Исследователи NUS открыли новый персонализированный инструмент для диагностики рака

Команда исследователей из Национального университета Сингапура (NUS) обнаружила новый персонализированный инструмент для обнаружения рака, спрогнозировать выживаемость пациента и то, насколько хорошо онкологический больной будет реагировать на иммунотерапию. Этот инструмент представляет собой специально разработанную «оценочную карту» рака, которая используется со стандартным анализом крови на рак (также известный как жидкая биопсия).

Это «оценочная карточка», который команда назвала индексом опухолевой матрицы (TMI), представляет собой панель из 29 отобранных генов, продуцируемых во внеклеточном матриксе (ЕСМ) человеческого тела. ECM - это пространство вокруг клеток, обеспечивающее структурную и биохимическую поддержку окружающих клеток, ведет себя как строительные леса. В серии исследований Команда NUS обнаружила, что эти 29 генов неоднократно появлялись как постоянный фактор у пациентов с диагнозом немелкоклеточный рак легкого (НМРЛ), на который приходится примерно 85% всех случаев рака легких.

Исследованием руководили профессор Лим Чви Тек из отдела биомедицинской инженерии NUS и недавний аспирант доктор Лим Су Бин.

Профессор Лим объяснил:

<цитата>

TMI можно использовать вместе с жидкостной биопсией, который менее инвазивен и менее болезнен для пациента по сравнению с обычной биопсией опухоли. Поскольку вместо дневного хирургического вмешательства требуется только анализ крови, это можно делать чаще в течение курса лечения, предоставление врачам информации в режиме реального времени о том, как пациент реагирует на лечение. Биопсия ткани часто проводится в начале и в конце лечения. в то время как жидкие биопсии можно делать часто, позволяя врачам более эффективно отслеживать, насколько хорошо продвигается лечение. Это большой шаг вперед в персонализации лечения рака и обеспечении лучших результатов для пациентов ».

Для разработки и проверки «оценочной карты» TMI, Д-р Лим использовал большие данные и прогнозный анализ более 30, 000 биопсий, полученных от пациентов. "Параллельные анализы в более чем 30, 000 биопсий, полученных от пациентов, показали, что показатели TMI тесно связаны с мутационной нагрузкой, гистопатология опухолей, и прогнозирование исходов для пациентов, " она сказала.

Диагноз рака

Используя общедоступные наборы данных здоровых людей и больных раком, команда заметила, что у онкологических больных набор показателей TMI выше. Проверка подписи TMI человека может определить, есть ли у человека рак или нет.

Они также исследовали TMI с 29 генами при 11 основных типах рака - легких, поджелудочная железа простата, почка, желудок, двоеточие, яичник грудь, печень, мочевой пузырь и меланома. Команда обнаружила, что показатели TMI позволяют отличить рак от нормальных тканей, и что каждый тип рака имеет определенную сигнатуру TMI.

Так далеко, подпись TMI может с уверенностью диагностировать кого-то с раком легких, но для других 10 типов рака требуется дальнейшая валидация.

Прогнозирование эффективности лечения рака

Команда также показала, что показатели TMI можно использовать для прогнозирования того, насколько успешно пациент может отреагировать на лечение рака. такие как иммунотерапия. Иммунотерапия - это процесс, при котором собственные клетки организма используются для атаки раковых клеток в качестве формы лечения рака. Это предпочтительнее химиотерапии, который чаще используется, так как он гораздо менее инвазивен и показал лучшую эффективность.

Прогнозирование выживаемости и частоты рецидивов рака

Раковые опухоли могут распространяться на разные части тела (метастазировать) или возвращаться (рецидивировать) при безуспешном лечении. Ранее было непросто определить вероятность метастазирования или рецидива опухоли, поскольку это часто делается с помощью методов макроскопической визуализации, которые часто могут быть неспецифическими.

Показатели TMI пациента могут лучше оценить его или ее выживаемость, команда нашла. В своей работе с НМРЛ команда обнаружила, что высокие показатели TMI неизменно связаны с ранним рецидивом рака и метастатическим распространением, что приводит к повышенному риску смерти.

Для рака толстой кишки печень, почечный и рак груди, чем выше баллы TMI, чем выше риск рецидива рака или метастазирования, и, следовательно, тем ниже шансы пациента на выживание.

Тем не мение, при раке желудка и яичников, Верно и обратное:чем выше баллы TMI, чем ниже риск рецидива или метастазирования рака и тем выше шансы на выживание. "В желудочно-кишечном микробиоме могут быть и другие факторы, например наличие микрофлоры кишечника, что влияет на пациента. Это требует дополнительных исследований, "сказал профессор Лим.

Выводы команды были опубликованы в двух научных журналах - 15 августа 2019 г. Труды Национальной академии наук и 22 мая 2019 г. Точная онкология журнала Nature Partner .

Следующие шаги

Движение вперед, Профессор Лим и его команда планируют сотрудничать со своими клиническими сотрудниками для проведения дальнейших клинических испытаний, чтобы подтвердить использование TMI при других типах рака. Это определит, насколько точным и конкретным будет TMI для диагностики и прогноза пациентов с помощью жидкостной биопсии или анализа крови. У этого есть большой потенциал, чтобы стать стандартным тестом не только для выявления рака, но также и прогнозирование выживаемости пациентов.

• Исследование показывает, как гены, вызывающие рак, способствуют метастазированию
• Значимый гендерный разрыв обнаружен в публикации медицинских статей