Исследователи идентифицировали новые гены, связанные с тяжестью аллергии на арахис.

Исследователи из Медицинской школы Икана на горе Синай определили новые гены, связанные с серьезностью аллергии на арахис, а также способы, которыми эти гены взаимодействуют с другими генами во время аллергических реакций.

Находки, опубликовано 12 декабря в Журнал аллергии и клинической иммунологии , может привести к лучшему лечению аллергии на арахис.

Аллергия на арахис широко варьируется по степени тяжести и является основной причиной фатальной пищевой анафилаксии. Тесты, используемые для определения наличия аллергии на арахис, не дают никаких подсказок относительно того, может ли человек, принимающий арахис, испытать незначительную сыпь. большой отек, или опасные для жизни проблемы, такие как затрудненное дыхание или сердечно-сосудистые осложнения.

Старший автор исследования, Супинда Буняванич, Доктор медицины, МИЛЬ В ЧАС, Доцент кафедры генетики и геномных наук, и педиатрия, и заместитель директора Института пищевой аллергии Эллиота и Рослин Джаффе на горе Синай, было особенно любопытно, почему степень реакции так сильно различается, и как клиницист-ученый, и как мать ребенка с аллергией на арахис.

Чтобы ответить на этот вопрос, Доктор Буняванич и ее команда использовали новые многомерные подходы (изучение роли, отношения и действия общесистемного показателя данного молекулярного типа) для выявления генов и сетей активности, которые могут определять тяжесть аллергических реакций на арахис. Подходы включали транскриптомику, изучение экспрессии генов в геноме, и эпигеномика, изучение обратимых модификаций ДНК, влияющих на экспрессию генов.

В исследовании участвовал 21 ребенок в возрасте 7-17 лет с аллергией на арахис. которым давали постепенно увеличивающиеся дозы арахиса до появления аллергической реакции. Ученые брали кровь у участников трижды:перед едой, как они отреагировали, и после их реакции. Команда подтвердила свои выводы из исходной когорты, повторив исследование еще с 19 детьми.

Многократный взятие образцов крови позволило команде проанализировать как транскриптом, так и эпигеном (который может сказать ученым, какие гены включены или выключены посредством процесса, называемого метилированием) по мере реакции детей. Используя этот общегеномный подход, они идентифицировали более 300 генов и 200 сайтов CpG (области, где ДНК может быть активирована или инактивирована метилированием), связанных с серьезностью реакции. Объединяя эти данные с помощью интеграционных сетей, команда также охарактеризовала ключевые взаимодействия между экспрессией генов, CpG-сайты, и серьезность реакции.

Они не только определили новые гены, связанные с серьезностью аллергии на арахис, но и но им также удалось охарактеризовать способы, которыми эти гены взаимодействуют с другими генами и сайтами CpG во время аллергических реакций, чтобы регулировать биологические процессы. «Было очень интересно применить мультиомикс, чтобы раскрыть, как взаимодействуют гены и сайты метилирования, чтобы повлиять на тяжесть реакции у этих детей с аллергией на арахис, "говорит Ань До, Кандидат наук, ведущий автор исследования и докторант лаборатории Буняванича.

Среди выводов можно отметить то, что, хотя результаты подтверждают признанную роль адаптивного иммунитета при аллергии, они также предполагают, что иммунитет, опосредованный нейтрофилами (типом лейкоцитов), играет важную роль в тяжести реакции.

<цитата>

Мы знаем, что опосредованный нейтрофилами иммунитет является частью иммунных ответов, и это исследование предполагает, что он может играть центральную роль в серьезности аллергических реакций на арахис ».

Д-р Супинда Буняванич, старший автор исследования

Кроме того, один из драйверов серьезности реакции, который определила команда, ген ARG1, может подавляться ингибиторами аргиназы, тип лекарственного средства, изучаемый при многих заболеваниях. Результаты этого исследования показывают, что он также может быть потенциальной мишенью для лечения аллергии на арахис.

Доктор Буняванич надеется, что в будущих исследованиях будут выявлены биомаркеры, которые могут предсказать, у кого, вероятно, будут серьезные реакции, без необходимости предварительно подвергать их воздействию арахиса. Но пока что она заявляет, что это исследование «мы надеемся побудить людей взглянуть на пищевую аллергию с более широкой точки зрения».

• Исследование предполагает связь между бактериями в верхних дыхательных путях и тяжестью астмы.
• NIH предоставляет до 102,5 млн долларов в виде возобновленного финансирования для группы лидеров по устойчивост…