Resistenza agli antibiotici trovata nel microbioma intestinale dei lemuri che vivono vicino all'uomo

Resistenza agli antibiotici, che il CDC definisce una delle crisi di salute pubblica più urgenti al mondo, si trova ora nelle viscere dei lemuri, i nostri lontani cugini primati.

In un nuovo studio apparso il 9 agosto sulla rivista Frontiere in ecologia ed evoluzione , I ricercatori della Duke hanno trovato prove di resistenza agli antibiotici nel microbioma dei lemuri che vivono vicino agli umani. E più stretto è il contatto, più resistenza agli antibiotici hanno trovato.

Il gruppo di ricerca, studentessa laureata Sally Bornbusch e Christine Drea, Professore di Antropologia Evoluzionistica alla Duke University, ha campionato lo sterco dei lemuri dalla coda ad anelli e sequenziato i geni di tutti i microbi trovati lì, ricerca di marcatori genetici di resistenza agli antibiotici.

Lo studio ha confrontato 10 popolazioni di lemuri:sette popolazioni selvatiche in Madagascar, due da strutture di ricerca - il Lemur Rescue Center in Madagascar e il Duke Lemur Center negli Stati Uniti - e infine un gruppo di lemuri tenuti come animali domestici in Madagascar.

Negli animali selvatici, la proporzione media di geni di resistenza nei microbiomi intestinali era vicina allo zero. Ma negli animali provenienti da strutture di ricerca, quella proporzione era più di 25 volte maggiore che nei lemuri selvatici. Nei lemuri domestici, la proporzione era quasi 35 volte maggiore.

Parte di ciò è probabilmente dovuto a una buona assistenza veterinaria:i lemuri che vivono nelle strutture di ricerca vengono trattati per le infezioni quando necessario, e quindi hanno una maggiore esposizione diretta agli antibiotici rispetto ai loro cugini selvatici.

Però, i lemuri domestici che probabilmente non riceveranno mai cure veterinarie ospitavano la più alta abbondanza di geni di resistenza agli antibiotici.

Tenere un lemure come animale domestico è illegale in Madagascar, quindi è improbabile che coloro che allevano i lemuri portino questi animali da un veterinario e rischino di affrontare conseguenze legali. Questi lemuri domestici stanno quindi acquisendo i microbi resistenti agli antibiotici semplicemente condividendo il loro ambiente con umani e animali domestici.

I lemuri dalla coda ad anelli sono onnivori e generalisti che mangeranno la terra, escrementi, e qualunque cosa possano ottenere. In una famiglia domestica, sono spesso in costante contatto con gli umani, appollaiato sulle spalle del loro proprietario, o tra le braccia di turisti disposti a pagare per una foto (pratica dannosa sia per l'uomo che per gli animali).

Bornbusch ha affermato che questo ambiente fisico e sociale apparentemente contribuisce alla resistenza agli antibiotici dei lemuri domestici.

I microbi sono come una coperta che si sovrappone a tutto. Non sono solo nelle nostre viscere, ma anche sulla nostra pelle, i nostri mobili, e nel nostro cibo e acqua. sono ovunque, tutto il tempo, e si trasmettono facilmente tra gli ambienti."

Sally Bornbusch, Studente laureato, Duke University

Tra i lemuri selvatici, la resistenza agli antibiotici variava lungo un gradiente di attività umana. Animali provenienti da aree colpite dal pascolo del bestiame, agricoltura, o il turismo ospitava più microbi resistenti agli antibiotici rispetto a quelli provenienti da ambienti più incontaminati, ma ancora molto meno dei lemuri che vivono nelle immediate vicinanze degli umani.

"Il trattamento antibiotico non è chiaramente l'unico meccanismo che porta a una maggiore abbondanza di geni di resistenza in questi animali, " ha detto Bornbusch.

Infatti, anche tra i lemuri alloggiati nelle strutture di ricerca, quelli senza precedente trattamento antibiotico ospitavano un numero simile di geni di resistenza agli antibiotici rispetto ai lemuri della stessa struttura che erano stati trattati molte volte per le infezioni.

La vicinanza all'uomo ha anche determinato il tipo di geni di resistenza acquisiti. I microbiomi dei lemuri dalla coda ad anelli del Madagascar hanno mostrato segni di resistenza agli antibiotici usati per combattere le epidemie di peste, mentre i lemuri degli Stati Uniti hanno mostrato resistenza agli antibiotici frequentemente prescritti in Nord America.

I geni di resistenza agli antibiotici non sono una novità. I microbi hanno mutato ed evoluto geni di resistenza per milioni di anni in una corsa agli armamenti con antibiotici naturali.

In uno scenario naturale, questo processo raramente pone problemi. Ma le cose hanno iniziato ad andare storte quando gli umani hanno sfruttato il potere degli antibiotici naturali e hanno rilasciato al pubblico antibiotici artificiali.

"Gli umani sono arrivati, sviluppato antibiotici, diffondili intorno a noi, e propagato questi geni di resistenza negli ambienti naturali e nei microbiomi della fauna selvatica, " disse Bornbusch. Anche se cupo, questi risultati possono avere un impatto positivo sulle pratiche di conservazione e gestione della fauna selvatica.

"Anche se questi risultati sono leggermente spaventosi, ci aiutano a usare la scienza del microbioma per affinare le pratiche veterinarie e le attività di conservazione, " ha detto Bornbusch. Ha anche detto che sono necessarie ulteriori ricerche per comprendere meglio l'impatto di questi geni di resistenza sulla fauna selvatica.

"Proprio adesso, sappiamo che questi geni di resistenza sono là fuori, ma non sappiamo se sono veramente dannosi per i lemuri, " ha affermato Bornbusch. "Questi risultati ci forniscono un trampolino di lancio per la ricerca sull'impatto di questi microbi resistenti sulla fauna selvatica e sul loro ambiente".

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