Mokslininkai paskelbia mikrobų profilį, kad paremtų augančią žarnyno tyrimų sritį

Kuo daugiau sužinome apie žmogaus mikrobiomą, kuo daugiau sužinome apie jo svarbą mūsų sveikatai. Norint žinoti, kaip atrodo sveikas žmogaus žarnynas, labai svarbu atlikti tyrimus, kurie padės išsiaiškinti, kaip diagnozuoti, gydyti, ir užkirsti kelią mikrobiomo problemoms “.

Raja Mazumder, Daktaras, GW medicinos ir sveikatos mokslų mokyklos bendraautorius ir biochemijos ir molekulinės medicinos profesorius

Šios išsamios žinios apie sveiko žmogaus žarnyne gyvenančių mikrobų tipus ir santykius yra būtinos prieš atliekant bet kokius ikiklinikinius ar klinikinius tyrimus. Taip pat svarbu tyrėjams, ieškantiems būdų, kaip pakeisti mikrobiomą, gydyti būklę, arba pagerinti gydymo rezultatus. „GutFeelingKB“ gali būti sveika kontrolė žmogaus mikrobiomos tyrimams.

Norėdami sudaryti jų duomenų bazę, tyrimo grupė genetiškai nustatė 48 išmatų mėginius iš 16 sveikų Vašingtone dalyvavusių dalyvių, D.C., be to, kad buvo naudojami 50 išmatų metagenominių mėginių, atsisiųstų iš žmogaus mikrobiomų projekto iš asmenų, kurie taip pat buvo patikrinti kaip sveiki. Iš 157 organizmų, aprašytų „GutFeelingKB“, 20% buvo klostridijos, 19% buvo bakterioidijos, 17% buvo bifidobakterijos, 14% buvo Enterobacterales, o iš Firmicutes prieglobsčio - 20% Clostridia ir 14% Lactobacillales - visų klasių bakterijos, randamos probiotiniuose maisto produktuose, pavyzdžiui, jogurte. Tyrimo grupė pažymėjo, kad 84 organizmai buvo bendri visiems mėginiams, tai rodo, kad ši bakterijų grupė gali būti pagrindinė žmogaus žarnyno rūšis.

Tyrimą rėmė Nacionalinio mokslo fondo dotacijos, klinikinio ir vertimo mokslo apdovanojimų programą Nacionaliniame vertimo mokslų tobulinimo centre, „McCormick“ genominis ir proteominis centras, ir Klinikinio vertimo mokslo institutą (CTSI) GW ir Vaikų Vašingtone, Neapdorotos sekos duomenys buvo sugeneruoti „KamTek“, Inc. su subsidijuojamomis kainomis, naudojant „MiSeq Illumina“ instrumentus Montgomery koledže Rokvilyje, Merilandas.

"Šis tyrimas parodo daugiadisciplininio komandos mokslo galią skatinti vertimo tyrimus, nes ši komanda apima kolegas iš kelių institucijų, GW disciplinos ir mokyklos, “, - sakė Keithas A. Crandallas. Daktaras, informatikai kartu vadovauja CTSI dotacijai, bendraautorius, ir Milken instituto visuomenės sveikatos mokyklos Kompiuterinės biologijos instituto direktorius GW. „„ GutFeelingKB “pateikia pagrindinį modelį ir pradinius duomenis, kad būtų galima suprasti sveiko žarnyno mikrobiomo įvairovę, kuris yra pagrindinis bet kurio tyrimo, bandančio aptikti ligas, susijusias su mikrobiomų pokyčiais, komponentas “.

Be „GutFeelingKB“ kūrimo, tyrimo grupė paskelbė naują išmatų biomų populiacijos ataskaitą, žinomas kaip „FecalBiome“, kuris turi klinikinių galimybių. „FecalBiome“ gali padėti gydytojams palyginti paciento mikrobiomą su sveikų asmenų mikrobiomomis, leidžia jiems geriau įvertinti išmatų transplantacijos ir kitų mikrobiomų produktų efektyvumą. Tyrimo komanda taip pat sukūrė prototipo pranešimo šabloną, kuriuo gydytojai galėtų perduoti informaciją pacientams.

„Sudėtingų medžiagų apykaitos tarp žarnyno mikrobų rūšių ir jų šeimininkų atskleidimas turi didžiulį poveikį įvairioms sveikatos sąlygoms, galbūt net mūsų nuotaikos. Ar galima „sureguliuoti“ mikrobiomą, kad padidėtų naudingų bakterijų populiacija? Kaip mūsų mityba veikia šį derinimą? Džiaugiamės, kad ši žinių bazė leis mums įvertinti šiuos pokyčius ir susieti juos su žmonių sveikata, “, - sakė Hiroki Morizono, Daktaras, informatikai kartu vadovauja CTSI dotacijai, bendraautorius, vaikų nacionalinės biomedicinos informatikos direktorius ir GW Medicinos ir sveikatos mokslų mokyklos genomikos ir tiksliosios medicinos bei pediatrijos docentas.

• Vėžiu sergantys pacientai, praleidę susitikimą, dažniau miršta per 12 mėnesių nuo diagnozės nustatymo
• Paprastas genetinis tyrimas gali padidinti atsako dažnį vaikams, sergantiems eozinofiliniu ezofagitu