Raziskovalci objavljajo mikrobni profil v podporo naraščajočemu področju raziskav črevesja

Obstaja 157 organizmov, ki tvorijo osnovni biom zdravega črevesja, glede na raziskavo, objavljeno v reviji PLOS ONE raziskovalci na Univerzi George Washington (GW). Osnovni mikrobni profil, imenovano GutFeelingKB, se lahko razširi na 863 organizmov, če upoštevamo tesno povezane proteome. Ti podatki bodo za zdravnike služili kot referenčni seznam, bolniki, in raziskovalci, dajejo jim predstavo o tem, kako izgleda "normalen" človeški mikrobiom.

Bolj ko spoznamo človeški mikrobiom, bolj se zavedamo njegovega pomena za naše zdravje. Poznavanje, kako izgleda zdravo črevesno črevo, je ključnega pomena za raziskave, ki bodo pokazale, kako postaviti diagnozo, zdraviti, in preprečiti težave z mikrobiomom. "

Raja Mazumder, Doktor znanosti, soavtor in profesor biokemije in molekularne medicine na GW School of Medicine and Health Sciences

To celovito poznavanje vrst in razmerja mikrobov, ki živijo v črevesju zdravega človeka, je potrebno, preden se lahko izvede kakršna koli predklinična ali klinična študija. Pomembno je tudi za raziskovalce, ki iščejo načine za spreminjanje mikrobioma, zdraviti stanje, ali izboljšati izid terapije. GutFeelingKB lahko služi kot zdrav nadzor za študije o človeškem mikrobiomu.

Če želite sestaviti svojo bazo podatkov, raziskovalna skupina je genetsko sekvencirala 48 vzorcev iztrebkov pri 16 zdravih udeležencih, ki so bili zaposleni v Washingtonu, DC, poleg uporabe 50 fekalnih metagenomskih vzorcev, prenesenih iz projekta Human Microbiome Project pri posameznikih, so bili pregledani tudi kot zdravi. Od 157 organizmov, opisanih v GutFeelingKB, 20% je bilo klostridij, 19% je bilo bakterioidij, 17% je bilo bifidobakterij, 14% je bilo Enterobacterales in 20% iz vrste Firmicutes Clostridia in 14% Lactobacillales - vse vrste bakterij, ki jih najdemo v probiotičnih živilih, kot je jogurt. Raziskovalna skupina je ugotovila, da je 84 organizmov skupnih vsem vzorcem, kar kaže, da je ta skupina bakterij lahko ključna vrsta človeškega črevesja.

Raziskavo so podprli donacije Nacionalne znanstvene fundacije, program kliničnih in prevajalskih znanstvenih nagrad pri Nacionalnem centru za napredne prevajalske znanosti, McCormickovo genomsko in proteomsko središče, in Clinical Translational Science Institute (CTSI) pri GW in Children's National v Washingtonu, DC Surovi podatki o zaporedju so bili ustvarjeni v KamTeku, Inc. s subvencioniranimi cenami z uporabo instrumentov MiSeq Illumina na Montgomery College v Rockvilleu, Maryland.

"Ta študija dokazuje moč multidisciplinarne timske znanosti za pospeševanje translacijskih raziskav, saj ta ekipa vključuje sodelavce iz različnih institucij, discipline in šole v okviru GW, "je rekel Keith A. Crandall, Doktor znanosti, informatika sovodja pri nepovratnih sredstvih CTSI, soavtor, in direktor Inštituta za računalniško biologijo na Fakulteti za javno zdravje Milken Institute pri GW. "GutFeelingKB ponuja temeljni model in začetne podatke za razumevanje raznolikosti zdravega črevesnega mikrobioma, ki je ključni sestavni del vsake študije, ki poskuša odkriti bolezen, povezano s spremembami mikrobiomov. "

Poleg ustvarjanja GutFeelingKB, raziskovalna skupina je objavila novo poročilo o populaciji fekalnega bioma, znan kot FecalBiome, ki ima klinično sposobnost. FecalBiome lahko zdravnikom pomaga primerjati pacientov mikrobiom z mikrobiomi zdravih posameznikov, ki jim omogočajo boljšo oceno učinkovitosti presaditev blata in drugih mikrobioma. Raziskovalna skupina je razvila tudi prototipno poročilo za zdravnike, ki podatke posreduje bolnikom.

"Odkrivanje zapletenih presnovnih izmenjav med črevesnimi mikrobnimi vrstami in njihovimi človeškimi gostitelji ima ogromne posledice za najrazličnejše zdravstvene razmere, mogoče celo naše razpoloženje. Ali je mogoče mikrobiom "prilagoditi", da poveča koristne bakterijske populacije? Kako naša prehrana vpliva na to uglaševanje? Navdušeni smo, da nam bo ta zbirka znanja omogočila količinsko opredelitev teh premikov in njihovo povezovanje z zdravjem ljudi, "je rekel Hiroki Morizono, Doktor znanosti, informatika sovodja pri nepovratnih sredstvih CTSI, soavtor, direktorica biomedicinske informatike pri otroškem nacionalnem in izredna raziskovalna profesorica za genomiko in natančno medicino ter pediatrijo na medicinski in zdravstveni fakulteti GW.

• Bolniki z rakom, ki zamudijo sestanek, pogosteje umrejo v 12 mesecih po diagnozi
• Enostaven genetski test lahko poveča stopnjo odziva pri otrocih z eozinofilnim ezofagitisom