Virulente patogener kan fremmes av mikrobiota, men kommensal mikrobiota kan også undertrykke spredning av virus. Det er vist at disse interaksjonene påvirker kliniske utfall.
Hvordan fungerer den pågående COVID-19-pandemien (coronavirus sykdom 2019), forårsaket av alvorlig akutt respiratorisk syndrom coronavirus 2 (SARS-CoV-2), påvirke det bakterielle mikrobiomet?
I en nylig studie ledet av Dr. Amy K Feehan, forskere antok at COVID-19-statusen ville være forbundet med et skifte i NP-mikrobiomet, spesielt hos sykehusinnlagte pasienter. Resultatene fra denne studien støtter de dynamiske og betydelige endringene i mikrobiomet i NP -rommet, spesielt når pasienter bruker pustehjelp.
Pustebehandlinger tilbys sykehusinnlagte COVID-19 pasienter. I denne studien, forskerne undersøkte fellesskapssammensetningen i forhold til tre attributter - COVID -19 -status, pustehjelp, og bruk av antibiotika. Denne studien er publisert i tidsskriftet, Anvendt mikrobiologi.
"Tverrsnittsforskjeller i mikrobiomet var tydelige med SARS-CoV-2-infeksjon, men langsgående studier er nødvendig for å forstå dynamikken i viral og pustende behandling av mikrober. ”
Forskerne brukte grunne haglepistol-sekvensering av et tverrsnittssett med medisinsk avfallsprøver fra Louisiana, USA, som ble bekreftet av PCR-positiv for SARS-CoV-2 over en rekke alvorlighetsgrader (asymptomatisk, sykehusinnleggelse, og død). Denne studien inkluderte 79 SARS-CoV-2 positive prøver og 20 negative prøver (kontroll).
Forskerne presenterte demografien knyttet til prøvene. For eksempel, informasjon som innleggelse, bruk av pustehjelp, Alvorlighetsgrad av COVID-19, røykestatus, alder, kjønn, og rase.
Ved hjelp av metagenomisk sekvensering og klassifisering, de vurderte mikrobiosammensetningen av nasofaryngeale vattpinner av disse positive og negative individene i SARS-CoV-2.
Søylediagram over prosentandelen pasienter i hver gruppe for tre attributter der slekten ble oppdaget. Hver av stolpene representerer en av de 21 slektene (x-aksen). Tre attributter ble testet:COVID-19 smittestatus De fant totalt 202 unike slekter på tvers av alle prøvene, av hvilke, de identifiserte totalt 27 unike slekter. I tillegg, COVID-19-positivitet var forbundet med økt representasjon av Serratia , en allestedsnærværende mikroorganisme. Spesielt, Serratia marcescens er en anerkjent årsakssykdom for menneskelige sykdommer, inkludert lungebetennelse.
Forskerne fant Serratia , Streptococcus , Enterobacter , Veillonella , Prevotella , og Rothia ofte hos COVID-19-pasienter som brukte pustehjelpemidler.
Også, de rapporterte at to slekter: Finegoldia , et opportunistisk menneskelig patogen, og Peptoniphilus , vanligvis forbundet med tarmen og vaginal mikrobiota, var helt fraværende hos COVID-19-pasientene som treng pustehjelp; mens de var tilstede hos pasienter som ikke trengte pustehjelp.
De bemerket at den individuelle relative overflod av Veillonella var lik mellom gruppene, og den relative mengden av Finegoldia var tydelig høyere i antibiotikagruppen.
De beregnet alfa -mangfoldet (mangfold innenfor et bestemt område eller økosystem, artsrikdom) og beta -mangfoldet (forskjell i artsmangfold mellom økosystemer, artsomsetning).
I motsetning til COVID-19-statusen, forskerne fant at alfamangfoldet var forskjellig for aldersstatus og for personer som røykte. Det er velkjent at alder og røyking påvirker tarmens mikrobiom, hud, og øvre luftveier.
Selv om de fant at beta-mangfoldet til mikrobiomet var vesentlig forskjellig for de som hadde COVID-19, brukte pustehjelpemidler, hadde et sykehusopphold, og, også, de som døde. Overraskende, forskerne observerte raseforskjeller i beta-mangfoldet i NP-rommet og understreket behovet for en storprøveundersøkelse for å evaluere dette ytterligere.
"Samspillet mellom SARS-CoV-2-infeksjon, pustebehandling, sykehusopphold, og respiratoriske mikrobiomer er komplekse, og en detaljert tidslinje og/eller langsgående prøvetaking av pasienter er nødvendig for å identifisere årsakssammenhenger. ”
Selv om denne studien ikke tar for seg bruk av spesifikke medisiner tatt av individene på grunn av begrensninger på tidspunktet for datainnsamling, det fremhever kraftig forholdet mellom COVID-19-infeksjon og endringene i de mikrobielle samfunnene. Det er tydelig at COVID -19 endrer NP -mikrobiomet - i mangfold, Frekvens, og overflod. I tillegg pustebehandlingen påvirker typen og mengden av de mikrobielle taxaene som inneholder NP -mikrobiomet.
Forskjeller i pasientpopulasjoner, geografi, og klima, eller til og med mengde eller genomisk mangfold av SARS-CoV-2-viruset spiller en rolle i NP-mikrobiomet.
Ny forskning identifiserer en kobling mellom tarmmikrobiomet og slag
Studien beskriver den opprinnelige baseline sunne tarmmikrobiomdatabasen og overflodsprofil
En multi-omics tilnærming til utvikling av medisiner mot COVID-19
Det du spiser kan endre måten antibiotika påvirker tarmen på
Sopp og bakterier i tarmen kan også påvirke menneskers helse og alvorlighetsgraden av sykdommen
Tarmbakterier kan forutsi risiko for pulmonal hypertensjon
Flått som nå bærer flere sykdommer,
sier ny studie En ny studie publisert i tidsskriftet mBio rapporterer at flått bærer mange flere sykdomsfremkallende midler enn bare de som er ansvarlige for å forårsake Lyme sykdom. Over hele ver
Hvorfor trenger jeg en koloskopi?
Folk har hørt nok skrekkhistorier om koloskopier til å fylle et Halloween -hjemsøkt hus. Selv om du ikke er gammel for å ha hatt en, du har sikkert hørt om dem. Så, hvis de er så slitsomme, hvorfor
En type tarmbakterier kan øke risikoen for tarmkreft
Ny forskning presentert på NCRI Cancer Conference i 2019 har vist at mennesker med en bestemt type bakterier i tarmen kan ha større sannsynlighet for å utvikle tarmkreft. Bildekreditt:T.L.