Jo mer vi lærer om det menneskelige mikrobiomet, jo mer vi lærer om dens betydning for helsen vår. Å vite hvordan en sunn menneskelig tarm ser ut er avgjørende for forskning som vil informere om hvordan man diagnostiserer, behandle, og forhindre problemer med mikrobiomet. "
Raja Mazumder, PhD, medforfatter og professor i biokjemi og molekylær medisin ved GW School of Medicine and Health Sciences
Denne omfattende kunnskapen om typer og forhold mellom mikrober som lever i den friske menneskelige tarmen er nødvendig før noen form for preklinisk eller klinisk studie kan utføres. Det er også viktig for forskere som ønsker å finne måter å endre mikrobiomet på, behandle en tilstand, eller forbedre et terapiresultat. GutFeelingKB kan fungere som en sunn kontroll for studier som ser på det menneskelige mikrobiomet.
For å kompilere databasen deres, forskergruppen genetisk sekvenserte 48 avføringsprøver fra 16 friske deltakere som ble rekruttert i Washington, D.C., i tillegg til å bruke 50 fekale metagenomiske prøver lastet ned fra Human Microbiome Project fra individer også vist som friske. Av de 157 organismer som er beskrevet i GutFeelingKB, 20% var Clostridia, 19% var Bacterioidia, 17% var Bifidobacteriales, 14% var Enterobacterales og fra phylum Firmicutes var 20% Clostridia og 14% var Lactobacillales - alle bakterieklasser som finnes i probiotiske matvarer som yoghurt. Forskerteamet bemerket at 84 organismer var felles for alle prøvene, indikerer at denne gruppen av bakterier kan være kjernearter for den menneskelige tarmen.
Forskningen ble støttet av tilskudd fra National Science Foundation, Clinical and Translational Science Awards Program ved National Center for Advancing Translational Sciences, McCormick Genomic and Proteomic Center, og Clinical Translational Science Institute (CTSI) ved GW og Children's National i Washington, DC Raw -sekvensdata ble generert på KamTek, Inc. med subsidiert pris ved bruk av MiSeq Illumina -instrumenter ved Montgomery College i Rockville, Maryland.
"Denne studien viser kraften til tverrfaglig teamvitenskap til å fremme oversettelsesforskning, ettersom dette teamet involverer kolleger fra flere institusjoner, disipliner og skoler innen GW, "sa Keith A. Crandall, PhD, informatikk co-lead på CTSI-tilskuddet, medforfatter, og direktør for Computational Biology Institute ved Milken Institute School of Public Health ved GW. "GutFeelingKB gir en grunnleggende modell og innledende data for å begynne å forstå mangfoldet av det sunne tarmmikrobiomet, som er en sentral komponent i enhver studie som prøver å oppdage sykdom forbundet med mikrobiomendringer. "
I tillegg til å lage GutFeelingKB, forskergruppen publiserte en roman Fecal Biome Population Report, kjent som FecalBiome, som har klinisk evne. FecalBiome kan hjelpe leger å sammenligne en pasients mikrobiom med mikrobiomene til friske individer, slik at de bedre kan vurdere effektiviteten av fekale transplantasjoner og andre mikrobiomprodukter. Forskerteamet utviklet også en prototypemeldingsmal for leger for å formidle informasjonen til pasienter.
"Å avdekke de komplekse metabolske utvekslingene mellom tarmmikrobielle arter og deres menneskelige verter har enorme konsekvenser for en lang rekke helsemessige forhold, muligens til og med humøret vårt. Kan mikrobiomet 'justeres' for å øke fordelaktige bakteriepopulasjoner? Hvordan påvirker kostholdet vårt denne tuningen? Vi er glade for at denne kunnskapsbasen lar oss kvantifisere disse skiftene og knytte dem til menneskers helse, "sa Hiroki Morizono, PhD, informatikk co-lead på CTSI-tilskuddet, medforfatter, direktør for biomedisinsk informatikk ved Children's National og førsteamanuensis i professor i genomikk og presisjonsmedisin og pediatri ved GW School of Medicine and Health Sciences.
Enkelte bakteriearter kan øke HIV -risikoen hos kvinner,
Edderkoppespeptid kan hjelpe til med å stoppe smerter ved irritabel tarm
Tiopuriner kan hjelpe til med å stoppe virusreplikasjon hos menneskelige koronavirus
Plantebasert diett kan helbrede din revmatoid artritt
GSK-3-hemmere viser løfte om behandling av koronavirusinfeksjoner
Forstå halsbrann
Mikrober knyttet til hjerteinfarkt finner studier
En studie avslørt på ESC -kongressen 2019 i Paris sist helg avslører at unormal mikrobepopulasjon i kroppen kan føre til svekkelse av de stabile koronarplakkene og føre til at de løsnes og fører til h
Hva kan gammel avføring fortelle oss om utviklingen av det menneskelige tarmmikrobiomet?
Eldre mikrobiotainformasjon representerer en viktig ressurs for å studere bakteriell evolusjon og utforske den biologiske spredningen av kroniske sykdommer gjennom historien. Et internasjonalt team
Type 1 diabetes knyttet til tarmmikrobiom og genetiske faktorer
En ny studie fra Lingköping University i Sverige og University of Florida har avslørt at tarmmikrobiomet til barn med høy genetisk risiko for å utvikle type 1 diabetes er markant forskjellig fra barn