Výskum publikovaný v časopise Mikrobiálna genomika hodnotili, ako sa diverzita a zloženie črevného mikrobiómu líši počas pobytu pacientov na jednotke intenzívnej starostlivosti (JIS). Črevný mikrobióm je komplexné spoločenstvo baktérií a iných mikróbov, ktoré sa nachádzajú v čreve, a hrá dôležitú úlohu v zdraví a pohode.
Črevnú mikrobiálnu diverzitu pacientov na JIS pravdepodobne zníži niekoľko faktorov, vystavenie ich vyššiemu riziku infekcie - medzi ne patrí asistovaná ventilácia, enterické kŕmenie a niektoré lieky.
Napriek tomu, že testovaní pacienti boli prijatí na JIS z rôznych dôvodov, dve tretiny vykazovali v určitej fáze svojho pobytu výrazné zníženie mikrobiálnej diverzity. Do štúdie bolo zaradených 24 pacientov, s vekom od 25 do 85 rokov. Dôvody prijatia sú rôzne, a zahŕňal traumu, infarkt a rakovina.
Podľa profesora Marka Pallena (Quadram Institute, Spojené kráľovstvo), ktorý viedol výskum, dôležitý je rozmanitý mikrobióm.
Črevný mikrobióm plní mnoho dôležitých a rozmanitých rolí a mnohé z týchto rolí je možné stratiť, ak sa stratí mikrobiálna diverzita. Pravdepodobne to bude mať vplyv na výživu, pohyblivosť čriev a zápal v čreve.
Mark Pallen, Vedúci štúdie a profesor, Quadram Institute, UK
Vedci zistili, že u pacientov s dlhodobým pobytom na JIS v črevnom mikrobióme dominovali baktérie s potenciálom stať sa patogénnymi:„V črevnom mikrobióme je zvyčajne domovom veľmi rozmanitého súboru mikrobiálnych druhov, číslovanie v stovkách, s relatívne rovnomerným rozšírením početností. Ale u pacientov na JIS jeden organizmus môže prevziať mikrobióm, takže drvivá väčšina mikrobiálnych buniek a sekvencií patrí iba jednému druhu.
„Bolo šokujúce sledovať, ako rýchlo a ako často sa táto rozmanitá komunita môže zrútiť, aby medzi kriticky chorými pacientmi začala monolitická nadvláda jedného patogénu.“
Výskumný tím použil techniku nazývanú metagenomika brokovnice na určenie, ktoré baktérie sa nachádzajú v čreve. Zahŕňalo to extrakciu a sekvenovanie DNA zo vzoriek stolice, aby sa určilo, ktoré mikróby sú prítomné.
Profesor Pallen povedal:"Videli sme Enterococcus faecium najčastejšie to vyvoláva obavy, pretože ide o dôležitý a bežný patogén medzi hospitalizovanými pacientmi. Ešte znepokojujúcejšie, zistili sme dôkazy o rozšírení jedného kmeňa medzi troch pacientov. “
E. faecium môže spôsobiť závažné infekcie, najmä na miestach, kde sa používali zdravotnícke pomôcky - ako napríklad intravenózne kanyly. Ak sa tieto baktérie dostanú do krvného obehu, môžu spôsobiť smrteľnú infekciu. Enterokokové infekcie sú obzvlášť ťažko liečiteľné, pretože mnohé druhy v tejto skupine si vyvinuli rezistenciu na viacnásobné antibiotiká, vrátane antibiotika vankomycínu poslednej inštancie.
Ovládnutie čreva jedným potenciálnym patogénom môže ohroziť ostatných pacientov v nemocnici, podľa Pallena. Povedal, „Keď sa jeden potenciálne patogénny mikrób v biomase v tomto konkrétnom mieste výrazne zvýši, potom je pravdepodobnejšie, že sa rozleje do iných oddelení tela, napríklad, krv alebo pľúca, kde môže spôsobiť život ohrozujúce ochorenie.
Čo je viac, potom sa pravdepodobne rozšíri na ďalších pacientov, uľahčenie šírenia patogénov odolných voči viacerým liekom v celej nemocnici. “
Zvlášť jedno antibiotikum, meropeném, bolo zistené, že má negatívny vplyv na zdravé črevné baktérie u pacientov na JIS. Na ochranu mikrobiálnej rozmanitosti vedci naznačujú, že pacientom by mohli byť podávané lieky, ktoré absorbujú alebo inaktivujú, ako je drevené uhlie, na zníženie vplyvu antibiotík na črevný mikrobióm.
Ďalšou možnosťou môže byť obnovenie mikrobiálnej diverzity u pacientov na JIS prostredníctvom transplantácií fekálnej mikrobioty.