"Prvič pokažemo, kaj se zgodi v možganih ploda, ki jih prizadene prirojeni Zika sindrom [ CZS ], "Helder Nakaya, kdo je zadnji avtor prispevka, je povedala Agência FAPESP. Nakaya je specialistka za bioinformatiko, profesor na Fakulteti za farmacevtske znanosti Univerze v São Paulu (FCF-USP), in višji znanstvenik na Centru za raziskave vnetnih bolezni (CRID), ki je ena izmed raziskav, Centri za inovacije in razširjanje (RIDC), ki jih financira FAPESP.
Raziskovalci so primerjali možgansko tkivo dojenčkov, ki so umrli zaradi CZS, z vzorci tkiva dojenčkov, ki so umrli zaradi drugih vzrokov.
Starši, ki so nam v času takšne žalosti dovolili zbiranje teh vzorcev, so bili izjemno altruistični. Motivirala jih je vednost, da je ta donacija pomagala znanosti in da bi znanost v prihodnosti lahko pomagala drugim. "
Helder Nakaya, zadnji avtor prispevka
Primerjava je pokazala več anomalij v možganih dojenčkov s CZS. "Analiza možganskega genoma [ vsa DNK ], transkriptom [ RNA, prepisane iz genov ] in proteom [ beljakovine, proizvedene z uporabo messenger RNA ] je pokazala številne pomembne molekularne spremembe v genih, povezanih z razvojem nevronov, možna disregulacija nevrotransmiterjev, kot je glutamat, in celo spremembe v različnih vrstah kolagena, "Je rekla Nakaya.
Raziskovalci so integrirali podatke o transkriptomiki in proteomiki za identifikacijo mikroRNA (miRNA), ki ne kodirajo beljakovin, ampak uravnavajo izražanje genov in so lahko povezane s CZS. Eden od teh, mir-17-5p, je bilo v prejšnjih raziskavah ugotovljeno, da je povezano z virusno okužbo v kultiviranih astrocitih, najpogostejša vrsta celic centralnega živčnega sistema.
"Druge pomembne ugotovitve vključujejo genetske variante ključnih proteinov, ki sodelujejo pri razvoju imunskega sistema in živčnega sistema, "Je dejal Nakaya." Te ugotovitve lahko pojasnijo povečano dovzetnost za CZS pri dojenčkih s temi genetskimi različicami. Končno, ko smo integrirali vse tri vrste podatkov [ genomika, transkriptomika in proteomika ], ugotovili smo spremembe v signalnih poteh, povezanih z organizacijo zunajceličnega matriksa, kar lahko delno pojasni značilnosti CZS. "Zunajcelični matriks je niz makromolekul, ki jih izločajo celice in deluje kot strukturni oder, ki uravnava celično diferenciacijo in rast tkiv ter prispeva k vzdrževanju organov, med drugimi funkcijami.
Bioinformatični del študije je bil intenziven zaradi ogromne količine pridobljenih podatkov, po besedah Nakaye. "Človeška DNK vsebuje 3,2 milijarde baznih parov, ki lahko ustvari 150, 000 prepisov [ tako kodirajoče kot nekodirajoče RNA ] in kodira več kot 25, 000 beljakovin, "je dejal." Vključevanje toliko bioloških informacij je bilo mogoče le z multidisciplinarno ekipo, ki je vključevala znanstvenike iz več odličnih raziskovalnih ustanov. "
Znanost potrebuje čas, in to ni vedno razumljivo, Je dodala Nakaya. "Izbruh Zika se je začel leta 2015, in šele zdaj imamo te rezultate. Znanstvenih raziskav ni mogoče izvesti čez noč. Vem, da si vsi želijo hitrih odgovorov, dejstvo pa je, da če postopek pospešite umetno, tvegate, da boste dobili slabo znanost, " rekel je.
Neobdelani podatki so javno dostopni, tako da lahko znanstvena skupnost opravi lastne analize in poglobljeno preuči vlogo vsake molekule, opisane v prispevku.