Differenzen am Mikrobiom goufen an intubéierte Patienten observéiert déi eng méi héich Prävalenz fir Staphylococcus . Méi grouss Quantitéiten un Anelloviridae an Redondoviridae goufen och korreléiert mat intubéierten Patienten mat schwéiere COVID-19 Komplikatiounen.
D'Fuerscher schreiwen:
Studie:Ënnerschrëften vun der COVID-19 Gravitéit an der Immunantwort am Atmungstraktmikrobiom. Bildkreditt:Kateryna Kon / Shutterstock"Mir berichten eng déif Dysbiose vum Atmungstrakt bakteriell a viral Mikrobiom bei hospitaliséierten COVID-19 Patienten, déi sech vun deenen vun Net-COVID Patienten ënnerscheet, weist eng beschleunegt Destabiliséierung iwwer Zäit, an assoziéiert mat der Schwéierkraaft vun der Krankheet a systemesche Immunprofiler.
D'Team huet oropharyngeal oder nasopharyngeal Schwäbele gesammelt vun 83 Patiente hospitaliséiert fir COVID-19 Infektioun. D'Patienten haten e Median vun 64 Joer an abegraff 39 Fraen a 44 Männer. Ongeféier 67% vun de Patienten ware Schwaarz, gefollegt vun 24% vun de Patienten, déi sech als Wäiss identifizéieren. Ausser fënnef, all haten Komorbiditéiten. D'Prouwe goufen op engem Median vu véier Deeg kritt nodeems se hospitaliséiert goufen. Et waren och 48% vun de Participanten, déi intubéiert goufen, mat 24% stierwen. Dës Patienten hunn och endotracheal Aspirat Proben ginn.
Dräizéng Participanten ouni COVID-19 awer mat engem ënnerierdeschen Zoustand goufen hospitaliséiert awer an der net-ICU. Ongeféier 62% missten intubéiert ginn, a vun deenen, 46% sinn gestuerwen.
D'Gravitéit vun der Krankheet gouf gemooss mat der WHO 11-Punkt Skala, mat Hospitaliséierung als Niveau 4 an Doud mam Label 10.
Insgesamt 582 Exemplare fir d'Mikrobiomanalyse goufen aus COVID-positiven Patienten a 75 aus Net-COVID gesammelt.
Studiekontrollen bestoungen aus 30 gesonde Eenzelpersounen, déi Swabeproblemer an 12 Proben zur Verfügung gestallt hunn, déi Bronchoskopie a bronchoalveolar Spülen gemaach hunn.
RNA aus Patiente Proben extrahéiert war variabel, an d'Viralbelaaschtung ass bei de meeschte Patienten net erkennbar wärend der Krankheet Fortschrëtt. Wéi och ëmmer, e puer Patiente weise weider SARS-CoV-2 RNA 3 Woche nom Ufank vum Symptom.
RNA Niveauen korreléieren net mat klineschen Resultater.
Genom Sequencing vu 26 Patiente Proben huet gewisen datt SARS-CoV-2 ënner der B.1 Lineage gefall ass. Dës Lineage enthält d'D614G Mutatioun um Spike Protein zesumme mat der P314L Variant.
D'Atmungsmikrobiome bei intubéierten Patienten enthalen allgemeng Atmungspathogenen, dorënner Staphylokokken, Klebsiella, a Stenotrophomonas . Wéi och ëmmer, manner divers Mikrobiome goufen bei Patienten mat COVID-19 observéiert.
Vun de 24 intubéierten Patienten, 6 Mikrobiome weisen eng héich Prävalenz fir Staphylococcus . Ongeféier 5 Patienten hunn d'Staphylococcus Dominanz am Mikrobiom eng Woch nom Kulturtest gewisen, an nëmmen 3 haten S. aureus . Dräi Patienten haten Enterococcus .
Aner Pathogenen präsent awer a méi klenge Quantitéiten abegraff Stenotrophomonas , Enterobacteriaceae , an Enterobakterales .
Fuerscher hunn d'Stabilitéit am Mikrobiom fir e puer Patienten fonnt, anerer hunn Ännerunge mat der Zäit gewisen. Si schléissen:
"Also, den ënneschten Atmungstraktmikrobiom bei kritesch krank intubéierten COVID-19 Patienten ass eng kleng Diversitéit, kënne vun entweder Pathogenen oder normaler ieweschter Atmungstaxa dominéiert ginn, kann eng Viraussiicht fir de Staphylococcus hunn, a ka ganz dynamesch sinn.
Stéierungen am Mikrobiom virausgesot och d'Immunitéit vis-à-vis vum COVID-19-e méi nidderegen Lymphozyten-zu-Neutrophil-Verhältnis verbonne mat manner diversen Airway Mikrobiome Gemeinschaften. Déi verréngert Niveaue korreléiere mat enger erhéiter Krankheet Gravitéit.
D'Team huet och op 193 individuell cellulär Immunfeatures aus periphere Blutt mononuclear Zell Phenotyping Proben aus 34 Patienten gekuckt. D'Resultater weisen datt den oropharyngealen Mikrobiom mat der systemescher Immunzellkompositioun assoziéiert ass.
Fréi Probe gewisen Anelloviridae an Redondoviridae waren eng vun den exzellenten mikrobiellen Indikatoren fir Intubatioun am Spidol ze erfuerderen. D'DNA Viren goufen och mat engem méi héije WHO Score verbonnen, wat eng méi grouss Gravitéit vun der Krankheet uginn.
Fuerscher hunn Maschinnléiere Algorithmen an zwee Patienten benotzt fir erhiefte Niveauen vu klenge kreesfërmegen DNA Viren ze fannen, déi virausgesot gi wa eng Persoun intubéiert wier-och wa se net sou staark waren wéi Bakterien bei der Prognose vun der COVID-19 Krankheet Gravitéit. Prevotella an Mycoplasma an oropharyngeal Proben goufen och verbonne mat engem gréissere Risiko fir hospitaliséiert Intubatioun. Dëst proposéiert bakteriell Lineagen anstatt DNA Virussen ze korreléieren mat méi héijer Krankheet Gravitéit.
"Eis Längsanalyse huet méi grouss Destabiliséierung vum oropharyngealen bakterielle Mikrobiom bei COVID-19 opgedeckt wéi Net-COVID Patienten. Dës Erfaassung ass besonnesch opfälleg well net-COVID Patienten allgemeng méi krank waren (all an der ICU; 40% veruerteelt) wéi COVID-19 Patienten (béid ICU an Net-ICU Patienten; 24% veruerteelt). "
*medRxiv verëffentlecht virleefeg wëssenschaftlech Berichter déi net peer-iwwerschafft sinn an, dofir, soll net als schlussendlech ugesi ginn, guidéiert d'klinesch Praxis/gesondheetlech Verhalen, oder als etabléiert Informatioun behandelt.