Cette "carte de pointage", que l'équipe a appelé le Tumor Matrisome Index (TMI), est un panel de 29 gènes sélectionnés produits dans la matrice extracellulaire (MEC) du corps humain. L'ECM est l'espace autour des cellules et fournit un support structurel et biochimique aux cellules environnantes, se comporter comme un échafaudage. Dans une série d'études, l'équipe NUS a découvert que ces 29 gènes étaient apparus à plusieurs reprises comme un facteur cohérent chez les patients diagnostiqués avec un cancer du poumon non à petites cellules (NSCLC) qui représente environ 85 pour cent de tous les cancers du poumon.
La recherche a été dirigée par le professeur Lim Chwee Teck du département de génie biomédical de la NUS et le récent docteur Lim Su Bin.
Le professeur Lim a expliqué :
Le TMI peut être utilisé avec une biopsie liquide, ce qui est moins invasif et moins douloureux pour le patient par rapport aux biopsies tumorales classiques. Comme il ne nécessite qu'un test sanguin au lieu d'une chirurgie d'un jour, cela peut être fait plus fréquemment au cours du traitement, fournir aux médecins des informations en temps réel sur la façon dont le patient réagit au traitement. La biopsie tissulaire est souvent réalisée en début et en fin de traitement, tandis que les biopsies liquides peuvent être effectuées fréquemment, permettant aux médecins de suivre plus efficacement la progression du traitement. C'est un grand pas en avant pour personnaliser le traitement du cancer et garantir de meilleurs résultats pour les patients."
Développer et valider la "scorecard" TMI, Le Dr Lim a utilisé les mégadonnées et l'analyse prédictive de plus de 30, 000 biopsies dérivées de patients. "Des analyses parallèles dans plus de 30, 000 biopsies dérivées de patients ont révélé que les scores TMI sont étroitement associés à la charge mutationnelle, histopathologie tumorale, et prédictif des résultats pour les patients, " elle a dit.
En utilisant des ensembles de données publiques d'individus en bonne santé et de patients atteints de cancer, l'équipe a remarqué que les patients atteints de cancer avaient un ensemble plus élevé de scores TMI. Tester la signature TMI d'une personne peut déterminer si quelqu'un a un cancer ou non.
Ils ont également examiné le TMI à 29 gènes dans 11 principaux types de cancer - poumon, pancréas, prostate, un rein, estomac, côlon, ovaire, Sein, le foie, vessie et mélanome. L'équipe a découvert que les scores TMI distinguent les cancers des tissus normaux, et que chaque type de cancer a une signature TMI spécifique.
Jusque là, la signature TMI permet de diagnostiquer avec certitude une personne atteinte d'un cancer du poumon, mais une validation supplémentaire est requise pour les 10 autres types de cancer.
L'équipe a également montré que les scores TMI pouvaient être utilisés pour prédire dans quelle mesure un patient pourrait réagir aux traitements contre le cancer, comme l'immunothérapie. L'immunothérapie est le processus par lequel les propres cellules du corps sont utilisées pour attaquer les cellules cancéreuses comme une forme de traitement du cancer. Il est préférable à la chimiothérapie, qui est plus couramment utilisé, car il est beaucoup moins invasif et a montré une meilleure efficacité.
Les tumeurs cancéreuses peuvent se propager à différentes parties du corps (métastases) ou réapparaître (récidive) si elles sont traitées sans succès. Déterminer si une tumeur est susceptible de métastaser ou de récidiver était auparavant un défi car cela se fait souvent par des techniques d'imagerie macroscopique qui peuvent souvent être non spécifiques.
Les scores TMI d'un patient pourraient donner un meilleur indicateur de sa capacité de survie, l'équipe a trouvé. Dans leur travail avec le NSCLC, l'équipe a découvert que des scores TMI élevés étaient systématiquement associés à une récidive précoce du cancer et à une propagation métastatique, entraînant un risque accru de décès.
Pour les cancers comme le côlon, le foie, rénal, et les cancers du sein, plus les scores TMI sont élevés, plus le risque de récidive du cancer ou de métastase est élevé, et donc, plus les chances de survie du patient sont faibles.
Cependant, pour les cancers gastriques et ovariens, l'inverse est vrai :plus les scores TMI sont élevés, plus le risque de récidive du cancer ou de métastase est faible et meilleures sont les chances de survie. "Il pourrait y avoir d'autres facteurs dans le microbiome gastro-intestinal, comme la présence de microflore intestinale, qui affecte le patient. Cela nécessite une étude plus approfondie, ", a déclaré le professeur Lim.
Les résultats de l'équipe ont été publiés dans deux revues scientifiques - le 15 août 2019 dans le Actes de l'Académie nationale des sciences et le 22 mai 2019 dans le Oncologie de précision de Nature Partner Journal .
Avancer, Le professeur Lim et son équipe prévoient de collaborer avec leurs collaborateurs cliniques pour mener d'autres tests cliniques afin de valider l'utilisation du TMI sur d'autres types de cancer. Cela déterminera la précision et la spécificité du TMI dans le diagnostic et le pronostic des patients via une biopsie liquide ou un test sanguin. Cela a un grand potentiel pour devenir un test standard non seulement pour détecter le cancer, mais aussi prédire la survie du patient.
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