Táto „výsledková listina“, ktorý tím nazval Tumor Matrisome Index (TMI), je panel 29 vybraných génov produkovaných v extracelulárnej matrici (ECM) ľudského tela. ECM je priestor okolo buniek a poskytuje štrukturálnu a biochemickú podporu okolitým bunkám, správať sa ako lešenie. V sérii štúdií, tím NUS zistil, že týchto 29 génov sa opakovane javilo ako konzistentný faktor u pacientov s diagnostikovanou nemalobunkovou rakovinou pľúc (NSCLC), čo predstavuje približne 85 percent všetkých rakovín pľúc.
Výskum viedol profesor Lim Chwee Teck z Katedry biomedicínskeho inžinierstva NUS a čerstvý doktorand doktor Lim Su Bin.
Prof Lim vysvetlil:
TMI je možné použiť spolu s tekutou biopsiou, čo je v porovnaní s konvenčnými nádorovými biopsiami menej invazívne a pre pacienta menej bolestivé. Pretože namiesto jednodňovej chirurgie vyžaduje iba krvný test, počas liečby sa to môže vykonávať častejšie, poskytovať lekárom v reálnom čase informácie o tom, ako pacient reaguje na liečbu. Biopsia tkaniva sa často vykonáva na začiatku a na konci liečby, zatiaľ čo tekuté biopsie sa dajú robiť často, umožňuje lekárom efektívnejšie sledovať, ako dobre prebieha liečba. Je to veľký krok vpred v prispôsobení liečby rakoviny a zaistení lepších výsledkov pre pacientov. “
Vyvinúť a overiť „hodnotiacu kartu“ TMI, Dr Lim použil veľké údaje a prediktívnu analýzu viac ako 30, 000 biopsií odvodených od pacienta. „Paralelné analýzy vo viac ako 30, 000 biopsií pochádzajúcich z pacienta odhalilo, že skóre TMI je úzko spojené s mutačným zaťažením, nádorová histopatológia, a predpovedajú výsledky pre pacientov, " povedala.
S využitím verejných súborov údajov o zdravých jedincoch a onkologických pacientoch, tím si všimol, že pacienti s rakovinou majú vyšší súbor skóre TMI. Testovanie podpisu TMI na osobe môže určiť, či niekto má alebo nemá rakovinu.
Tiež skúmali 29 -génový TMI u 11 hlavných typov rakoviny - pľúca, pankreas, prostata, oblička, žalúdok, dvojbodka, vaječník, prsník, pečeň, mechúra a melanómu. Tím zistil, že skóre TMI rozlišuje rakovinu od normálneho tkaniva, a že každý typ rakoviny má špecifický podpis TMI.
Zatiaľ podpis TMI môže s istotou diagnostikovať niekoho s rakovinou pľúc, ale ďalšia validácia je potrebná pre ďalších 10 typov rakoviny.
Tím tiež ukázal, že skóre TMI je možné použiť na predpovedanie úspešnosti reakcie pacienta na liečbu rakoviny, ako je imunoterapia. Imunoterapia je proces, v ktorom sa bunky vlastného tela používajú na útok na rakovinové bunky ako forma liečby rakoviny. Uprednostňuje sa pred chemoterapiou, ktorý sa používa častejšie, pretože je oveľa menej invazívny a preukázal lepšiu účinnosť.
Rakovinové nádory sa môžu buď rozšíriť do rôznych častí tela (metastázovať) alebo sa vrátiť (opakovať), ak sa neúspešne liečia. Určenie, či nádor bude pravdepodobne metastázovať alebo sa opakovať, bolo predtým výzvou, pretože sa často vykonáva pomocou makroskopických zobrazovacích techník, ktoré môžu byť často nešpecifické.
Skóre TMI pacienta by mohlo poskytnúť lepší odhad jeho prežitia, tím našiel. Vo svojej práci s NSCLC tím zistil, že vysoké skóre TMI sú konzistentne spojené s včasnou recidívou rakoviny a metastatickým šírením, čo vedie k zvýšenému riziku úmrtia.
V prípade rakoviny, ako je hrubé črevo, pečeň, obličkové, a rakoviny prsníka, čím vyššie je skóre TMI, čím vyššie je riziko recidívy rakoviny alebo metastáz, a preto, tým sa znižujú šance pacienta na prežitie.
Avšak, pri rakovine žalúdka a vaječníkov, platí to opačne:čím vyššie je skóre TMI, čím nižšie je riziko recidívy rakoviny alebo metastáz a tým väčšia je šanca na prežitie. "V gastrointestinálnom mikrobióme môžu byť ďalšie faktory, prítomnosť črevnej mikroflóry, ktoré postihujú pacienta. To si vyžaduje ďalšie štúdium, “povedal profesor Lim.
Zistenia tímu boli publikované v dvoch vedeckých časopisoch - 15. augusta 2019 v Zborník Národnej akadémie vied a 22. mája 2019 v Presná onkológia časopisu Nature Partner Journal .
Hýbať sa vpred, Prof Lim a jeho tím plánujú spolupracovať so svojimi klinickými spolupracovníkmi na vykonaní ďalších klinických testov na validáciu použitia TMI na iné typy rakoviny. To určí, ako presný a špecifický bude TMI v diagnostike a prognóze pacientov pomocou kvapalnej biopsie alebo krvného testu. To má veľký potenciál stať sa štandardným testom nielen na detekciu rakoviny, ale aj predpovedanie prežitia pacienta.
Chemikália na rakovinu z bežného črevného mikróbu
Štúdia opisuje počiatočnú východiskovú databázu zdravých črevných mikrobiómov a profil početnosti
Strava a výživa ovplyvňujú mikrobiómy v sliznici hrubého čreva
Ústna voda ovplyvňuje účinky cvičenia
Netesné črevo a vesmírny let - mechanizmus odhalený
Ak máte viac ako 50 rokov,
Vidiecka a mestská mikrobiota sa líši od mladého veku,
nachádza novú štúdiu Nová štúdia ukázala, že rozdiely v črevnom mikrobióme medzi ľuďmi žijúcimi vo vidieckych a mestských oblastiach Nigérie začínajú už vo veľmi mladom veku. Obrazový kre
Bežná huba nachádzajúca sa na koži môže spôsobiť zápalové ochorenie čriev
Terapie zamerané na určité komenzálne huby by mohli poskytnúť nový spôsob liečby zápalového ochorenia čriev (IBD), podľa výskumníkov z LA. Pozadie | Shutterstock IBD je charakterizovaná z
Kvalita spánku by mohla byť indikátorom neskoršej štúdie o Alzheimerovej chorobe
Nová štúdia od vedcov z Kalifornskej univerzity, Berkeley ukázal, že postupne klesajúca kvalita spánku u osôb vo veku 50 až 60 rokov môže naznačovať zamotanie bielkovín v ich mozgu, čo by mohlo viesť