Recherche :des microbes potentiellement nocifs submergent le microbiote intestinal sain chez les patients en soins intensifs

Des microbes potentiellement nocifs submergent le microbiote intestinal sain des patients en soins intensifs, la recherche a trouvé.

Recherche publiée dans la revue Génomique Microbienne ont évalué comment la diversité et la composition du microbiome intestinal variaient pendant le temps des patients dans l'unité de soins intensifs (USI). Le microbiome intestinal est la communauté complexe de bactéries et autres microbes qui résident dans l'intestin, et joue un rôle important dans la santé et le bien-être.

Un certain nombre de facteurs sont susceptibles de réduire la diversité microbienne intestinale des patients en soins intensifs, les exposant à un plus grand risque d'infection - il s'agit notamment de la ventilation assistée, l'alimentation entérique et certains médicaments.

Bien que les patients testés aient été admis à l'USI pour diverses raisons, les deux tiers ont montré une réduction marquée de la diversité microbienne à un certain stade de leur séjour. Il y avait 24 patients inclus dans l'étude, avec des âges allant de 25 à 85 ans. Les motifs d'admission sont variés, et inclus un traumatisme, crise cardiaque et cancer.

Selon le professeur Mark Pallen (Quadram Institute, ROYAUME-UNI), qui a dirigé la recherche, un microbiome diversifié est important.

Le microbiome intestinal remplit de nombreux rôles importants et divers et bon nombre de ces rôles peuvent être perdus si la diversité microbienne est perdue. Ceci est susceptible d'avoir un impact sur la nutrition, motilité intestinale et inflammation intestinale.

Mark Pallen, Chef d'étude et professeur, Institut Quadram, Royaume-Uni

Les chercheurs ont découvert que chez les patients en soins intensifs de longue durée, le microbiome intestinal est devenu dominé par des bactéries susceptibles de devenir pathogènes :« Le microbiome intestinal abrite normalement un ensemble très diversifié d'espèces microbiennes, se comptent par centaines, avec une répartition relativement uniforme des abondances. Mais chez les patients en soins intensifs, un seul organisme peut s'emparer du microbiome de sorte que la grande majorité des cellules et séquences microbiennes appartiennent à une seule espèce.

"C'était choquant de voir à quelle vitesse et à quelle fréquence cette communauté diversifiée peut s'effondrer jusqu'à la domination monolithique d'un seul agent pathogène parmi les patients gravement malades."

L'équipe de recherche a utilisé une technique appelée métagénomique du fusil de chasse pour déterminer quelles bactéries étaient présentes dans l'intestin. Cela impliquait l'extraction et le séquençage de l'ADN d'échantillons fécaux pour déterminer quels microbes étaient présents.

Le professeur Pallen a dit, "Nous avons vu Enterococcus faecium le plus souvent et cela est préoccupant car il s'agit d'un agent pathogène important et courant chez les patients hospitalisés. Plus inquiétant encore, nous avons détecté des preuves de propagation d'une seule souche entre trois patients."

E. faecium peut provoquer des infections graves, en particulier sur les sites où des dispositifs médicaux - tels que des canules intraveineuses - ont été utilisés. Si ces bactéries pénètrent dans la circulation sanguine, ils peuvent provoquer une infection mortelle. Entérocoque les infections sont particulièrement difficiles à traiter car de nombreuses espèces de ce groupe ont développé une résistance à de multiples antibiotiques, y compris l'antibiotique de dernier recours vancomycine.

La domination de l'intestin par un seul agent pathogène potentiel peut mettre en danger d'autres patients hospitalisés, selon Pallen. Il a dit, "Lorsqu'un seul microbe potentiellement pathogène augmente considérablement sa biomasse dans cette niche particulière, il est alors plus susceptible de déborder dans d'autres compartiments du corps, par exemple, le sang ou les poumons, où il peut provoquer une maladie mortelle.

Quoi de plus, il est alors susceptible de se propager à d'autres patients, facilitant la dissémination d'agents pathogènes multirésistants dans tout l'hôpital.

Un antibiotique en particulier, méropénème, s'est avéré avoir un impact négatif sur les bactéries intestinales saines chez les patients en soins intensifs. Pour protéger la diversité microbienne, les chercheurs suggèrent que les patients pourraient recevoir des médicaments qui absorbent ou inactivent, comme le charbon de bois, pour réduire l'impact des antibiotiques sur le microbiome intestinal.

Une autre option pourrait être de restaurer la diversité microbienne chez les patients en soins intensifs grâce à des greffes de microbiote fécal.

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