"Prvi put pokazujemo što se događa u fetalnom mozgu pogođenom kongenitalnim Zika sindromom [ CZS ], "Helder Nakaya, koji je posljednji autor rada, rekao je Agência FAPESP. Nakaya je specijalist za bioinformatiku, profesor na Fakultetu farmaceutskih znanosti Sveučilišta São Paulo (FCF-USP), i viši znanstvenik u Centru za istraživanje upalnih bolesti (CRID), koje je jedno od istraživanja, Centri za inovacije i diseminaciju (RIDC) financirani od strane FAPESP -a.
Znanstvenici su usporedili moždano tkivo beba umrlih od CZS -a s uzorcima tkiva beba koje su umrle iz drugih uzroka.
Roditelji koji su nam dali dopuštenje da prikupimo te uzorke u vrijeme takve tuge bili su iznimno altruistični. Motivirali su ih spoznajom da je ova donacija pomogla znanosti i da bi znanost mogla pomoći drugima u budućnosti. "
Helder Nakaya, posljednji autor rada
Usporedba je otkrila nekoliko anomalija u mozgu beba sa CZS -om. "Analiza genoma mozga [ cijelu DNK ], transkriptom [ RNA prepisane iz gena ] i proteom [ proteini proizvedeni pomoću glasničkih RNA ] su pokazale brojne značajne molekularne promjene u genima povezane s razvojem neurona, moguća disregulacija neurotransmitera poput glutamata, pa čak i promjene u različitim vrstama kolagena, "Rekla je Nakaya.
Znanstvenici su integrirali transkriptomijske i proteomičke podatke kako bi identificirali mikroRNA (miRNA) koje ne kodiraju proteine, ali reguliraju ekspresiju gena i mogu biti povezane sa CZS. Jedan od ovih, mir-17-5p, u prethodnim istraživanjima utvrđeno je da je povezana s virusnom infekcijom u uzgojenim astrocitima, najrasprostranjenija vrsta stanica središnjeg živčanog sustava.
"Ostali važni nalazi uključuju genetske varijante ključnih proteina uključenih u razvoj imunološkog sustava i živčanog sustava, "Nakaya je rekla." Ovi nalazi mogu objasniti povećanu osjetljivost na CZS kod beba koje imaju te genetske varijante. Konačno, kada smo integrirali sve tri vrste podataka [ genomika, transkriptomika i proteomika ], pronašli smo promjene u signalnim putovima povezanim s organizacijom izvanstaničnog matriksa, što djelomično može objasniti značajke CZS -a. "Izvanstanični matriks je niz makromolekula koje luče stanice, a djeluje kao strukturna skela koja regulira staničnu diferencijaciju i rast tkiva te pridonosi održavanju organa, između ostalih funkcija.
Bioinformatički dio studije bio je intenzivan zbog ogromne količine generiranih podataka, prema Nakayi. "Ljudska DNK sadrži 3,2 milijarde parova baza, koji može generirati 150, 000 prijepisa [ i kodirajuće i nekodirajuće RNA ] i kodirati više od 25, 000 proteina, "Integriranje toliko bioloških informacija bilo je moguće samo od multidisciplinarnog tima koji je uključivao znanstvenike iz nekoliko izvrsnih istraživačkih institucija."
Znanosti treba vremena, i to se ne razumije uvijek, Dodao je Nakaya. "Epidemija Zika počela je 2015. i tek sada imamo ove rezultate. Znanstveno istraživanje ne može se provesti preko noći. Znam da svi žele odgovore brzo, ali činjenica je da ako umjetno ubrzate proces, riskirate da dobijete lošu znanost, " On je rekao.
Sirovi podaci javno su dostupni kako bi znanstvena zajednica mogla provesti vlastite analize i dubinski istražiti ulogu svake molekule opisane u radu.