Техасского педагогического колледжа, SWRWCC и NSRL ".

• Исследования показывают, что микробиом языка может помочь диагностировать сердечную недостаточность
• Специфические изменения в ДНК влияют на существование и количество кишечных бактерий,