A virulens kórokozókat elősegítheti a mikrobiota, de a kommenzális mikrobiota is elnyomhatja a vírusok terjedését. Kimutatták, hogy ezek a kölcsönhatások befolyásolják a klinikai eredményeket.
Hogyan alakul a folyamatban lévő COVID-19 (koronavírus-járvány 2019) világjárvány, súlyos akut légzőszervi szindróma okozta koronavírus 2 (SARS-CoV-2), befolyásolja a bakteriális mikrobiomot?
Nemrégiben Dr. Amy K Feehan vezette tanulmányában a kutatók azt feltételezték, hogy a COVID-19 állapot az NP mikrobiomjának megváltozásával jár, különösen a kórházi betegeknél. A tanulmány eredményei alátámasztják az NP tér mikrobiomjának dinamikus és jelentős változásait, különösen akkor, ha a betegek légzéssegítő eszközt használnak.
A COVID-19 betegek kórházi kezelésben részesülnek. Ebben a tanulmányban, a kutatók a közösség összetételét három tulajdonság - a COVID -19 állapot - vonatkozásában vizsgálták légzéssegítő, és az antibiotikumok használata. Ez a tanulmány megjelent a folyóiratban, Alkalmazott mikrobiológia.
„A mikrobiom keresztmetszeti különbségei nyilvánvalóak voltak SARS-CoV-2 fertőzés esetén, de longitudinális vizsgálatokra van szükség ahhoz, hogy megértsük a mikrobák vírusos és légzéskezelési modulációjának dinamikáját. ”
A kutatók sekély sörétes puskás szekvenálást alkalmaztak a Louisiana államból származó orvosi hulladékminták keresztmetszeti sorozatából, USA, amelyeket PCR pozitívnak bizonyítottak a SARS-CoV-2 esetében, különböző súlyossági tartományban (tünetmentes, kórházi ápolás, és a halál). Ez a vizsgálat 79 SARS-CoV-2 pozitív mintát és 20 negatív mintát tartalmazott (kontroll).
A kutatók bemutatták a mintákkal kapcsolatos demográfiai adatokat. Például, olyan információk, mint a fekvőbeteg, légzéssegítő eszköz használata, COVID-19 súlyossága, dohányzási állapot, kor, nem, és a verseny.
A metagenomikus szekvenálás és osztályozás segítségével értékelték a SARS-CoV-2 pozitív és negatív egyének orr-garat tamponjainak mikrobiom összetételét.
Oszlopdiagram a betegek százalékos arányáról az egyes csoportokban három olyan attribútum esetében, amelyekben a nemzetséget észlelték. Mindegyik oszlop a 21 nemzetség egyikét (x tengely) jelenti. Három tulajdonságot teszteltek:COVID-19 fertőzés állapotaÖsszesen 202 egyedi nemzetséget találtak minden mintában, amelyből, összesen 27 egyedi nemzetséget azonosítottak. Továbbá, A COVID-19 pozitivitást fokozott reprezentáció társította Serratia , mindenütt jelenlévő mikroorganizmus. Nevezetesen, Serratia marcescens az emberi betegségek elismert kórokozója, beleértve a tüdőgyulladást.
A kutatók megállapították Serratia , Streptococcus , Enterobacter , Veillonella , Prevotella , és Rothia gyakran azoknál a COVID-19 betegeknél, akik légzéssegítő eszközöket használtak.
Is, két nemzetségről számoltak be: Finegoldia , egy opportunista emberi kórokozó, és Peptoniphilus , jellemzően a bél és a hüvely mikrobiotájához kapcsolódik, teljesen hiányoztak a COVID-19 betegekből, akik légzéssegítést igényeltek; míg azoknál a betegeknél vannak jelen, akiknek nincs szükségük légzési segítségre.
Megjegyezték, hogy az egyéni relatív bőség Veillonella hasonló volt a csoportok között, és a relatív bőség Finegoldia egyértelműen magasabb volt az antibiotikum -felhasználási csoportban.
Kiszámították az alfa diverzitást (egy adott területen vagy ökoszisztémán belüli sokszínűséget; fajgazdagságot) és a béta diverzitást (a fajok sokféleségének különbsége az ökoszisztémák között; fajforgalom).
A COVID-19 státusszal ellentétben a kutatók azt találták, hogy az alfa sokfélesége eltérő volt az életkor és a dohányzó személyek esetében. Köztudott, hogy az életkor és a dohányzás befolyásolja a bél mikrobiómáját, bőr, és a felső légutakat.
Miközben azt találták, hogy a mikrobióma béta diverzitása jelentősen eltér a COVID-19-ben szenvedők körében, használt légzéssegítő eszközök, feküdt kórházban, és, is, akik meghaltak. Meglepően, a kutatók megfigyelték az NP tér béta-diverzitásának faji különbségeit, és hangsúlyozták, hogy egy nagy mintavételű vizsgálatra van szükség ennek további értékeléséhez.
„A SARS-CoV-2 fertőzés kölcsönhatása, légzési kezelés, kórházi tartózkodás, és a légúti mikrobiomák összetettek, és az ok -okozati összefüggések azonosításához részletes idővonalra és/vagy a betegek hosszirányú mintavételére van szükség. ”
Míg ez a tanulmány nem veszi figyelembe az egyének által szedett speciális gyógyszerek alkalmazását az adatgyűjtés idején fennálló korlátok miatt, erőteljesen rávilágít a COVID-19 fertőzés és a mikrobiális közösségek változásai közötti kapcsolatra. Nyilvánvaló, hogy a COVID -19 megváltoztatja az NP mikrobiómát - sokféleségben, frekvencia, és a bőség. Ezenkívül a légzéskezelés befolyásolja az NP mikrobiomot tartalmazó mikrobiális taxonok típusát és mennyiségét.
Különbségek a betegpopulációkban, földrajz, és az éghajlat, vagy akár a SARS-CoV-2 vírus mennyisége vagy genomi sokfélesége is szerepet játszik az NP mikrobiomában.