Razlike u mikrobiomu uočene su kod intubiranih pacijenata koji su pokazali veću prevalenciju za Staphylococcus . Veće količine Anelloviridae i Redondoviridae također su povezani s intubiranim pacijentima s teškim komplikacijama COVID-19.
Istraživači pišu:
"Izvještavamo o dubokoj disbiozi bakterijskog i virusnog mikrobioma respiratornog trakta u hospitaliziranih pacijenata s COVID-19, koji se razlikuje od bolesnika koji nemaju COVID, pokazuje ubrzanu destabilizaciju s vremenom, i povezuje s težinom bolesti i sustavnim imunološkim profilima.
Studija:Potpisi ozbiljnosti COVID-19 i imunološkog odgovora u mikrobiomu respiratornog trakta. Zasluga za sliku:Kateryna Kon / Shutterstock Tim je prikupio brise iz orofaringeusa ili nazofaringeusa od 83 pacijenata hospitaliziranih zbog infekcije COVID-19. Pacijenti su imali prosjek od 64 godine i uključivali su 39 žena i 44 muškarca. Oko 67% pacijenata bili su crnci, slijedi 24% pacijenata koji se identificiraju kao bijelci. Osim pet, svi su imali popratne bolesti. Uzorci su dobiveni u prosjeku od četiri dana nakon hospitalizacije. Bilo je i 48% sudionika koji su bili intubirani, s 24% umrlih. Ti su pacijenti također dali uzorke endotrahealnog aspirata.
Trinaest sudionika bez COVID-19, ali s temeljnim stanjem, hospitalizirano je, ali na odjelu koji nije odjel intenzivne njege. Oko 62% je trebalo intubirati, a od njih, 46% je umrlo.
Ozbiljnost bolesti mjerena je WHO ljestvicom od 11 bodova, pri čemu je hospitalizacija bila razina 4, a smrt označena razinom 10.
Ukupno je prikupljeno 582 uzorka za analizu mikrobioma od pacijenata pozitivnih na COVID, a 75 iz onih koji nisu COVID.
Kontrole studije sastojale su se od 30 zdravih pojedinaca koji su dali uzorke brisa i 12 uzoraka koji su podvrgnuti bronhoskopiji i bronhoalveolarnom ispiranju.
RNA ekstrahirana iz uzoraka pacijenata bila je promjenjiva, a virusno opterećenje opalo je na nemjerljivo kod većine pacijenata tijekom progresije bolesti. Međutim, neki su pacijenti nastavili pokazivati SARS-CoV-2 RNA 3 tjedna nakon početka simptoma.
Razina RNA nije u korelaciji s kliničkim ishodima.
Sekvenciranje genoma iz 26 uzoraka pacijenata pokazalo je da SARS-CoV-2 potpada pod liniju B.1. Ova loza sadrži mutaciju D614G na proteinu šiljaka zajedno s P314L varijantom.
Respiratorni mikrobiomi kod intubiranih pacijenata uključivali su uobičajene respiratorne patogene, uključujući Stafilokok, Klebsiella, i Stenotrophomonas . Međutim, manje raznoliki mikrobiomi uočeni su u pacijenata s COVID-19.
Od 24 intubirana pacijenta, 6 mikrobioma pokazalo je visoku prevalenciju za Staphylococcus . Oko 5 pacijenata pokazalo je dominaciju stafilokoka u mikrobiomu tjedan dana nakon ispitivanja kulture, a samo 3 su imale S. aureus . Tri pacijenta su imala Enterococcus .
Prisutni su i drugi patogeni, ali u manjim količinama Stenotrophomonas , Enterobacteriaceae , i Enterobacterales .
Istraživači su otkrili stabilnost mikrobioma kod nekih pacijenata, dok su drugi pokazali promjene s vremenom. Zaključuju:
"Tako, mikrobiom donjih dišnih putova u kritično bolesnih intubiranih pacijenata s COVID-19 je male raznolikosti, u njima mogu dominirati patogeni ili normalni taksoni gornjih dišnih putova, može imati sklonost prema stafilokoku, i može biti vrlo dinamičan. "
Poremećaji u mikrobiomu također su predvidjeli imunitet na COVID-19-niži omjer limfocita i neutrofila povezan s manje raznolikim zajednicama mikrobioma dišnih putova. Smanjene razine koreliraju s povećanom težinom bolesti.
Tim je također pogledao 193 pojedinačne stanične imunološke značajke iz uzoraka fenotipizacije mononuklearnih stanica periferne krvi 34 pacijenata. Rezultati su pokazali da je orofaringealni mikrobiom povezan sa sustavnim sastavom imunoloških stanica.
Rano uzorkovanje je pokazalo Anelloviridae i Redondoviridae bili su jedan od najboljih mikrobioloških pokazatelja koji zahtijevaju intubaciju u bolnici. DNA virusi također su povezani s višim rezultatom WHO -a, što je ukazivalo na veću težinu bolesti.
Istraživači su koristili algoritme strojnog učenja kod dva pacijenta kako bi pronašli povišene razine malih kružnih DNK virusa za koje je predviđeno da će osoba biti intubirana-iako nisu bili jaki kao bakterije u predviđanju ozbiljnosti bolesti COVID-19. Prevotella i Mikoplazma u uzorcima orofaringeusa također su bili povezani s većim rizikom od hospitalizirane intubacije. To sugerira da su bakterijske loze, a ne DNA virusi u korelaciji s većom težinom bolesti.
“Naša longitudinalna analiza otkrila je veću destabilizaciju orofaringealnog bakterijskog mikrobioma u COVID-19 nego pacijenti koji nisu COVID. Ovaj je nalaz posebno upečatljiv s obzirom na to da su pacijenti bez COVID-a bili sveukupno bolesniji (svi na intenzivnoj njezi; 40% smrtnosti) od pacijenata s COVID-19 (i pacijenti na intenzivnoj i ne-intenzivnoj terapiji; 24% smrtnosti). "
*medRxiv objavljuje preliminarna znanstvena izvješća koja nisu recenzirana i, stoga, ne treba smatrati konačnim, usmjeriti kliničku praksu/ponašanje povezano sa zdravljem, ili se tretira kao utvrđena informacija.
Kriptosporidioza se pogoršava uobičajenim probioticima
Istaknuti i ključni zaključci s Bostonskog bakterijskog sastanka (BBM) 2019.
Bakterijske promjene u crijevima utječu na rezultate liječenja lupusa u trudnoći
Znanstvenici dokazuju ulogu mikrobioma u pretilosti
Modulacija mikrobiote i ponovno uspostavljanje eubioze mogli bi pomoći u suzbijanju komplikacija COVID-19
Dobre vijesti za oboljele od IBS -a jer istraživači identificiraju "svrbež u crijevima"
Zašto pacijenti s COVID-19 imaju više patogenih bakterija u nosu
Istraživači su usporedili nosni mikrobiom oboljelih od koronavirusa 2019 (COVID-19), zdravi pojedinci, i zdravstvenih radnika. Ove su studije pokazale povećanje patogena Pseudomonas aeruginosa prisu
Plastika se danas obično nalazi u ljudskoj stolici
Gotovo osam milijardi tona plastike svake godine nađe put do oceana. Ova ogromna količina plastike ili se ispire na obalu ili se raspada na sitne komade promjera manjeg od 5 milimetara koji se nazivaj
Kronični kašalj mogao bi se ublažiti novim lijekom
Par studija pokazalo je da bi se kronični kašalj i njegovi uznemirujući simptomi mogli ublažiti uz pomoć novog lijeka. Također, lijek nema nuspojava koje mogu ograničiti njegovu upotrebu, objašnjavaju