Det orala mikrobiomet - summan av mikroorganismer, inklusive bakterier och svampar, som upptar den mänskliga munnen - var föremål för en publik, medborgarvetenskaplig studie av Jessica Metcalfs forskningslabb vid CSU och Nicole Garneaus forskargrupp vid Denver Museum of Nature &Science. Publicerad i Vetenskapliga rapporter , studien fann, bland annat, ett samband mellan personer som inte besökte tandläkaren regelbundet och ökad förekomst av en patogen som orsakar periodontal sjukdom.
För experimenten, utförd av Garneaus samhällsvetenskapliga team i Genetics of Taste Lab på museet, ett brett tvärsnitt av museibesökare underkastade en kindpinne och svarade på enkla frågor om deras demografi, livsstilar och hälsovanor. Mikrobiell DNA -sekvenseringsdata analyserad av Metcalfs grupp avslöjade, brett, att munhälsovanor påverkar bakteriesamhällena i munnen. Studien betonade behovet av att tänka på munhälsa som starkt kopplad till hela kroppens hälsa.
Vår studie visade också att crowdsourcing och användning av samhällsvetare kan vara ett riktigt bra sätt att få denna typ av data, utan att behöva använda stora, fallkontrollerade studier. "
Zach Burcham, postdoktor och tidningens huvudförfattare
Seniorförfattaren Metcalf är docent vid Institutionen för djurvetenskap och medlem i CSU:s Microbiome Network.
Tillbaka 2015, papper -medförfattaren Garneau och hennes team utbildade frivilliga medborgarforskare att använda stora pinnar för att samla kindceller från museibesökare - en naturligt mångfaldig befolkning - som godkände studien. Dessa utbildade medborgarforskare hjälpte till att samla pinnar från 366 individer - 181 vuxna och 185 ungdomar i åldern 8 till 17 år.
Den ursprungliga drivkraften för studien var att avgöra om och i vilken utsträckning det orala mikrobiomet bidrar till hur människor smakar söta saker. Vid insamlingen av dessa uppgifter, som också rapporterades i tidningen, forskarna noterade mer betydande datapunkter kring munhälsovanor.
För att hjälpa till att översätta data, Garneau vände sig till Metcalfs expertteam på CSU. Burcham och mikrobiomforskarna använde sofistikerade sekvenserings- och analysverktyg för att avgöra vilka mikrober som fanns i vilka munnar. Sekvensering för data utfördes i samarbete med forskare i Rob Knights grupp vid University of California San Diego. Ett näringsteam från Michigan State University tog också med sig expertis om betydelsen av barn- och mödrarelationer för dataanalysen.
"Tillsammans, vi hade ett drömteam för att använda samhällsvetenskap för att svara på komplicerade frågor om människors hälsa och näring, med hjälp av toppmodern mikrobiell sekvensering och analys, "Sa Garneau.
Studien grupperade människor som tandtrådade eller inte tandtråd (nästan alla sa att de borstade, så det var inte en användbar datapunkt). Deltagare som tandtråd visade sig ha lägre mikrobiell mångfald i munnen än icke-tandtråd. Detta beror troligen på det fysiska avlägsnandet av bakterier som kan orsaka inflammation eller sjukdom.
Vuxna som hade gått till en tandläkare under de senaste tre månaderna hade lägre övergripande mikrobiell mångfald i munnen än de som inte hade gått på 12 månader eller längre, och hade mindre av den periodontala sjukdomsframkallande orala patogenen, Treponema. Detta, på nytt, berodde troligen på att tandrengöring tog bort sällsynta bakterietaxor i munnen. Ungdom tenderade att ha haft ett tandläkarbesök på senare tid än vuxna.
Ungdomsmikrobiomer skilde sig bland män och kvinnor, och i vikt. Barn som ansågs feta enligt deras kroppsmassaindex hade olika mikrobiomer jämfört med icke-feta barn. De feta barnen tenderade också att ha högre nivåer av Treponema, samma patogen som finns hos vuxna som inte varit hos tandläkaren på mer än ett år. Med andra ord, forskarna såg ett möjligt samband mellan fetma hos barn och periodontal sjukdom. "Detta var väldigt intressant för mig, att vi kunde upptäcka dessa data i en sådan allmän befolkning, med en så varierande grupp människor, "Sa Burcham.
Andra data avslöjade:Mikrobiomerna hos yngre deltagare, mestadels i intervallet 8- till 9-åriga, hade mer mångfald än vuxnas. Dock, vuxna mikrobiomer varierade mer från person till person. Forskarna tror att detta beror på att vuxnas miljöer och dieter är mer omfattande än barn.
De såg också att människor som bodde i samma hushåll delade liknande orala mikrobiomer.
"När du tittar på familjer som bor tillsammans, du tycker att de delar fler av de sällsynta taxorna, bakterierna som inte finns så ofta i högre mängder, "Burcham förklarade. Det var en datapunkt som betonade relevansen av ens byggda miljö i förhållande till de mikrobiella samhällena i våra kroppar.
Att arbeta med munstudiet var fascinerande, om än utanför Burchams normala tillämpningsområde; han är vanligtvis fokuserad på att studera mikrobiell ekologi för sönderdelning.
"Jag tror att våra liv i huvudsak drivs av våra mikrobiomer, och påverkas av våra mikrobiomer, är intressant, oavsett vilket system vi tittar på, "Sa Burcham.