PLoS One: metabolomika párosulva többváltozós statisztikai és útvonal elemzés potenciális biomarkerek gyomorfekély és Intervenciós hatásai Corydalis yanhusuo Alkaloidkémiai

absztrakt katalógusa

metabolomikára szisztematikus elemzésére lehetséges metabolitok biológiai mintában, egyre inkább alkalmazzák felfedezni biomarkerek azonosítása zavart utak, mérés terápiás célokat, és felfedezni az új gyógyszerek. Elemzésével és ellenőrzése jelentős különbség a metabolikus profilok és változásait metabolit biomarkerek, metabolomika lehetővé teszi számunkra, hogy jobban megértsük az anyag metabolikus utak, amelyek tisztázza a mechanizmust a hagyományos kínai gyógyszerek (TCM). Corydalis yanhusuo katalógusa alkaloid (CA) egyik fő komponense Qizhiweitong (QZWT) vényköteles, amely kezelésére használt gyomorfekély évszázadok óta, és annak mechanizmusa még nem tisztázott teljesen. Anyagcsere profiljának végeztük HPLC kombinált time-of-járat tömegspektrometria (HPLC /ESI-TOF-MS) és együtt többváltozós adatelemzés és útvonal elemzés. A statisztika szoftver Mass Profiller Prossional (MPP) és statisztikai módszer, beleértve ANOVA és a főkomponens analízis (PCA) használtunk felfedezni új potenciális biomarkerek tisztázni mechanizmusa CA kezelésében sav injektált patkányok gyomorfekély. A változásokat a metabolikus profilalkotás állították helyre a viszonyítási értékekkel után CA szerinti kezelés a PCA pontszám parcellákon. Tíz különböző potenciális biomarkerek és hét fő metabolikus utat hozzájárul kezelésére gyomorfekély felfedezték és azonosították. Között utak, sphingophospholipid anyagcsere és zsírsav anyagcsere kapcsolódó hálózat volt akut megzavarodtak. Kvantitatív valós idejű polimeráz láncreakció (RT-PCR) elemzéssel végeztük, hogy értékelje a gének expresszióját kapcsolódó két útvonal ellenőrzésére a fenti eredményeket. Az eredmények azt mutatják, hogy a megváltozott biomarkerek és utakat is bizonyítékot szolgáltat betekintést a kábítószer hatásmechanizmusok és lehetővé teszi számunkra, hogy növeljük a kutatási termelékenység felé metabolomikára gyógyszerkutatásban. Katalógusa

Citation: Tianjiao L, Shuai W, Xiansheng M, Yongrui B, Shanshan G, Bo L, et al. (2014) metabolomika párosulva többváltozós statisztikai és útvonal elemzés potenciális biomarkerek gyomorfekély és Intervenciós hatásai Corydalis yanhusuo katalógusa alkaloid. PLoS ONE 9 (1): e82499. doi: 10,1371 /journal.pone.0082499 katalógusa

Szerkesztő: Rakesh K. Srivastava, The University of Kansas Medical Center, Amerikai Egyesült Államok katalógusa

Beérkezett: May 15, 2013; Elfogadva: október 24, 2013; Megjelent: január 15, 2014 katalógusa

Copyright: © 2014 Tianjiao et al. Ez egy nyílt hozzáférésű cikk feltételei szerint terjeszthető a Creative Commons Nevezd meg! Licenc, amely engedélyezi a korlátlan használatát, a forgalmazás és a reprodukció bármilyen adathordozón, feltéve, hogy az eredeti szerző és a forrás jóváírásra. Katalógusa

Forrás: Ez a munka ben támogatták a Key Program a Természettudományi Alapítvány az állami (No. 81241111). A Aglient a finanszírozók nem volt szerepe a tanulmány tervezés, adatgyűjtés és elemzés, döntés, hogy közzéteszi, vagy a készítmény a kézirat. Katalógusa

Érdekütközés: A szerzők kijelentik, hogy kézirat nincs kapcsolat az Agilent Technologies Co, Ltd., a foglalkoztatással, tanácsadás, szabadalmak, a fejlesztés alatt álló, illetve a forgalmazott termékek stb Ez része egy master~s projekt áll, eltekintve bármilyen belső projekt. Az egyik a megfelelő szerzők Xiaorong Ran, alkalmazza Agilent Technologies Co., Ltd., aki segített a tanulmány tervezés, a kísérletek és /vagy elemzéseket. Lei Wang is alkalmazunk az Agilent Technologies Co., Ltd., aki felügyelte a vizsgálatot, és segített módosulna a nyelvtani hibákat a kéziratot. A szerzők megerősítik, hogy a foglalkoztatás az Agilent Technologoies nem változtatja meg a ragaszkodás bármely PLoS One politikák adatok megosztása és anyagok. Katalógusa

Bevezető katalógusa

gyomorfekély elterjedt betegség, amely sújtja sokan minden a világ miatt egyre magasabb morbiditás. A statisztikák szerint 2005-ben, az előfordulási gyomorfekély volt, akár 80% -os, különösen a nyugati világban. Ez 40-80% visszatérő gyakorisága az egész világon. Gyomorfekély emberekben gyakran fordulnak elő, mert különböző endogén és exogén tényezők, mint a stressz, a dohányzás, táplálkozási hiányosságok, sósav, pepszin, Helicobacter pylori katalógusa, a nem szteroid gyulladáscsökkentő gyógyszer használatra (NSAID-ok), az alkohol és a fertőzés [1]. Míg ezek a tényezők is gondolják, hogy részt vesz a patogenezisében gyomorfekély, a mechanizmus a fekély kialakulása még nem pontosan ismerjük [2], [3]. TCM egyre elfogadottabbá világszerte az elmúlt években, és általában úgy tekintik, hogy a természetes és ártalmatlan [4], [5]. Terápiákkal együttesen úgynevezett TCM általánosan használt kezelésére gyomorfekély, amely magában foglalja a kínai gyógynövény és recept stb katalógusa

QZWT recept tagjai Corydalis yanhusuo katalógusa, Radix Glycyrrhizae katalógusa és Radix Bupleuri katalógusa ect. már széles körben használják, hogy gyógyítani gyomorfekély évszázadok Kínában, köszönhetően a jelentős terápiás teljesítményt a klinikai alkalmazás [8] - [10]. Mi tisztított CA növényekből "Corydalis yanhusuo W. T. Wang" a tisztaság 92% -os. A kémiai összetevői Corydalis yanhusuo katalógusa vizsgálták a korábbi tanulmány. Tetrahydropalmatine, corydaline, protopin munkatársai voltak a biológiai aktivitása Corydalis yanhusuo katalógusa. A szerkezeteket az összetevők vizsgáltuk. CA elismerik, hogy a fő hatóanyagot Corydalis yanhusuo katalógusa [6], és kimutatták, hogy fekélyellenes hatást használják a kínai klinikai gyakorlatban sok éven át [7]. Azt is leírták, hogy a CA rendelkezik gyulladásgátló hatás [8], [9]. Azonban a részletes molekuláris mechanizmusa CA kezelésére gyomorfekély nem kellően tisztázott. Katalógusa

kifejtse a hatásmechanizmusa gyógyszerek, metabolomikára módszert már széles körben használják [10]. Metabolomika fontos eleme a rendszerek biológia, különösen meghatározó a globális metabolikus profil detektálásával több ezer kis és nagy molekulák különböző média kezdve sejttenyészetekben az emberi biológiai folyadékok, például vizelet, nyál, vér és [11], [12] , [13]. Ez nagy hatással van a vizsgálat felfedezni biomarkerek azonosítása és megzavart utak miatt a betegség vagy gyógyszeres kezelés [14]. Elemzésével és ellenőrzése alapján korai biomarkerek egy betegség, metabolomika lehetővé teszi számunkra, hogy jobban megértsük az anyag metabolikus utak, amelyek tisztázzák a hatásmechanizmusa [15]. Katalógusa

Recent advances műszerek és számítási engedélyezte egyidejű elemzése nagyszámú metabolitok. HPLC párosulva MS bebizonyosodott, hogy hatékony kombinációja a metabolitok azonosítások és mennyiségi köszönhetően kiváló felbontás és érzékenység. A cél a jelenlegi tanulmány volt, hogy a rendszeres céljából boncolgatni a mechanizmus a CA, mint a hatékony kezelés a gyomorfekély. A különleges és egyedi biokémiai utak a gyógyszer hatásosságának lehet azonosítani, ha párosul többváltozós adatelemzési technikákat. A tanulmány célja az, hogy azonosítsa több metabolitok, amelyek megkönnyítik a megértést a hatásmechanizmusa CA és a támogatás beépíteni jövőbeli fejlesztésének TCM terápia. Katalógusa

Anyagok és módszerek katalógusa

2.1 Etikai nyilatkozat

Minden kísérletet összhangban jóváhagyott állat protokollok és irányelvek által létrehozott Medicine etikai felülvizsgálati bizottság az állatkísérletek Liaoning Egyetem hagyományos kínai orvoslás. katalógusa

2.2 állati Kezelés és minta-előkészítés

hét hetes hím SD patkányokat 200-250 g súlyú, biztosította a kísérleti állat központ Dalian Orvostudományi Egyetem. A gondozás és kezelése patkányok megfelelően a standard specifikus kórokozóktól mentes. Gyomorfekély indukáltunk a patkányok módszer szerint egy korábbi jelentés egy kis módosítással, [16] [17]. Után három nappal a termelés a gyomorfekély, a patkányokat véletlenszerűen öt csoportba: kontroll, modell, CA magas dózissal kezelt csoport (32,4 mg /ml), CA középső dózisú csoportban (10,8 mg /ml) és a CA alacsony dózisú csoportban (3,6 mg /ml). Minden a patkányok, csoportban orálisan adjuk az aktív csoport oldatot 1,5 ml, naponta egyszer (modell és kontroll csoportok sóoldatban) 7 napon át. A patkányokat tilos bármilyen étel 12 óra a kísérlet megkezdése előtt, de hagyjuk a vízhez való hozzáférés, szabadon. Katalógusa

Az utolsó napon a patkányokat mélyen altatott, majd feláldozni. A vért összegyűjtjük, plazma és szérum elkülönítettük centrifugálással 3000 rpm-en 15 percen át 4 ° C hőmérsékleten. A plazma-mintákat gyűjtöttünk, és -80 ° C-on gyorsan lefagyasztottuk folyékony nitrogénben, amíg metabolomikára analízist végeztünk. Ezután a gyomrokat vágja a nagyobb görbület mentén, sóoldattal mossuk. A terület a fekély mértük iránytű mérésére fekély index. A terület a fekély megegyezik a szélessége a fekély-szerese a hossza a fekély. A szövettani értékelés, gyomor szöveti mintákat fixáltuk semleges pufferelt formaiinban 24 órán át. Gyomor metszeteket dehidratált osztályozott etanol, átengedjük xilol, és paraffinba ágyaztuk. Paraffin metszeteket (5 mm vastagság) megfestettük hematoxilin /eozin (HE). A többi gyomor fekélyes szöveteket gyorsan eltávolítottuk, és folyékony nitrogénben lefagyasztottuk, míg a kitermelés a teljes szöveti RNS-t.

2.3 metabolittartalom

2.3.1 kromatográfia.

Kromatográfia végeztük Agilent 1100 sorozatú HPLC-rendszerrel ellátott kvaterner pumpa, az online gáztaianítóba, automata mintavevő, és termosztált oszlop rekeszt. Az injekció térfogata rögzítették 4 pl. Valamennyi mintát tartottuk 4 ° C-on az elemzés során. Az elválasztást végeztünk egy 4,6 * 100 mm, Zorbax SB-C18 oszlopra (Agilent, USA). Az oszlop hőmérsékletét állítottuk be 45 ° C-on. A mobil fázisok tagjai 0,1% hangyasav vízben (B oldószer) és 0,1% hangyasav acetonitrilben (A oldószer), az áramlási sebesség volt beállítva 1 ml /perc osztott aránya 01:03, a színátmenet használták a következők: lineáris gradiens 70- 33% B inicializálása 5,0 perc, 33 -98% B 5,0-12,0 min. Az eluens vezették be a tömegspektrométer közvetlenül. Miután minden 10. minta injektálás, egyesített minta a QC minta, majd egy üres volt beadni annak érdekében, hogy biztosítsák a stabilitást és az ismételhetőség LC-MS rendszerek. Katalógusa

2.3.2 tömegspektrometria. Katalógusa

tömegspektrometria, Agilent 6220 TOF-MS-elektrospray ionizációs forrással (ESI) negatív módban alkalmaztuk. Az áramlási sebesség a haldokló gáz (N2) volt beállítva 9 l /min. A porlasztót rögzített 45 psi. A többi optimális feltételek a következők voltak: haldokló gáz hőmérséklete 350 ° C, töredék feszültsége 120 V. A gyűjtött adatok a teljes letapogatású módot m /z 50-1050 amu felett 0-12 min. Az MS adatfelvétel súlypontja módban. Katalógusa

2.3.3 Többváltozós adatelemzés. Katalógusa

Az adatok elemzése eljárás ábrán látható. 1. A molekuláris Feature Extractor (MFE) algoritmus a Mass Hunter Minőségi elemzés szoftvert használják ki a molekuláris jellemzői nem azonosított, célzott vegyületek - az egyes adatokat. Az MFE algoritmus megkeresi a tömeges jelzések (ionok), melyek kovariáns időben, úgy véli, lehetséges kémiai kapcsolatok (izotópok, adduktumok, dimerek, több díjat állapotok), és létrehoz egy kivont vegyület kromatogram és összetett tömegspektrum minden molekuláris jellemző. A kivont vegyület lista minden fájlt exportálni vegyület Exchange formátum (. CEF) fájl további Mass Profiler Professional (verzió B.2.00, Agilent) statisztikai elemzés. A kapott funkció fájlok mindegyik mintát ANOVA, PCA analízis felhasználásával MPP szoftver, amely rendezi, normalizált, láthatóvá és szűrjük molekuláris jellemzői (MFS), további feldolgozásra [18], [19], [20], [ ,,,0],21]. Ezt követően, a hierarchikus klaszterezés (feltétel fa) alkalmazták a fájlokat. Hierarchikus klaszterelemzés egy statisztikai módszer a csoportos minták felügyelet nélkül a különböző csoportosulások vagy ágai hierarchikus fa. Ily módon, a kapcsolatok a különböző csoportok között látható. A feltétel fa volt látható, mint egy hőtérkép. Az identitás biomarkerek jelentős változások a csoportok által meghatározott ID Browser jellemzői MPP. Katalógusa

2.3.4 biomarkerek azonosítása. Katalógusa

Potenciális biomarkerek határoztuk meg Q-TOF (Xevo G2). Az MS ütközési energia 35ev, és az adatokat kaptuk a negatív ion módban, az X (V4. MassLn1) programot használtuk az adatok elemzéséhez. Hogy melyek azok a konkrét metabolitok is megerősítette elemek információk összehasonlítása a tömegük spektrumokat elemi összetétel adatok a szoftver által nyújtott. Katalógusa

2.3.5 Hálózat és útvonal elemzés. Katalógusa

MPP szoftvert alkalmazott valamennyi jelentős (mappa váltás > 2) legfeljebb szabályozott és szabályozva a metabolitok és a kapcsolódó biológiai útvonalak. A potenciális markert azonosítottak összehasonlították a pontos tömeg töltés aránya egyes adatbázisok, köztük szakma, Kegg, METLIN lipid MAPS és pubchem, hogy felfedezzék kapcsolódó utakat. T-teszt és szétnyitható alter meghatározására használták a statisztikai jelentőségét az utakat. P érték < 0,05 és mappa váltás > 2 ítélték kritériumok statisztikailag jelentős, és lehet választani. Katalógusa

2.6 molekuláris adatok katalógusa

A teljes RNS-t vontunk ki gyomor szövetek, köztük a kontroll, a modell és a CA csoportok alkalmazásával TRIZOL reagenssel (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA) a gyártó cég utasításait. cDNS-t szintetizáltunk a teljes RNS-t (1 ug) használva TransScript First-Strand cDNA Synthesis SuperMix készlet (Peking TransGen Biotech, Kína). Kvantitatív valós idejű PCR (CFX96, Bio-Rad, USA) alkalmazásával hajtottuk végre egy TransStart ™ Top Green qPCR SuperMix készlet (Peking TransGen Biotech, Kína). Használt primerek segítségével erősíti S1Pr1, S1Pr3, SphK1, Got2 és Fabp1 voltak (Invitrogen S1Pr1: GenBank acc. Sz. NM_017301, S1Pr3: GenBank acc. Sz. XM_225216, SphK1: GenBank acc. Sz. NM_133386, Got2: GenBank acc. Nem . NM_013177.2, Fabp1: GenBank ACC. no. NM_012556.2), és expressziója ezeknek a transzkriptumok mennyiségileg ellen a háztartási gén β-aktin, amely amplifikáltuk a primerek 5'-TGGCACCACACTTTCTACAATGA-3 'és 5'-AGGGACAACACAGCCTGGAT- 3 '. Expressziós szintjét a célgének analizáltuk a CFX Manager rendszert (Bio-Rad, USA).

2.7 Statisztikai elemzés

Az adatokat átlag ± SEM. SPSS 19.0 for Windows használtuk a statisztikai elemzést. Az adatokat elemeztük ANOVA, p < 0,05 beállítva a statisztikai szignifikancia szintjét. Katalógusa

Eredmény katalógusa

3.1 hatása CA az ecetsav injektált indukált gyomorfekély modell katalógusa

a kísérleti modell ecetsav injektált indukált gyomornyálkahártya sérülés patkányban gyakran alkalmaznak szűrésére a vegyületek fekélyellenes aktivitását, hogy szolgálja, mint a vezető oka a gyomorfekély emberben [22]. Ecetsav injektált kiváltott intenzív gyomor nyálkahártya-károsodás kialakulását fekély a modellben csoportban (2A.) Patkányok, amelyek szignifikánsan különbség összehasonlítva a kontroll csoport (ábra. 2b). Kóros megfigyelés arra használták, hogy confirme a kár ecetsavval indukált felszíni rétegeiben a gyomornyálkahártya ulteriorly. Ecetsavval indukált gyomorfekély (ábra. 2C) van egy eróziós hatás a nyálkahártyához, ami együtt járt izom törés és a gyulladásos sejtes beszűrődés a rétegek, mint a kontroll (ábra. 2D). Az eredmények igazolták, hogy a modell a gyomorfekély sikeresen reprodukálni. Az eredmények a időbeli lefutását mutatta, ábrán. 2E szemléltetik, hogy a terület a fekély kezelt patkányokban CA maradt lényegesen kisebb, ha összehasonlítjuk a megfelelő értékek a modellben patkányok hetedik napon, ezért választottuk a hetedik nap vizsgálati minták. Hatásainak kiértékelésére a Ca, amint azt ábrán. 2F, a terület a gyomorfekély CA dózis csoportok szignifikánsan csökkent a modell-csoportban (p < 0,01). A kísérleti eredmények azt sugallják, hogy a CA hatékonyan gyógyítja a gyomorfekélyt, különösen a közepes dózisú csoportban. Úgy tűnik, hogy van egy jelentős átfedés között a neuronális patogenetikai útvonalakat vesz részt fekély Genesis és a depresszió. Ezért nem meglepő, hogy a gyógyszert a kezelés depressziós epizódok is kifejteni potens elleni védőhatást gyomorfekély [23]. Az ok, amiért CA középső dózisú csoportban van egy jobb terápiás hatást, mint a magas dózisú csoport lehet CA magas dózissal kezelt csoport van szerepe, hogy gátolják a ideg. A hatás a CA megvizsgálták, hogy tovább vizsgálják a mechanizmus. Katalógusa

3.2 metabolomikus Study katalógusa

3.2.1 megszerzése és feldolgozása metabolikus profil adatok. Katalógusa

A képviselő teljes ioncserélő kromatográfiás csúcsok ( TIC) plazma származó minták ellenőrzése, a modell és a CA dózis csoportok negatív módban ábrán mutatjuk be. 3 segítségével a optimális LC-MS fent leírt körülmények között. Kis molekulatömegű metabolitok lehet elválasztani jól a rövid idő alatt a 15 perc. Annak érdekében, hogy jobban megértsék a finom különbségek és hasonlóságok közül összetett adathalmazok több alakfelismerés módszereket alkalmaznak a fenotípus a plazma metaboiomának patkányok. Itt, a hierarchikus klaszterezés elemzés és PCA használták, hogy osztályozza a metabolikus fenotípus és azonosítsa a differenting metabolitok. Hierarchikus klaszterezés elemzése metabolomikára adatok azt mutatták, különálló szegregáció a vezérlő, modell-csoport és a CA dózisú csoportban (ábra. 4). A PCA pontszámokat, minden pont képviseli egy egyedi minta. A PCA eredmények jelennek pontszám parcellák jelezve a szórás a minták, amelyek azt mutatják, hasonló metabolomikára-készítmények, amikor egy csoportban és összetételben különböző metabolomes kialakul. A PCA pontszámok cselekmény lehetett osztani a különböző plazma mintákat különböző blokkokat, illetve arra utal, hogy a metabolikus profilok változtak. Az információs elemzője a PCA a kísérlet kimutatta látható. 5, a kontroll és a modell csoportok szignifikánsan két osztályba sorolhatók, jelezve, hogy a modell a ecetsavval indukált gyomorfekély sikeresen reprodukálni. Finomabb változások megtalálhatók az alakfelismerés megközelítést-pontszám parcellák PCA. PCA eredmények megjelenítéséhez, hogy a modell csoport volt messze a fennmaradó négy csoportban, jelezve, hogy a megváltozott anyagcsere minta származott ecetsavval indukált lehet jelentősen eltér a többi. A helyzet a kezelési csoport közel volt a kontroll csoport, ami arra utal, hogy a megváltozott anyagcsere mintázat okozta CA. Az eredmények nyilvánvaló, hogy a CA megváltoztathatja a kóros anyagcsere állapotát, és lehet, hogy az eltérő bánásmód mechanizmusa ecetsavval indukált gyomorfekély. Katalógusa

3.2.2 azonosítása potenciális biomarkerek. Katalógusa

A kis molekulájú metabolitok jelentős különbség (T-teszt, p < 0,05) házkutatást tartottak a szoftver az MPP. A potenciális markert azonosítottunk a "ID böngésző" keresni az Metlin adatbázis (http://metlin.scripps.edu/) és összehasonlítva a pontos tömeg töltés aránya egyes adatbázisok, köztük szakma (http: //www. hmdb.org/), Kegg (http://www.genome.jp/kegg/), lipid MAPS (http://dev.lipidmaps.org:25424/), és pubchem (http: //pubchem.ncbi. nlm.nih.gov/). Megtudhatjuk valószínű nevét potenciális biomarkerek az első lépés. A jelen tanulmányban 10 potenciális biomarkerek azonosítottunk (1. táblázat). A pontos molekulatömege vegyületek jelentős változások a csoportok belül meghatározott mérési hibák (< 5 ppm) a Waters Xevo G2 QTOF, és eközben a lehetséges elemi összetétel, telítetlenség mértéke és frakcionált izotóp bősége szerinti vegyületeket. A feltételezett molekuláris képlet kerestek, Chemspider (http://www.chemspider.com/), szakma és más adatbázisok azonosítani az esetleges kémiai alkotmányok és MS /MS adatokat átvizsgáljuk, hogy meghatározzák a potenciális struktúrák az ionok. Szfingozin-1-foszfát (S1P) és sztearinsav vették példa, hogy bemutassa fragmenseit a szerkezet és az értékelési folyamatot. Az elsődleges és másodlagos tömegspektrometriás információt elemeztük Masslynx (látás 4,1, vizek) szoftver, míg az adatbázis, és ion töredékei 379,2488 (C _{18H 38NO 5P) arra ábrán látható. 6. A. A fő fragmentionokat elemezzük MS /MS vizsgálathoz m /z 224,080, 165,1254 és 82,0238, ami megfelel elvesztett C 7H 15NO 5P, C 11H 17O, C 4H 4NO volt. Végül azt is feltételezi, mint S1P után hivatkozva és az egyén polaritás méretét. Eközben ion töredékei sztearinsav 284.2715 (C 18H 36O 2) (6. B) volt 212,2419 (C 15H 32), 143,1359 (C 9H 19o), 117,0962 (C 6H 13O 2) és 83,0962 (C 6H 11). katalógusa}

A biomarkerek fent leírt bizonyult szoros kapcsolat kialakulását és a kezelés a gyomorfekély. A jelentősen felfelé szabályozott a D-glükóz, lizin, húgysav, piroszőlősav, kortikoszteron, a szfingozin-1-foszfát és a lefelé szabályozott triptofán, glikokolát, hexadecanedioic sav, a sztearinsav volt megfigyelhető a modell csoport a kontrollcsoporttal összehasonlítva (ábra. 7 ). Ez a különbség a metabolitok jelölhet bennük rejlő lehetőségeket mint célzott biomarkerek differenciáló gyomorfekély és a normál állapotot. Változások követése ezen metabolitok előre jelezheti a fejlődését gyomorfekély. A biomarkerek 1, 2, 3, 4, 7, 8 csökkent a kezelés után a Ca, ellentétben, a másik biomarkerek növekedett. Továbbá, annak érdekében, hogy jellemezni fekélyellenes hatását CA világosabban, változások a relatív koncentrációját megcélzott metabolitok azonosított különböző csoportok elemeztük, azt találtuk, hogy tartalma ezeket a kulcsfontosságú markerek közelebb a normál csoporthoz. Az eredmények azt jelzik a mechanizmus kezelésére gyomorfekély lehet elérni a szabályozás ezen jelentősen markerek és a kölcsönhatás, mint a Fig. 8. Például, a sztearinsav, amely nevezett 17FA, van kapcsolata thapsic sav bár a fehérje Fabp1 (zsírsav-kötő fehérje 1). A hálózat nem csak azt jelzi, a kölcsönhatás biomarkerek, de tájékoztat a potenciális protein, gének, enzimek és biológiai folyamatok. Hozzájárul a felfedezés cél során fellépett és kezelésére gyomorfekély és vezetőképes, hogy az új gyógyszer gyógyítani gyomorfekély. Katalógusa

3.3 meghatározása mRNS-szinteket, hogy erősítse meg a biomarkerek katalógusa

megerősítik a metabolomikára megállapításaival, mi kell egy kis molekuláris adatok, így azonosított 5 mRNS amelyek kapcsolódnak a 4 potenciális biomarkerek és 2 metabolikus utak RT-PCR-rel. Sphingolipid anyagcserét, beleértve S1Pr1, S1Pr3 és SphK1 vizsgálták, azt mutatta látható. 8. Az eredmények összefoglalása látható. 9. Az mRNS szintje S1Pr1, SIPr3 és SphK1 szignifikánsan felülszabályozott a modellben csoport, az expressziós szintek 5,21, 2,54, 6,57-szor, mint a kontroll csoport, amely összhangban volt a mi korábbi eredmények és az adatok. Miután a CA kezelés, az expressziós szintek S1Pr1, S1Pr3 és SphK1 voltak vissza a bazális szintre. S1P van kialakítva két kináz, a szfingozin kináz 1 és 2 (SphK1 és SphK2), de nem volt különbség megfigyelhető SphK2 expresszió között az összes csoport (az adatokat nem mutatjuk be), az eredmény volt összhangban van a hálózat megállapításokat. Itt meg tudjuk magyarázni a lehetséges mechanizmusa CA kezelésére gyomorfekély blokkolásával S1P növekszik. Azt is megállapították, egy csökkent expressziója Fabp1 és Got2 a modell csoportban (9.), Mint a kontroll csoportban. De CA csinál csoportok közel voltak a kontroll csoport, amely megerősítette, hogy a terápiás hatását CA kapcsolódott zsírsav anyagcsere molekuláris szinten. Katalógusa

3.4 Pathway Analysis katalógusa

További részletes elemzést utak és hálózatok által befolyásolt gyomorfekély végeztük MPP. Az utak kapott mutatja a 2. táblázat Az általunk használt kiváló minőségű Kegg metabolikus utak, mint a háttér tudásbázis azonosítani a legfontosabb utak, mint például sphingolipid anyagcserét, tricarboxylicacidcycle-ciklusban, biotin az anyagcserét, és így tovább, ahol 7 különleges utak ( táblázatban felsorolt ​​1) a modell csoportot azonosítottunk. Potenciális biomarkerek kapcsolatos folsav anyagcserét, zsírsav anyagcsere, és szfingolipid anyagcsere utakat is megfelelt. A 6 különböző metabolitok azonosítottak ezen utak, sok különböző szakaszaiban a haladás a gyomorfekély. Néhány jelentősen megváltozott metabolitok, mint a glikokolát, hexadecanedioic-sav, és a sztearinsav találtak és használt megmagyarázni a zsírsav mechanizmus. Ezek az eredmények arra utalnak, hogy ezek a jelátviteli útvonalak mutatják a jelzett zavarok fölött kialakulását gyomorfekély és hozzájárulhat a fejlesztési gyomorfekély. Katalógusa

Vita katalógusa

gyomorfekélyt embereknél gyakran ismétlődnek, és a nehéz kezelésében őket jelzi a példabeszéd "egyszer fekély, mindig egy fekély" [24]. Számos tényező növelheti előfordulásának gyomorfekély, de a mechanizmus még nem pontosan tudták. Ezért a hatékonysága a gyógyszeres kezelés nem csak attól függ a csökkenése káros tényezők, hanem a megváltozott metabolitok, amelyek szabályozzák az anyagcserét útvonalon. Különösen a felfedezés biomarker kockázatának előrejelzésére gyomorfekély lehetőséget nyújt majd diagnosztizálni, és lehetővé teszi a gyógyszeres kezelés időben. QZWT használtunk gyógyítani gyomorfekély sok éven Ázsiában bár annak mechanizmusa még nem tisztázott. Metabolomikájával párosulva többváltozós statisztikai eszközök, amelyek egyszerre számszerűsíteni ezer metabolitok élő mikroorganizmus elemzésére használt biomarkerek gyomorfekély [25]. Továbbá, a megértés a biomarkerek váltott új érdeklődés a következő területeken gyógyszerkutatási programokban és a betegség nyomon követése, amely értékes in-épületek mintegy komplex betegség mechanizmusa [26]. Ez a tanulmány célja tehát, hogy jobban megismerje a mögöttes mechanizmusának CA gyomorfekély szabályozás a metabolikus utak átfogó képet. Katalógusa

A modell gyomorfekély patkányokban sikeresen szaporodtak. A plazma mintákat HPLC-vel elemezzük /ESI-TOF-MS és többváltozós statisztikai elemzést. Az eredmények azt mutatták, hogy a terület a fekély és dinamikus metabolikus profilok után CA kezelés zártak, hogy a kontroll csoport, amely bizonyítja, hogy a CA volt terápiás hatékonyságát. Szerint metabolomikára elemzés 10 potenciális biomarkerek és 7. kapcsolódó metabolikus utat azonosítottak a vizsgálatba. A jelentősen lefelé szabályozott D-glükóz, lizin, húgysav, piroszőlősav, kortikoszteron, a szfingozin-1-foszfát és a felfelé szabályozott a triptofán, a glikokolát, hexadecanedioic sav, a sztearinsav volt megfigyelhető a CA-csoportban, mint a modell-csoport. Ezen túlmenően, a folsav metabolizmus, zsírsav-anyagcserét, és szfingolipid anyagcsere és sok más anyagcsere is megerősítette, hogy hatással van a gyomorfekély. Van expressziójának meghatározásához mRNS kapcsolatos sphingolipid anyagcsere és zsírsav anyagcsere, hogy érvényesítse a mechanizmus. Sok más potenciális proteinek, gének, enzimek és bioprocess zárva más utakat kell, későbbi kísérletek során érvényesíteni. Katalógusa

elemzésével és ellenőrzése alapján korai biomarkerek egy betegség, metabolomika lehetővé teszi számunkra, hogy jobban megértsük a kóros folyamatok és anyag metabolikus utak . Meggyőződésünk, hogy a biomarker és útvonal elemzések nagy potenciállal, hogy vizsgálja meg és tisztázzák a terápiás hatása TCM. A jelenlegi tanulmány, az általunk jellemezve biomarker interakciós hálózatok bevonása proteinek, gének, enzimek és bioprocess ábrán látható. 8. S1P törvény extracellulárisan, mint a ligandum specifikus receptorokon-S1PRs, Mostanában elismert, mint szabályozó számos élettani és kórélettani folyamatok, beleértve a gyulladásos rendellenességek, mint például a reumás ízületi gyulladás, gyulladásos bélbetegség, és szepszis [27], [28]. Gyulladás fordul elő, hogy a nyálkahártya a gyomor-bél traktus, ezáltal okoz gyomor-bél fekély [29]. Eredményeink azt mutatják, hogy a CA csökkentheti a kifejezés S1P és receptorai, ideértve S1Pr1 és S1Pr3, gyulladás csökkentésére problémák enyhítésére a gyomorfekély kialakulását [30]. S1P van kialakítva SphK1 és SphK2 [31]. SphK1 lehet aktív az NF-kB útvonal, amely által kezdeményezett főbb gyulladásos jelátviteli molekula TNF-α. Röviden, az NF-kB és TNF-α szorosan kapcsolódik alkotnak és gyógyítani gyomorfekély [32], [33]. Azt is megállapították, hogy a hiányosság a SphK1 (nem SphK2) jelentősen gátolja a gyomorfekély, jelezve, hogy SphK1 játszhat döntő szerepet gyomorfekély. Így a sphingolipid anyagcsere lehet életképes cél kezelésére gyomorfekély. Katalógusa

A sztearinsav, glikokolát és hexadecanedioic sav változott okozhat zsírsav anyagcsere rendellenesség záró előfordulásának és rehabilitációja gyomorfekély [34], [35] . Zsírsavakat, beleértve a sztearinsav stb, általában tekinteni, mint az energiaforrás, már felkeltette a kutatás és a közegészségügy miatt hatással van az emberi egészségre és betegségekre. A zsírsavak előnyös egészségjavító. Sztearinsav, glikokolát és hexadecanedioic szabályozza Fabp1, az enzim a zsírsav-kötő fehérje 1 analízise RT-PCR-rel, az alacsony expressziója Fabp1 a modell csoport azt sugallja, hogy Fabp1 aktivitás gátlása csökkentheti a sztearinsav, a glikokolát és hexadecanedioic sav , és vezet a zsírsav-metabolizmus rendellenesség. Ezért fokozott a gyulladásos válasz és a mitokondriális diszfunkció és elősegíti fekély kialakulása. Azonban CA egyensúlyt ebben a betegségben növelése révén kifejezése Fabp1 [36]. Glutaminsav-oxálecetsav 2 (Got2) fontos enzim a tricarboxylicacidcycle-ciklusban (TCA ciklus). A súlyosan gátlása TCA által okozott csökkent az Got2 hozzájárul a kialakulását gyomorfekély. A metabolitok az aminosavak, mint például a triptofán és metabolitjai in vivo egy kiterjedt szerepe a triptofán anyagcsere. A legfontosabb az, hogy a triptofán anyagcsere betegségek okozhatnak TCA zavar. TCA szerepet játszanak a gyógyító gyomorfekély [37]. Down-regulációja Got2 mRNS expressziójának modell csoport és up-szabályozás CA csoportok korábban demonstrálták a mi eredményt. Mindezek az adatok világosan mutatják, hogy a molekuláris mechanizmusa CA kezelésére gyomorfekély szoros korrelációt mutatott a mérleg hatással TCA. Ezek az eredmények belekeverni a CA hatások is közvetített fehérje, enzimek, és az anyagcserét útvonalon.

• PLoS One: a csökkent expressziója Proangiogenic növekedési faktorok és azok receptorai a gyomorfekély a cirrhosisos betegek
• PLoS One In vivo antioxidáns és Fekély tevékenysége Parkia speciosa etanolos kivonat ellen Etanol-által kiváltott gyomorfekély Rats