PLOS NËMMEN: Metabolomics zesummen mat Multivariate Data a Passerelle Analys op D'Biomarkers zu Gastric oppent a Interventioun Effects vun Corydalis yanhusuo Alkaloid

Wat VerfÜgung

Metabolomics, déi systematesch Analyse vun Potential metabolites an enger biologescher specimen, gouf zu entdecken biomarkers méi applizéiert, Kopfhörer Weeër Erkenntnesser, therapeutesch Ziler Moossen, an entdecken nei Drogen. Vun analyséiert an de groussen Ënnerscheed zu metabolic Profiler an Ännerungen vun metabolite biomarkers dër, erlaabt eis metabolomics besser ze Substanz metabolic Weeër verstoen wat de Mechanismus vun klassesch Chinese Medikamenter (TCM) klären kann. Corydalis yanhusuo VerfÜgung alkaloid (CA) ass e wichtegen Volet vun Qizhiweitong (QZWT) Rezept wat fir bestéet gastric oppent fir Joerhonnert benotzt gouf, a seng Mechanismus bleift komplett onkloer. Metabolite profiling war déi héich-Performance flësseg chromatography mat Zäit-vun-Vol Mass spectrometry (HPLC /ESI-Ënnerportal-MS) an a Verbindung mat multivariate Donnéeën Analyse an Passerelle Analyse kombinéiert gesuergt. D'Statistiken Software Mass Profiller Prossional (MPP) a Statistiken Method dorënner ANOVA an Haaptuert Komponent Analyse (PCA) huet fir entdecken Roman Potential biomarkers benotzt zu bestéet Seier heijen deër mat gastric oppent Mechanismus vum CA ze klären. D'Ännerungen am metabolic profiling sech un hir Basis-Linn Wäerter der CA Behandlung restauréiert no de PCA stoung Diagramm. Zéng verschidde potentiell biomarkers a siwe Schlëssel metabolic Weeër fir d'Behandlung vun gastric oppent Contributioun sech entdeckt an identifizéiert. Ënnert de Weeër, goufen sphingophospholipid ukuerbelt an fatty Seier ukuerbelt Zesummenhang Reseau acutely Kopfhörer. Chemeschen real Zäit polymerase Kette Reaktioun (RT-Hinnen alleguer) Analyse waren standing den Ausdrock vun Genen un déi zwee Weeër fir dër heivun Resultater Zesummenhang ze diskutéieren. D'Resultater weisen, datt geännert biomarkers a Weeër Beweiser fir Asiicht an Drogenofhängeger Aktioun Mechanismen déi vläicht an erméiglechen eis Fuerschung Produktivitéit Richtung metabolomics Drogenofhängeger Entdeckung gestiermt VerfÜgung

Fro:. Tianjiao L, Shuai W, Xiansheng M, Yongrui B, Shanshan G, Bo L, et al. (2014) Metabolomics zesummen mat Multivariate Data a Passerelle Analys op D'Biomarkers zu Gastric oppent a Interventioun Effects vun Corydalis yanhusuo zur Alkaloid. PLoS NËMMEN 9 (1): e82499. Doi: 10.1371 /journal.pone.0082499 VerfÜgung

Redakter: Rakesh K. Srivastava, D'Universitéit vu Kansas Medical Center, Vereenegt Staate vun Amerika VerfÜgung

Arnaque: Mee 15, 2013; Akzeptéiert: 24 Oktober 2013; Publizéiert: 15. Januar 2014 zu

Copyright: © 2014 Tianjiao et al. Dëst ass eng oppen-Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der Lizenz BY Creative Commons verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt d'Original Auteur an d'Quell Kaiser sinn VerfÜgung

Funding:. Dës Aarbecht war déi Subventioune vun der Key plangen vun der Natural Science Foundation vun der Staat (Nr 81241111) ënnerstëtzt. D'Aglient an der funders hu keng Roll am Etude Design, Daten Kollektioun an Analyse, Décisioun, oder Virbereedung vun der mëttelalterlech Handschrëft ze publizéieren VerfÜgung

Wettsträit Interessen:. D'Auteuren erklären, datt hir mëttelalterlech Handschrëft keng Relatiounen mat Agilent Technologies Co huet, Ltd., Beschäftegung ze Liewewiesen, Consultancy, Patenter, Produiten an Entwécklung oder vermaart Produiten etc. Dëst ass en Deel vun engem master~s Projet a steet außer all intern Projet. Ee vun de jeeweilegen Auteuren, Xiaorong Ran, ass duerch Agilent Technologies Co, Ltd. agestallt, déi vun der Etude Design, Experimenter an /oder Analyse gehollef. Lei Wang ass och vun Agilent Technologies Co, Ltd. agestallt, déi de Studium an gehollef iwwerwaachter huet d'grammatesch Fehler an der mëttelalterlech Handschrëft vun verbidden. D'Auteuren confirméieren datt d'Beschäftegung vun Agilent Technologoies heescht ofzeänneren net hir onvergläichleche fir all vun der PLOS NËMMEN Politiken op sharing Daten a Material. VerfÜgung

Aféierung VerfÜgung

Gastric oppent ass e verbreet Krankheet, datt all vill Leit afflicts iwwer der Welt wéinst hirer héijer a héich morbidity. Laut de Statistike vun 2005, gouf d'Heefegkeet vun gastric oppent bis zu 80%, grad westlecher Welt. Et huet 40-80% vun onbekannt Frequenz ganzer Welt. Gastric oppent zu Mënsch méi heefeg wéinst verschiddenen endogenous an exogenous Facteure wéi Stress, Fëmmen, muss Mängel, Salz- Seier, pepsin, Helicobacter pylori VerfÜgung, Net-steroidal anti-demagogesch Drogenofhängeger benotzen (NSAIDs), Alkohol an Wonn [1]. Während deene Facteure geduecht gewiescht an der pathogenesis vun gastric ulcers Équipe ze sinn, ass de Mechanismus vun oppent Équipe nach net genee verstanen hunn [2], [3]. TCM huet Akzeptanz weltwäit am leschte Joer verdengten waarden an ass meeschtens als natierlechen a Gefor wier [4], [5]. Therapien genannt kollektiv TCM sinn Toast unzegesin gastric oppent, benotzt déi chinesesch herbal Medikament an Rezept ëmfaasst etc. VerfÜgung

QZWT Rezept vun komponéiert Corydalis yanhusuo VerfÜgung, Radix Glycyrrhizae VerfÜgung a Radix Bupleuri VerfÜgung änneren. extensiv genotzte zu gastric oppent fir Joerhonnerten an China Kur gewiescht, fir seng bedeitend therapeutesch Leeschtung vun de Medeziner Applikatioun Wéint [8] - [10]. Mir sidd CA vu Planzen "Corydalis yanhusuo W.T. Wang" mat der Rengheet vu 92%. Der chemescher Atomer vun Corydalis yanhusuo VerfÜgung gewiescht an eiser leschter Etude propagéieren. Tetrahydropalmatine, corydaline, protopine et al waren der biologescher Aktivitéite vun Corydalis yanhusuo VerfÜgung. D'Strukture vun der Atomer goufen iwwerpréift. CA gefält déi grouss aktiv Komponenten am Corydalis yanhusuo VerfÜgung [6], a bewisen gin antiulcer Effet ze hun fir vill Joren zu Chinese Medeziner Praxis benotzt gëtt [7]. Et huet och gemellt ginn, datt CA leie anti-demagogesch Effekt [8], [9]. Detailléiert molekulare Mechanismus vum CA awer, ass demno net gutt gastric oppent zu bestéet. VerfÜgung

der Aktioun Mechanismus vun Drogen ze erklären, huet metabolomics Methodik oft benotzt ginn [10]. Metabolomics ass e wichtege Bestanddeel vun Systemer Biologie, virun allem an der globaler metabolic Profil Bestëmmung vun Dausende vu klengen a grousse Molekülle an verschidde Medien rangéiert vun Zell Kulturen ze Mënsch biologescher Flëssegkeeten wéi Pipi, Spaut, a Blutt [11], [12] fonnt , [13]. Et ass e groussen Impakt op Enquête vun biomarkers entdecken, an Erkenntnesser Kopfhörer Weeër wéinst Krankheet oder Drogenofhängeger Behandlung [14]. Vun analyséiert an de spezifeschen fréi biomarkers vun enger Krankheet dër, erlaabt eis metabolomics besser ze Substanz metabolic Weeër verstoen wat de Mechanismus vun Aktioun klären kann [15]. VerfÜgung

rezenten Fortschrëtter vun vir an Berechnung erlaabt hunn gläichzäiteg Analyse vun enger grousser Zuel vun metabolites. HPLC zesummen mat MS bewise fir metabolites identifications an quantifications eng effikass geschéckt gin wéinst hirer excellent Resolutioun an Empfindlechkeet. D'Zil vun aktuell Etude war eng systematesch Vue ze kréien de Mechanismus vum CA wéi eng efficace Behandlung fir gastric oppent zu dissect. Déi spezifesch an eenzegaarteg biochemical Curriculum vun Drogenofhängeger Efficacitéit kann, identifizéiert ginn, wann mat multivariate analyteschen Techniken kräftegen. Den Zweck vun dëser Etude ass op verschidde metabolites identifizéieren, datt de Versteesdemech vun der Aktioun Mechanismus vum CA erliichtert hätt an Hëllef hir Aktivitéiten an Zukunft Verbesserung vun TCM Therapie. VerfÜgung

spontan a Methode VerfÜgung

2.1 ethneschen breakpoint VerfÜgung

All Experiment am Aklang mat der guttgeheescht Déier Ëmwelt- an Richtlinnen etabléierten vun Medezin IFLA- Kritik Komitee fir Déier Experimenter vun Liaoning Universitéit vu klassesch chinesesch Medezin gesuergt. VerfÜgung

2,2 Déieren mat an Sample Virbereedunge

Seven-Woch-alen Mann Fils deër Persoun 200-250 g, waren déi vun der experimentell Déier Zentrum vun Dalian Medical University gëtt. D'Betreiung an Ëmgank vun deër sech am Aklang mat der Norm vun Spezifësch Pathogen Free. Gastric oppent war an der deër no der Method vun engem fréiere Rapport mat engem liichte Ännerungen [16], [17] entschlof. Dräi Deeg no der Produktioun vun gastric oppent, vun deër goufen an fënnef Gruppen zoufälleg: Kontroll, Modell, CA héich Dosis Grupp (32.4 mg /ml), CA Mëtt Portioun Grupp (10.8 mg /ml) an CA héich Dosis Grupp (3.6 mg /ml). All vun deër, an Gruppen sech mëndlech vun der aktiver Grupp Léisung verwalte 1,5 ml eemol Alldag (Modell a Kontroll Gruppe mat Salins) fir 7 Deeg. D'deër verbueden sech keng Liewensmëttel fir 12 h virum Experimenter, mä sech Accès zu Waasser fräi erlaabt. VerfÜgung

Op de leschten Dag, deër goufen ënnerlech Nodeel a geaffert dann. Blood war gesammelt, Plasma an serum via centrifugation fir 15 min bei 4 ° C um 3000 Ziichter getrennt goufen. D'Plasma Echantillon sech gesammelt a gespäichert bei -80 ° C weilt an flëssegem Stéckstoff bis metabolomics Analyse gefruer waren gesuergt. Dunn huet d'Mamm laanscht de gréissere curvature Géigewier, mat Salins gewäsch. Der Géigend vun oppent war duerch e Spigel gemooss oppent Index ze moossen. Der Géigend vun oppent fusionnéiert fir d'Breet vun der oppent mol d'Längt vun der oppent. Fir histological Evaluatioun, gastric Otemschwieregkeeten Echantillon waren fir 24 h an neutral gefiermt formalin fest. Mo. Rubriken huet léif mat graded Ethanol, duerch xylene gestëmmt, an am paraffin Ënnerbewosstsinn. Paraffin Rubriken (5 mm deck) sech mat hematoxylin /eosin (HIEN) geschriwwen. Wéinst gastric ulcerated Stoffer ware séier geläscht a flëssegem Stéckstoff bis d'Reduktioun vun insgesamt Otemschwieregkeeten RNS gefruer. VerfÜgung

2,3 Metabolic Profiling VerfÜgung

2.3.1 Chromatography. VerfÜgung

Chromatography war gesuergt mat enger Serie HPLC System Agilent 1100 equipéiert mat quaternary Pompel, online degasser, autosampler, an thermostated Kolonn ofgeliwwert. D'Sprëtz Volumen war um 4 μL fest. All d'Echantillonen sech um 4 ° C an der Analyse haten. Déi Trennung gouf standing op engem 4,6 * 100 mm, ZORBAX SB-C18 Kolonne (Agilent, USA). D'Kolonn Temperatur gouf bei 45 ° C virbereet. Den Handy Phasen sech zesummesetzt vun 0,1% formic Seier an Waasser (Léisungsmëttelbad B) an 0,1% formic Seier an acetonitrile (Léisungsmëttelbad A), de Flux Tarif wéi 1 ml /min mat gedeelt Verhältnis 1:3 Formatioun huet, war d'Temperaturgefäll benotzt als villméi: eng linear Temperaturgefäll vun 70- 33% B iwwer initial- 5.0 min, 33 -98% B iwwer 5.0-12.0 min. D'eluent war direkt un der Mass Spektrometer agefouert. No all 10 Echantillonen iergendee, war fir d'Stabilitéit an repeatability vun der LC-MS Systemer ze garantéieren. VerfÜgung

2.3.2 Mass Spectrometry heijen vun engem Leerzeechen engem hinzeginn Beispill wéi d'QC Prouf. VerfÜgung

fir Mass spectrometry, déi Agilent 6220 Ënnerportal-MS mat enger electrospray Eegeliichten Quell (ESI) an negativ Modus benotzt gouf. De Flux Taux vun Stierwen Gas (N2) war um 9 L /min setzen. D'nebulizer war um 45 keng Gefor setzen. Wéinst optimal Konditiounen sech wéi follegt zesummen: Stierwen Gas Temperatur vun 350 ° C, ofgesprengt Volt 120 V. Data waren am vollen-Scanner Modus vum m /Z 50 bis 1050 amu iwwer 0-12 min gesammelt. D'MS Date goufen zu centroid Modus gesammelt. VerfÜgung

2.3.3 Multivariate Donnéeën Analyse. VerfÜgung

Data Analyse Prozedur ass am Lalumi gewisen. 1. D'cuisine Spillfilmer Hotte (MFE) sind an der Mass Hunter qualitative Analyse Software war vun Ufank un molekulare Fonctiounen-onidentifizéierte, untargeted awer Extrait - zu jidderengen vun den Donnéeën. D'MFE sind gesäit fir Mass Signaler (Protonen) dass covariant zu Zäit ginn, méngt méiglech chemesch Relatiounen (Isotopen, adducts, dimers, Multiple Vitesse Staaten), a generéiert en ofgebaut Massa chromatogram a Massa Mass Spektrum fir all molekulare Fonktioun. De Quecksëlwer Massa Lëscht fir all Fichier gouf als Massa Exchange Format (. CEF) Fichier fir weider Mass PROFILER Ugestallten (Versioun B.2.00, Agilent) statistesch Analyse exportéiert. Déi doraus resultéierend Fonktioun Fichieren fir all Prouf huet déi ANOVA an PCA Analyse Filteren der MPP Software schreiwen, déi bestëmmen, normalized, visualized an Filter de molekulare Funktiounen (MFS), fir weider Ofwécklung [18], [19], [20], [ ,,,0],21]. Duerno, war fir d'Daten Fichieren applizéiert Hierarchie Käre (Conditioun Bam). Hierarchie Stärekoup Analyse ass eng statistesch Method fir Grupp vun anescht Stärekéip oder Secteuren vun der Hierarchie Bam unsupervised Echantillon. An dësem Wee, sinn d'Relatiounen tëscht de verschiddene Gruppen gewisen. D'Konditioun Bam gouf als Hëtzt Kaart gewisen. D'Identitéit vun biomarkers mat groussen Ännerungen an der Gruppe war vun ID Browser Charakteristike vun MPP alles. VerfÜgung

2.3.4 Biomarkers Umeldung. VerfÜgung

D'Identifikatioun vun Potential biomarkers vun Q-Ënnerportal (Xevo alles war G2). D'MS Kollisioun Energie ass 35ev, an d'Daten vun den negativen ioun Modus, x kritt (V4. MassLn1) Software war fir Daten Analyse benotzt. D'Identitéit vun der spezifesch metabolites sech duerch Elementer Informatiounen Verglach vun hirer Mass Spektren mat der elemental Zesummesetzung Informatiounen vun der Software gëtt confirméiert. VerfÜgung

2.3.5 Network an Passerelle Analys. VerfÜgung

MPP Software gouf agestallt fir all wichteg (Dossier änneren > 2) an gereegelt an Ugrëff reegelen metabolites an Zesummenhang mat der biologescher Weeër. D'Potential lues identifizéiert sech mat der korrekt Mass Vitesse Verhältnis zu puer Datenbanken Verglach, dorënner HMDB, Kegg, METLIN, Lipid Kaarten an PUBCHEM, ze dinn Weeër entdecken. T-Test a fantastesch-ofzeänneren sech benotzt statistesch Bedeitung an d'Weeër ze bestëmmen. P Wäert &Si besteet; 0,05 a Dossier änneren > 2 war geduecht fir statistesch relevant Critèren ze gin a wär ausgewielt ginn VerfÜgung

2,6 cuisine Data VerfÜgung

Total RNS war vun Mo. Stoffer dorënner Kontroll, Modell an CA ofgebaut. Gruppen engem TRIZOL reagent benotzt (Invitrogen, Karlsbad CA, USA) pro d'Uweisungen d'Hiersteller. cDNA war aus total RNS Wierderbuch (1 μg) benotzt TransScript Éischt-Strand cDNA Synthes SuperMix Kit (Peking TransGen Biotech, China). Chemeschen real Zäit Hinnen alleguer (CFX96, BIO-RAD, USA) war standing engem TransStart ™ Top Green qPCR SuperMix Kit benotzt (Peking TransGen Biotech, China). benotzt Primers S1Pr1, S1Pr3, SphK1, Got2 an Fabp1 sech aus Invitrogen (S1Pr1 zu Meenungsfreiheet nennt: GenBank zu Enn kee NM_017301, S1Pr3:.. GenBank zu Enn kee XM_225216, SphK1:.. GenBank zu Enn kee NM_133386, Got2:... GenBank zu Enn Nee . NM_013177.2, Fabp1:.. GenBank zu Enn kee NM_012556.2) an Ausdrock vun dësen gët war géint de housekeeping Gentherapie β-actin laachen, déi 5'-TGGCACCACACTTTCTACAATGA-3 'an 5'-AGGGACAACACAGCCTGGAT- mat der primers Implikatioune war 3 '. Ausdrock Niveau vun Zil- Genen sech mat der CFX Manager System (BIO-RAD, USA) analyséiert. VerfÜgung

2,7 statistique Analys VerfÜgung

Data sinn als mengen ± Sem ausgedréckt. SPSS 19,0 fir Windows war fir statistesch Analyse benotzt. D'Date goufen mat der ANOVA analyséiert, mat p &Si besteet; 0,05 den Niveau vun statisteschen Bedeitung Formatioun VerfÜgung

Resultat VerfÜgung

3.1 Effekt vum CA op der acetic Seier gastric oppent Modell VerfÜgung heijen-entschlof.

d'experimentell Modell vun acetic Seier heijen-entschlof gastric mucosal Schued an deër ass oft ugestallten der awer fir anti-oppent Aktivitéit zu Écran an datt et als Spëtzekandidat Ursaach vun gastric oppent déngt zu Mënschen [22]. Acetic Seier enorm gastric mucosal Schued an der Opstellung vu oppent an de Modell Grupp (Figebam. 2A) deër heijen-entschlof, datt eng wesentlech Differenz ass am Verglach mat der Kontroll Grupp (Figebam. 2B). Agebousst Observatioun gouf benotzt fir den Schued vun acetic Seier-entschlof zu confirme ulteriorly an der iwwerflächlech Schichten vun gastric mucosa. Acetic Seier-entschlof gastric ulcers (Figebam. 2C) huet eng Erosioun Effekt op d'mucosa, déi vun Fleesch an Aarbecht an demagogesch Zell net einfach an der décker Verglach mat Kontroll (Figebam. 2D) begleet war. D'Resultater bewisen, datt de Modell vun gastric oppent erfollegräich kopéiert gouf. D'Resultater vun der Zäit-Cours gewisen an Figebam. 2E Ganzt datt de Beräich vun oppent an deër mat CA behandelt nach vill méi kleng wéi um siwenten Dag op der jeweileger Wäerter an de Modell deër Verglach, sou choosed mir d'Echantillonen d'siwenten Dag fir Analyse. Fir d'Auswierkunge vum CA diskutéieren, wéi zu Lalumi bewisen. 2F, war de Beräich vun gastric oppent am CA Portioun Gruppen ofgeholl vill mat de Modell Grupp (p &Si besteet; 0.01) am Verglach. Eis experimentell Resultater hindeit, datt CA kann wierksam der gastric oppent Kur, besonnesch d'Mëtt Portioun Grupp. Et schéngt, datt do eng schéi iwwerlageren ënnert der neuronal pathogenetic Weeër an oppent Moses an Depressiounen Équipe ass. Dofir, ass et net aussergewéinlech, dass Medikamenter fir den Traitement vun depressiv Episode och mächtegst Schutzpatrounin Effekt géint gastric oppent [23] huele kann. De Grond firwat CA Mëtt Portioun Grupp eng besser therapeutesch Wierkung wéi héich Dosis Grupp hu vläicht CA ginn héich Dosis Grupp eng Roll Nerve inhibit huet. Den Effet vum CA war de Mechanismus fir weider z'ënnersichen iwwerpréift. VerfÜgung

3,2 Metabolomic Sécuritéit VerfÜgung

3.2.1 Acquisition an Veraarbechtung vun metabolic Profil Daten. VerfÜgung

D'Vertrieder total ioun chromatograms ( In-) vum Plasma Echantillon aus Kontroll ofgeleet, Modell, an CA Portioun Gruppen zu negativ Verkéiersmëttel sinn zu Lalumi presentéiert. 3 vun der optimal LC-MS Konditiounen uewen beschriwwen benotzt. Low molekulare Mass metabolites getrennt gutt an der kuerzer Zäit vun 15 min gin konnt. Fir besser bestallt waren der subtiler eraus an Oneenegkeet ënnert dëse komplexe Donnéeën baut, Multiple Muster Unerkennung Methode geschafft de Plasma metabolome vun deër zu phenotype. Hei, goufen Hierarchie Käre Analyse an PCA benotzt der metabolic phenotypes ze klassifizéieren an der differenting metabolites z'identifizéieren. Hierarchie Käre Analyse vun metabolomics Donnéeën zougedréckt z'ënnerscheedde Segregatioun tëscht der Kontroll, Modell Grupp an CA Portioun Grupp (Figebam. 4). An der PCA ragerullt, stellt all Punkt individuell Prouf. D'PCA Resultater sinn als stoung Diagrammen besot d'luucht vun der Echantillonen, déi ähnlech metabolomics weg kucke ugewisen wann zesummen an compositionally verschiddene metabolomes Strooss wou verspreet. D'PCA Fändelen ofgestridden hätt de verschiddenen Plasma Echantillonen an Bleck Gruef, bzw. suggeréiert, dass d'metabolic Profiler geännert hunn. Mat wat fir Informatiounen Analyst vun PCA an eiser Experimenter weisen an Figebam. 5, d'Kontroll an Modell Gruppe waren däitlech an zwou Klassen agedeelt, wat beweist, dass de Modell vun acetic Seier-entschlof gastric oppent war erfollegräich kopéiert. Méi dezent Ännerunge kënnt vun der Muster Unerkennung Approche-stoung Diagramm vun PCA fonnt ginn. PCA Resultater weisen, datt de Modell Grupp vun de Rescht véier Gruppen wäit ewech war, wat beweist, datt geännert metabolic Muster aus acetic Seier-entschlof Schoss aus aneren vill anescht kann. D'Positioun vun Behandlung Grupp war bei der Kontroll Grupp, suggeréiert datt geännert metabolic Muster vun CA. ëmmer war D'Resultater manifestéieren, datt CA konnt den Manque metabolic Zoustand änneren an eng aner Behandlung Mechanismus vun acetic Seier-entschlof gastric oppent hun kann. VerfÜgung

3.2.2 Umeldung vun Potential biomarkers. VerfÜgung

De klenge-Protein metabolites vun Differenze (T-Test, p &si besteet; 0,05) sech duerch d'Software vun MPP gesichte. D'Potential lues huet andems de "ID Browser" identifizéiert an Metlin Datebank ze sichen (http://metlin.scripps.edu/) an am Verglach mat der korrekt Mass Vitesse Verhältnis zu puer Datenbanken, dorënner HMDB (http: //www. hmdb.org/), Kegg (http://www.genome.jp/kegg/), Lipid Kaarten (http://dev.lipidmaps.org:25424/), an PUBCHEM (http: //pubchem.ncbi. nlm.nih.gov/). Mir kënnen d'eventuellen Numm vun Potential biomarkers duerch d'éischt Schrëtt wëssen. Am Moment studéieren, goufen 10 potentiellen biomarkers identifizéiert (Table 1). Déi genee molekulare Mass vum awer mat groussen Ännerungen an der Gruppe war bannent Miessung Feeler alles (&Si besteet; 5 ppm) vun Waters Xevo G2 QTOF, an der Tëschenzäit, den Potential elemental Zesummesetzung Ofschloss vun unsaturation an fractional Isotop Heefegkeet vun awer kritt huet. D'ugin molekulare Formule war zu Chemspider (http://www.chemspider.com/), HMDB an aner Datebanken ze identifizéieren déi méiglech chemesch Verfassungen an MS /MS Date goufen d'Potential Strukturen vun de Protonen ze bestëmmen opgefouert gesichte. Sphingosine-1-phosphate (S1P) an stearic Seier sech als Beispiller geholl Fragmenter vun der Struktur an der verbonn Prozess Ganzt. Der Primärschoul an de Lycée Mass spectrometry Informatiounen war vun Masslynx (Visioun 4,1, Waasser) analyséiert Software, am Verglach mat Datebank, an ioun Fragmenter vun 379.2488 (C _{18h 38NO 5P) waren an Lalumi gewisen. 6 A. Den Haaptgrond ofgesprengt Protonen analyséiert vun MS /MS Duerchmusterung sech m /Z 224,080, 165,1254 an 82,0238, déi zu verluer C 7H 15NO 5P, C 11 sëlwecht kéint 17O, C 4H 4NO bzw.. Endlech war et sou S1P spekuléieren der refering an no hir Polaritéit Gréisst. Mëttlerweil, ioun Fragmenter vun stearic Seier 284.2715 (C 18h 36O 2) (Figebam. 6 B) waren 212.2419 (C 15 32), 143.1359 (C 9h 19O), 117.0962 (C 6H 13O 2) an 83.0962 (C 6H 11). VerfÜgung}

D'biomarkers uewen beschriwwen bewisen huet hutt no Relatioun mat der Formatioun a Behandlung vun gastric oppent. Déi vill weider reglementéiert D-Zocker, lysine, Uric Seier, pyruvic Seier, corticosterone, sphingosine-1-phosphate an der verwandelt reegelen hun kee gudd Gefill, glycocholate, hexadecanedioic Seier, stearic Seier waren am Modell Grupp observéiert Verglach mat Kontroll Grupp (Figebam. 7 ). Dës Differenz vun metabolites kënnen hir Potential wéi geziilte biomarkers Geleeënheet fir gastric oppent an normal Staaten aneren. Iwwerwachung Ännerunge vun dësen metabolites kann d'Entwécklung vun gastric oppent virauszesoen. D'biomarkers 1, 2, 3, 4, 7, 8 No der Behandlung vun CA ofgeholl huet, am Géigendeel, huet den Trainer biomarkers fräi. Ausserdeem, fir antiulcer Auswierkunge vum CA méi kloer, Ännerungen an der famill Konzentratioune vun Zil- metabolites identifizéiert an verschidden Gruppen zu Markenzeeche analyséiert huet, hu mir, datt den Inhalt vun dëse Schlëssel lues fonnt méi normal Grupp. D'Resultater weg den Mechanismus fir d'Behandlung vun gastric ulcers kann duerch d'Regulatioun vun deene vill ze lues an hir Interaktioun Figebam erreecht ginn. 8. Zum Beispill, wat stearic Seier 17FA genannt, huet Relatioun mat thapsic Seier wann d'FAQ Fabp1 (fatty Seier-verbindlech FAQ 1). D'Netz net nëmmen Kuuscht Interaktioun tëscht biomarkers, mä stellt och Informatioune vun Potential FAQ, Genen, Enzymen a biologesche Prozesser. Et dréit zu der Entdeckung vun Zil- während d'Virkommen an Behandlung vun gastric oppent an ass zu der Entwécklung vun neie Drogenofhängeger schwetzen gastric oppent ugewandt. VerfÜgung

3,3 Entschlossenheet vun mRNA Niveauen der biomarkers ze confirméieren VerfÜgung

fir eis metabolomics Conclusiounen confirméieren, brauche mir e puer molekulare Donnéeën, sou identifizéiert mir 5 mRNAs déi zu der 4 potentiell biomarkers an 2 metabolic Weeër mat RT-Hinnen alleguer Zesummenhang sinn. Sphingolipid ukuerbelt, dorënner S1Pr1, S1Pr3 an SphK1 sech als an Lalumi awer iwwerpréift. 8. D'Resultater sinn an Lalumi zesummegefaasst. 9. D'mRNA Niveau vun S1Pr1, SIPr3 an SphK1 bedeitend an d'Model Grupp upregulated waren, goufen d'Ausdrock Niveauen 5,21, 2,54, 6,57 Mol am Verglach zu der Kontroll Grupp, déi am Accord mat eiser leschter Conclusiounen an Donnéeën huet. No CA Behandlung, huet den Ausdrock Niveau vun S1Pr1, S1Pr3 an SphK1 zréck ze basal Niveau. S1P ass vun zwee kinases, sphingosine kinase 1 an 2 (SphK1 an SphK2) gemaach, mee keng Ennerscheeder sech zu SphK2 Ausdrock ënnert all de Gruppen (Donnéeën net gewisen), d'Resultat war konsequent mat eise Réseau Conclusiounen observéiert. Hei kënne mir e Potential Mechanismus vum CA zu bestéet gastric oppent vun erauszesichen S1P waarden erklären. Mir hunn och eng Verréngerung Ausdrock vun Fabp1 an Got2 zu Modell Grupp (Figebam. 9), am Verglach mat Kontroll Grupp. Mä CA heescht Gruppe bei zu der Kontroll Grupp waren, déi bestätegt, datt d'therapeutesch Wierkung vum CA ze fatty Seier ukuerbelt aus molekulare Niveau dinn huet. VerfÜgung

3,4 Passerelle Analys VerfÜgung

Méi detailléiert Analyse vun Weeër a Netzwierker vun gastric oppent beaflosst war vun MPP gesuergt. Den Édouard kritt weist an Table 2. Mir benotzen d'Héich-Qualitéit Kegg metabolic Weeër wéi de Backend Wëssen huel déi relevant Weeër, wéi sphingolipid ukuerbelt, tricarboxylicacidcycle Seier Zyklus, biotin ukuerbelt an sou op, an déi 7 eenzegaarteg Weeër ze identifizéieren ( opgezielt an Table 1) fir de Modell Grupp identifizéiert huet. Potential biomarkers Zesummenhang mat folic Seier ukuerbelt, fatty Seier ukuerbelt, an sphingolipid ukuerbelt Weeër sech och conformed. Vun de 6 verschidde metabolites aus dëse Weeër identifizéiert, si vill vun verschidden Etappe vum Fortschrëtt vun der gastric oppent. Puer wesentlech geännert metabolites wëll glycocholate, hexadecanedioic Seier, an stearic Seier goufen a benotzt fir d'fatty Seier Mechanismus erklären. Dës Resultater hindeit, datt dës Zilsprooch Édouard de markéiert Wierkung iwwer d'Opstellung vun gastric oppent weisen an zu der Entwécklung vun gastric oppent bäidroen kéinten. VerfÜgung

Diskussioun VerfÜgung

Gastric ulcers zu Mënschen recur oft, an d'Schwieregkeet zu bestéet ass si vun der adage "Wann en oppent, ëmmer en oppent" [24] uginn. Vill Facteuren kann d'Heefegkeet vun gastric oppent Erhéijung, mä de Mechanismus ass haut net verstanen. Dofir, hänkt d'Effikacitéit vun Drogenofhängeger Behandlung net nëmmen op de Verloscht vun Lupp Facteuren, mä och op d'geännert metabolites datt d'ukuerbelt Passerelle regléieren. Besonnesch d'Entdeckung vun biomarkers datt de Risiko vun gastric oppent virauszesoen gëtt eng Méiglechkeet bidden, fir depressiv an virgesinnen pharmacological Behandlung ufroen. QZWT war benotzt gastric oppent fir vill Joren zu Asien ugewandt obwuel seng Mechanismus ongeklärten bleift. Metabolomics zesummen mat multivariate Hëllefsprogrammer datt gläichzäiteg dausende vun metabolites zu engem liewege Gebeitechnik ofgedonkelt gouf fir d'biomarkers zu gastric oppent [25] ze analyséieren. Zousätzlech huet Verständnis vun biomarkers nei Interessi vun de Felder vun Drogenofhängeger Entdeckung Programmer an Krankheet Observatioun, déi wäertvoll a-rësele iwwer komplex Krankheet Mechanismen [26] lescht Joren. Dës Etude ass also d'Basisdaten Mechanismus vum CA ze weider entschlësselen entworf op gastric oppent Regulatioun vun der metabolic Weeër an eng global Visioun. VerfÜgung

De Modell vun gastric oppent an deër gouf erfollegräich kopéiert. Plasma Echantillon sech duerch HPLC /ESI-Ënnerportal-MS an multivariate statistesch Analyse analyséiert. D'Resultater weisen, dass am Beräich vun der oppent an dynamesch metabolic Profiler der CA Behandlung an d'Kontroll Grupp zou sech Musiktherapie- datt CA therapeutesch Efficacitéit haten. Laut metabolomics Analyse, 10 potentiellen biomarkers a 7 Zesummenhang metabolic Weeër sech an eiser Etude identifizéiert. Déi vill iwwer reegelen D-Zocker, lysine, uric Seier, pyruvic Seier, corticosterone, sphingosine-1-phosphate an an gereegelt hun kee gudd Gefill, glycocholate, hexadecanedioic Seier, stearic Seier waren am CA Grupp observéiert Verglach mat Modell Grupp. Ausserdeem goufen folic Seier ukuerbelt, fatty Seier ukuerbelt, an sphingolipid ukuerbelt a vill aner ukuerbelt confirméiert en Impakt op gastric oppent ze hunn. Mir hunn den Ausdrock vun mRNAs bestëmmen Zesummenhang ukuerbelt an fatty Seier un sphingolipid ukuerbelt de Mechanismus ze validéieren. Vill aner potentiell Proteinen, Genen, Enzymen an bioprocess fir aner Weeër zougemaach Zukunft Experimenter brauchen ze validéieren. VerfÜgung

Vun analyséiert an de spezifeschen fréi biomarkers vun enger Krankheet dër, metabolomics eis besser erlaabt ze agebousst Prozesser an Substanz metabolic Weeër verstoen . Mir gleewen, datt de uweist an Passerelle hunn grousse Potential analyséiert d'therapeutesch Aktioun vum TCM Entdeckung an klären. Am Moment studéieren, hunn mir uweist Interaktioun charakteriséiert Netzwierker Debate Proteinen, Genen, Enzymen an bioprocess wéi an Lalumi gewisen. 8. S1P Akt extracellularly als ligand fir hir spezifesch kenne-S1PRs, ass elo esou regulator vu ville gestallt an pathophysiological Prozesser unerkannt, dorënner demagogesch Onuerdnung, wéi rheumatoid Giicht, demagogesch bowel Krankheet, an sepsis [27], [28]. Inflammation datt an der mucosal vun gastrointestinal TRACT existeiert, doduerch, bewierkt gastrointestinal oppent [29]. Eis Resultater weisen, datt CA den Ausdrock vun S1P a seng kenne erofgoen kann, dorënner S1Pr1 an S1Pr3, inflammation Problemer d'Équipe vun gastric ulcers anersäits [30] ze entlaaschten. S1P ass vun SphK1 an SphK2 [31] entstanen. SphK1 kann aktiv der NF-κB Passerelle déi vun de groussen demagogesch sécher Protein TNF-α ageleet. An dowéinst, NF-κB an TNF-α ass enk Zesummenhang gastric oppent zu Form an heelen [32], [33]. Mir hunn och, datt de hunn vun SphK1 (net SphK2) bedeitend gastric oppent bremst, wat beweist, datt SphK1 enger Jarnéier Roll an gastric oppent spille kann. Soumat kënnen d'sphingolipid ukuerbelt engem liewensfäeg Zil fir bestéet gastric oppent ginn. VerfÜgung

Stearic Seier, glycocholate an hexadecanedioic Seier geännert fatty Seier ukuerbelt Stéierungen Feierowend zu der Heefegkeet an Blessuren gastric oppent [34] Ursaach, [35] . Fatty Saieren, dorënner etc stearic Seier, sou wéi d'Quell vun Energie gekuckten, hunn Intressi fir Fuerschung an ëffentlech Gesondheet ugezunn, wéinst hir Auswierkungen op mënschlech Gesondheet a Krankheeten. Fatty Saieren sinn positiv un der Gesondheet-Promotioun. Stearic Seier, glycocholate an hexadecanedioic sinn duerch Fabp1 reegelen, d'Aktivitéit vun fatty Seier-verbindlech FAQ 1. An Analyse vun RT-Hinnen alleguer, seet de niddereg Ausdrock vun Fabp1 zu Modell Grupp datt inhibiting Fabp1 Aktivitéit stearic Seier reduzéiere kënnen, glycocholate an hexadecanedioic Seier , an zu fatty Seier ukuerbelt Stéierungen Féierung. Dofir fräi demagogesch Äntwert an Kënschtlech Viagra an oppent Opstellung förderen. Allerdéngs kann CA dëser Stéierungen Gläichgewiicht duerch den Ausdrock vun Fabp1 waarden [36]. Glutamic-oxaloacetic transaminase 2 (Got2) ass eng wichteg Aktivitéit an der tricarboxylicacidcycle Seier Zyklus (TCA Zyklus). Déi streng inhibition vun TCA duerch d'Verréngerung vun Got2 ëmmer wäert zu Équipe vun gastric oppent bäidroen. D'metabolites vun Aminosaier Saieren wéi hun kee gudd Gefill an hirer metabolites zu VIVO hunn eng extensiv Roll an hun kee gudd Gefill ukuerbelt. Déi wichtegst ass, datt hun kee gudd Gefill ukuerbelt Entwécklungsstéierungen TCA Stéierungen verursaache kann. TCA spillen eng wichteg Roll am verkënnegt gastric oppent [37]. Down-Regulatioun vun Got2 mRNA Ausdrock vun Modell Grupp a weider-Regulatioun am CA Gruppen sech virdrun an eiser Resultat bewisen. All dës Donnéeën kloer dass de molekulare Mechanismus vum CA bestéet gastric oppent war enk mat senger Gläichgewiicht Auswierkungen op TCA soll. Dës Resultater implicate der CA Effete duerch FAQ mediated kann, Enzymen, an ukuerbelt Passerelle.

• PLOS NËMMEN: D'manner Expression vun Proangiogenic Wuesstem fir op an hirer kenne zu Gastric Ulcers vun Cirrhotic Patients
• PLOS NËMMEN: An VIVO neier Étude an Antiulcer Aktivitéit vun Parkia speciosa Ethanolic Leaf Extrait géint Ethanol-entschlof Gastric oppent zu Rats