"Mostriamo per la prima volta cosa succede nel cervello fetale affetto da sindrome di Zika congenita [ CZS ], "Helder Nakaya, chi è l'ultimo autore dell'articolo, ha detto ad Agência FAPESP. Nakaya è uno specialista in bioinformatica, un professore presso la Scuola di Scienze Farmaceutiche dell'Università di San Paolo (FCF-USP), e uno scienziato senior presso il Centro di ricerca sulle malattie infiammatorie (CRID), che è una delle Ricerche, Centri di Innovazione e Disseminazione (RIDC) finanziati da FAPESP.
I ricercatori hanno confrontato il tessuto cerebrale di bambini morti per CZS con campioni di tessuto di bambini morti per altre cause.
I genitori che ci hanno dato il permesso di raccogliere questi campioni in un momento di tale dolore sono stati eccezionalmente altruisti. Erano motivati dalla consapevolezza che questa donazione aiutava la scienza e che la scienza poteva aiutare gli altri in futuro".
Helder Nakaya, ultimo autore dell'articolo
Il confronto ha rivelato diverse anomalie nel cervello dei bambini con CZS. "Analisi del genoma cerebrale [ tutto il DNA ], trascrittoma [ RNA trascritti da geni ] e proteoma [ proteine prodotte utilizzando RNA messaggeri ] ha mostrato una serie di significative alterazioni molecolari nei geni legati allo sviluppo dei neuroni, la possibile disregolazione dei neurotrasmettitori come il glutammato e persino alterazioni in diversi tipi di collagene, " ha detto Nakaya.
I ricercatori hanno integrato i dati di trascrittomica e proteomica per identificare i microRNA (miRNA) che non codificano proteine ma regolano l'espressione genica e possono essere collegati alla CZS. Uno di questi, mir-17-5p, è stato trovato in precedenti ricerche per essere associato con l'infezione virale negli astrociti coltivati, il tipo più abbondante di cellula del sistema nervoso centrale.
"Altri risultati importanti includono varianti genetiche di proteine chiave coinvolte nello sviluppo del sistema immunitario e del sistema nervoso, " Nakaya ha detto. "Questi risultati possono spiegare la maggiore suscettibilità alla CZS nei bambini che hanno queste varianti genetiche. Finalmente, quando abbiamo integrato tutti e tre i tipi di dati [ genomica, trascrittomica e proteomica ], abbiamo trovato alterazioni nelle vie di segnalazione legate all'organizzazione della matrice extracellulare, che può in parte spiegare le caratteristiche della CZS." La matrice extracellulare è una matrice di macromolecole secrete dalle cellule che agisce come un'impalcatura strutturale che regola la differenziazione cellulare e la crescita dei tessuti e contribuisce al mantenimento degli organi, tra le altre funzioni.
La parte bioinformatica dello studio è stata intensa a causa dell'enorme volume di dati generati, secondo Nakaya. "Il DNA umano contiene 3,2 miliardi di paia di basi, che può generare 150, 000 trascrizioni [ RNA sia codificanti che non codificanti per proteine ] e codificare più di 25, 000 proteine, " ha detto. "L'integrazione di così tante informazioni biologiche è stata possibile solo da un team multidisciplinare che includeva scienziati di diversi eccellenti istituti di ricerca".
La scienza richiede tempo, e questo non sempre si capisce, Nakaya ha aggiunto. "L'epidemia di Zika è iniziata nel 2015, e solo ora abbiamo questi risultati. La ricerca scientifica non può essere svolta dall'oggi al domani. So che tutti vogliono risposte in fretta, ma il fatto è che se acceleri artificialmente il processo, rischi di fare una cattiva scienza, " Egli ha detto.
I dati grezzi sono pubblicamente disponibili in modo che la comunità scientifica possa eseguire le proprie analisi e approfondire il ruolo di ogni molecola descritta nel documento.