GW-gefouert Konsortium kritt $ 2.2 Milliounen vun der FDA fir Biocompute Object Specification Project

E Konsortium gefouert vun der George Washington University (GW) gouf fir hire BioCompute Object Specification Project rembourséiert, merci fir $ 2,2 Milliounen, fënnef Joer Subventioun vun der US Food and Drug Administration (FDA). De BioCompute Object Specification Project, déi am Hierscht 2017 gestart gouf, liwwert vill gebraucht Standarden fir d'Kommunikatioun vun High-Throughput Sequencing (HTS) Berechnungen an Datenanalyse, bekannt als BioCompute Objects (BCOs).

Dëse Gemeinschaftsgedriwwene Projet funktionnéiert fir Daten an Workflowaustausch tëscht der FDA ze streamlinéieren, Fuerscher, pharmazeutesch Firmen, a Bioinformatik Technologie Entwéckler. An de leschte puer Joer, de Konsortium organiséiert reegelméisseg oppe Reuniounen, abegraff e jährleche Workshop fir d'Participanten ze erweideren, raffinéieren, a prioritär d'Bedierfnes fir Standardberichterstattung wärend och iwwer hir eege Stakeholder-spezifesch Ufuerderunge fir e Standard ze diskutéieren. No dësen Atelieren, d'BioCompute Object Specification Document gouf verëffentlecht - een am Joer 2017 an en anert aktualiséiert Dokument am Joer 2018 - fir bescht Praktiken ze kommunizéieren. Am GW-gefouert Konsortium abegraff sinn Experten vum DNAnexus, Galaxy Projet, Siwe Brécken, a méi.

Fir ze hëllefen d'perséinlech Medizin ze féieren, mir musse e bessere Wee fannen fir genomesch Daten ze vergläichen an ze bauen déi Abléck iwwer Kriibs kënne ginn, Virfueren, Mikrobiom Dynamik, metagenomics, a méi. Dëst ass wou de BioCompute Object Specification Project erakënnt. "

Raja Mazumder, Dokteraarbecht, de Projet Haapt Enquêteur a Professer fir Biochemie a Molekular Medizin an der GW School of Medicine and Health Sciences

De Standard gëtt de Moment vum Institute of Electrical and Electronics Engineers Standards Association bewäert fir en offiziell unerkannte Standard ze ginn. Well HTS Standards fir d'Datebank validéieren an z'erhalen, Berechnung an Interoperabilitéit ass kritesch fir d'Reguléierungsmissioun vun der FDA, de Konsortium zielt eng begleedend Datebank (BioComputeDB) ze kreéieren. Dëst wäert d'Entwécklung vu Mechanismen enthalen fir BCOs ze transferéieren, Updates vun der technescher Spezifikatiounsdokumentatioun, a reegelméisseg Informatiounssessioune fir FDA Personal iwwer d'Schafung an d'Benotzung vu BCOs.

"Ech mengen eis proposéiert Datebank a Mechanismus fir BCOs ze transferéieren huet de Potenzial fir de Soumissiounsprozess ze streamlinéieren, "sot de Jonathon Keeney, Dokteraarbecht, e Co-Enquêteur um Projet an Assistent Fuerschung Professer fir Biochemie a Molekular Medizin an der GW School of Medicine and Health Sciences. "Mir plangen mat FDA Personal ganz enk ze schaffen fir sécherzestellen datt de Projet hir Missioun ënnerstëtzt, an datt et de Bedierfnesser vun anere Gemeinschaftsmemberen entsprécht. "

De BioCompute Projet huet och eng "App-a-thon" Challenge op der PrecisionFDA Plattform koordinéiert déi d'Bioinformatik Gemeinschaft engagéiert huet fir BCOs an Apps ze bauen, déi mat hinnen verbonne sinn, ze bauen, an huet och kierzlech eng ëffentlech privat Partnerschaft gestart déi Tools a Feedback weiderentwéckelt, a wäert d'Erreeche vum Projet verlängeren fir méi Gruppen a verschiddene Beräicher enthalen.

• Nei virtuell Biopsie erlaabt Dokteren definitiv Zysten an der Bauchspaicheldrüs ze diagnostizéieren
• Drëpse mat engem spezifesche probiotesche Stamm kënnen d'Kolik bei Puppelcher reduzéieren