Stomach Health > Vatsa terveys >  > Q and A > vatsa kysymys

Nenänielun mikrobiomin koostumus ja rakenne liittyvät COVID-19-taudin vakavuuteen

Virusinfektiot liittyvät muutoksiin ylähengitysteiden/nenänielun (NP) mikrobiomissa. Lisäksi, monet tutkimukset olettelevat "superinfektioiden" mahdollisuuksia, jotka johtuvat heikentyneestä immuniteetista viruksen hyökkäyksen aikana.

Viruksen aiheuttavia taudinaiheuttajia voi edistää mikrobiota, mutta kommensaalinen mikrobiota voi myös estää virusten leviämisen. On osoitettu, että nämä yhteisvaikutukset vaikuttavat kliinisiin tuloksiin.

Miten käynnissä oleva COVID-19 (koronavirus 2019) -pandemia vaikuttaa, aiheuttama vakava akuutti hengitystieoireyhtymä koronavirus 2 (SARS-CoV-2), vaikuttaa bakteerien mikrobiomiin?

Amy K Feehanin johtamassa äskettäisessä tutkimuksessa tutkijat olettivat, että COVID-19-tila liittyy NP-mikrobiomin muutokseen, erityisesti sairaalahoidossa olevilla potilailla. Tämän tutkimuksen tulokset tukevat dynaamisia ja merkittäviä muutoksia mikrobiomiin NP -tilassa, erityisesti silloin, kun potilaat käyttävät hengityslaitteita.

Hengityshoitoja tarjotaan COVID-19-sairaalassa oleville potilaille. Tässä tutkimuksessa tutkijat tarkastelivat yhteisön kokoonpanoa suhteessa kolmeen ominaisuuteen - COVID -19 -tila, hengitysapu, ja antibioottien käyttö. Tämä tutkimus on julkaistu lehdessä, Sovellettu mikrobiologia.

"Poikkileikkauserot mikrobiomissa olivat ilmeisiä SARS-CoV-2-infektion yhteydessä, mutta pitkittäistutkimuksia tarvitaan mikrobien virus- ja hengityshoitomodulaation dynamiikan ymmärtämiseksi. ”

Tutkimus

Tutkijat käyttivät matalaa haulikon sekvensointia poikkileikkausjoukosta Louisianan lääkejätenäytteitä, Yhdysvallat, jotka vahvistettiin PCR-positiivisina SARS-CoV-2:lle eri vaikeusasteilla (oireeton, sairaalahoito, ja kuolema). Tämä tutkimus sisälsi 79 SARS-CoV-2-positiivista näytettä ja 20 negatiivista näytettä (kontrolli).

Tutkijat esittivät näytteisiin liittyvät väestötiedot. Esimerkiksi, tietoja, kuten sairaalahoito, hengityslaitteen käyttö, COVID-19 vakavuus, tupakoinnin tila, ikä, sukupuoli, ja rotu.

Käyttämällä metagenomista sekvensointia ja luokittelua, he arvioivat näiden SARS-CoV-2-positiivisten ja -negatiivisten yksilöiden nenänielutyynyjen mikrobiomikoostumuksen.

Pylväskaavio kunkin ryhmän potilaiden prosenttiosuudesta kolmella ominaisuudella, joista suku havaittiin. Jokainen palkki edustaa yhtä 21 suvusta (x-akseli). Testattiin kolme ominaisuutta:COVID-19-tartunnan tila

Yhteisön kokoonpano ja erilainen runsaus

He löysivät yhteensä 202 ainutlaatuista sukua kaikista näytteistä, minkä, he tunnistivat yhteensä 27 ainutlaatuista sukua. Lisäksi, COVID-19-positiivisuuteen liittyi lisääntynyt edustus Serratia , kaikkialla läsnä oleva mikro -organismi. Erityisesti, Serratia marcescens on tunnustettu ihmisten sairauksien aiheuttaja, mukaan lukien keuhkokuume.

Tutkijat löysivät Serratia , Streptokokki , Enterobacter , Veillonella , Prevotella , ja Rothia usein COVID-19-potilailla, jotka käyttivät hengityksen apuvälineitä.

Myös, he kertoivat, että kaksi sukua: Finegoldia , ihmisen opportunistinen taudinaiheuttaja, ja Peptoniphilus , liittyy tyypillisesti suolistoon ja emättimen mikrobistoon, olivat kokonaan poissa hengitysapua tarvitsevista COVID-19-potilaista; ollessa läsnä potilailla, jotka eivät tarvinneet hengitysapua.

He totesivat, että yksittäisten suhteellinen runsaus Veillonella oli samanlainen ryhmien välillä, ja suhteellinen runsaus Finegoldia oli selvästi korkeampi antibioottien käyttöryhmässä.

Lajien monimuotoisuus

He laskivat alfa -monimuotoisuuden (monimuotoisuus tietyllä alueella tai ekosysteemissä; lajien rikkaus) ja beeta -monimuotoisuuden (lajien monimuotoisuuden ero ekosysteemien välillä; lajien vaihtuvuus).

Toisin kuin COVID-19-tilassa, tutkijat havaitsivat, että alfa -monimuotoisuus oli erilainen ikätilan ja tupakoivien henkilöiden osalta. Tiedetään, että ikä ja tupakointi vaikuttavat suoliston mikrobiomiin, iho, ja ylemmät hengitystiet.

Vaikka he havaitsivat mikrobiomin beetan monimuotoisuuden olevan merkittävästi erilainen niillä, joilla oli COVID-19, käytettyjä hengityslaitteita, oli sairaalassa sairaalassa, ja, myös, ne, jotka kuolivat. Yllättävän, tutkijat havaitsivat rodullisia eroja NP-tilan beeta-monimuotoisuudessa ja korostivat tarvetta laajan otoksen tutkimukseen tämän arvioimiseksi edelleen.

"SARS-CoV-2-infektion vuorovaikutus, hengityshoito, sairaalassaolo, ja hengityselinten mikrobiomit ovat monimutkaisia, ja syy -yhteyksien tunnistamiseksi tarvitaan yksityiskohtainen aikataulu ja/tai potilaiden pitkittäinen otanta. ”

Yhteenveto

Vaikka tässä tutkimuksessa ei oteta huomioon yksilöiden ottamien tiettyjen lääkkeiden käyttöä tietojen keräämishetken rajoitusten vuoksi, se korostaa voimakkaasti suhdetta COVID-19-tartunnan ja muutosten välillä mikrobiyhteisöissä. On selvää, että COVID -19 muuttaa NP -mikrobiomia - monimuotoisuudessa, taajuus, ja runsautta. Lisäksi, hengityshoito vaikuttaa NP -mikrobiomin muodostavien mikrobitaksonien tyyppiin ja runsauteen.

Potilasryhmien erot, maantiede, ja ilmasto, tai jopa SARS-CoV-2-viruksen määrällä tai genomisella monimuotoisuudella on jonkin verran roolia NP-mikrobiomissa.

Other Languages