A kutatók mikrobiális profilt tesznek közzé a bélkutatás növekvő területén

Minél többet tanulunk az emberi mikrobiomról, annál többet tanulunk meg egészségünk fontosságáról. Annak ismerete, hogy hogyan néz ki az egészséges emberi bél, kritikus fontosságú a kutatásban, amely tájékoztatni fogja a diagnózis felállításáról, csemege, és megakadályozzák a mikrobiomával kapcsolatos problémákat. "

Raja Mazumder, PhD, a GW Orvostudományi és Egészségtudományi Iskola biokémiai és molekuláris orvoslás társszerzője és professzora

Ez az átfogó ismeret az egészséges emberi bélben élő mikrobák típusairól és arányairól szükséges, mielőtt bármilyen preklinikai vagy klinikai vizsgálat elvégezhető lenne. Fontos a kutatóknak is, akik módszereket keresnek a mikrobiom megváltoztatására, kezelni egy állapotot, vagy javítja a terápia eredményét. A GutFeelingKB egészséges kontrollként szolgálhat az emberi mikrobiomát vizsgáló vizsgálatokhoz.

Adatbázisuk összeállításához, a kutatócsoport genetikailag szekvenált 48 ürülékmintát 16 egészséges résztvevőből, akiket Washingtonban toboroztak, D.C., amellett, hogy 50, a Human Microbiome Project -ből letöltött széklet metagenomikus mintát használt, egészségesektől is megvizsgált személyektől. A GutFeelingKB -ben leírt 157 élőlény közül 20% -a Clostridia volt, 19% -a bakterioidia volt, 17% -a bifidobaktérium volt, 14% -a Enterobacterales, a Firmicutes törzsből 20% Clostridia és 14% Lactobacillales volt - a baktériumok minden osztálya megtalálható a probiotikus élelmiszerekben, például a joghurtban. A kutatócsoport megállapította, hogy 84 organizmus volt közös minden mintában, jelezve, hogy ez a baktériumcsoport az emberi bél alapvető faja lehet.

A kutatást a Nemzeti Tudományos Alapítvány támogatása támogatta, a Klinikai és Transzlációs Tudományos Díjak Program a Fordítási Tudományok Fejlesztésének Nemzeti Központjában, a McCormick Genomikai és Proteomikai Központ, és a Klinikai Transzlációs Tudományos Intézet (CTSI) a GW and Children's National -ben Washingtonban, A D.C. nyers szekvenciaadatait a KamTek szolgáltatta, Inc. támogatott árazással, MiSeq Illumina műszerekkel a Montville -i Rockville -i Rockville -ben, Maryland.

"Ez a tanulmány bemutatja a multidiszciplináris csapattudomány erejét a transzlációs kutatás előmozdításában, mivel ez a csapat több intézményből származó kollégákat von be, tudományágak és iskolák a GW -n belül, - mondta Keith A. Crandall, PhD, az informatika társvezetője a CTSI támogatásban, társszerző, és a GW Milken Intézet Közegészségügyi Iskola Számítástechnikai Biológiai Intézetének igazgatója. "A GutFeelingKB alapmodellt és kiinduló adatokat biztosít az egészséges bél mikrobióma sokféleségének megértéséhez, amely kulcsfontosságú eleme minden olyan tanulmánynak, amely a mikrobiom változásokkal járó betegségeket kívánja kimutatni. "

A GutFeelingKB létrehozása mellett a kutatócsoport egy új Fecal Biome Population Report jelent meg, FecalBiome néven ismert, amely klinikai képességekkel rendelkezik. A FecalBiome segíthet az orvosoknak összehasonlítani a páciens mikrobiomáját az egészséges egyének mikrobiómájával, lehetővé téve számukra, hogy jobban értékeljék a székletátültetések és más mikrobiomtermékek hatékonyságát. A kutatócsoport egy prototípus jelentéssablont is kifejlesztett az orvosok számára, hogy továbbítsák az információkat a betegeknek.

"A bél mikrobák és emberi gazdaszervezetek közötti összetett anyagcsere feltárása óriási következményekkel jár az egészségi állapot sokféleségére, esetleg még a hangulatunk is. Behangolható -e a mikrobiom a hasznos baktériumpopulációk növelésére? Hogyan befolyásolja étrendünk ezt a hangolást? Izgatottan várjuk, hogy ez a tudásbázis lehetővé teszi számunkra, hogy számszerűsítsük ezeket a változásokat, és összefüggésbe hozzuk az emberi egészséggel, - mondta Hiroki Morizono, PhD, az informatika társvezetője a CTSI támogatásban, társszerző, a Gyermekek Országos Orvostudományi Informatikai Igazgatója, valamint a GW Orvostudományi és Egészségtudományi Iskola genomika, precíziós orvoslás és gyermekgyógyászat docense.

• Azok a rákos betegek, akik elmulasztanak találkozót, nagyobb valószínűséggel halnak meg a diagnózist követő 12 hónapon belül
• Az egyszerű genetikai teszt növelheti a válaszadási arányt eozinofil oesophagitisben szenvedő gyermekeknél