Oralni mikrobiom - vsota mikroorganizmov, vključno z bakterijami in glivami, ki zasedajo človeška usta - je bil predmet množice, državljanska znanstveno vodena študija raziskovalnega laboratorija Jessice Metcalf na CSU in raziskovalne skupine Nicole Garneau v Denverskem muzeju narave in znanosti. Objavljeno v Znanstvena poročila , študija je pokazala, med drugim, korelacija med ljudmi, ki niso redno obiskovali zobozdravnika, in povečano prisotnostjo patogena, ki povzroča parodontalno bolezen.
Za poskuse, ki ga je izvedla Garneaujeva znanstvena skupina za skupnost v laboratoriju Genetics of Taste v muzeju, širok prerez muzejskih obiskovalcev, ki so bili podvrženi brisu ličnic in odgovarjali na preprosta vprašanja o njihovi demografiji, življenjski slog in zdravstvene navade. Podatki o sekvenciranju mikrobne DNA, ki jih je analizirala Metcalfova skupina, so pokazali, na splošno, da ustne zdravstvene navade vplivajo na bakterijske skupnosti v ustih. Študija je poudarila potrebo po razmišljanju o ustnem zdravju, ki je močno povezano z zdravjem celotnega telesa.
Naša študija je tudi pokazala, da je množično navajanje in uporaba znanstvenikov skupnosti lahko res dober način za pridobivanje tovrstnih podatkov, ne da bi morali uporabljati velike, študije, ki jih nadzira primer. "
Zach Burcham, podoktorski raziskovalec in vodilni avtor prispevka
Višji avtor Metcalf je izredni profesor na Oddelku za znanosti o živalih in član Microbiome Network CSU.
Še leta 2015, soavtorica papirja Garneau in njena ekipa sta usposobila prostovoljne državljanske znanstvenike za uporabo velikih brisov za zbiranje celic ličnic od obiskovalcev muzejev - naravno raznolike populacije - ki so privolili v študijo. Ti usposobljeni državljanski znanstveniki so pomagali zbirati brise 366 posameznikom - 181 odraslim in 185 mladim, starim od 8 do 17 let.
Prvotni zagon za študijo je bil ugotoviti, ali in v kolikšni meri mikrobiom v ustih prispeva k temu, kako ljudje okusijo sladke stvari. Pri zbiranju teh podatkov, o čemer so poročali tudi v časopisu, Raziskovalci so ugotovili pomembnejše podatke o oralnih zdravstvenih navadah.
Za lažji prevod podatkov Garneau se je obrnil na Metcalfovo ekipo strokovnjakov pri CSU. Burcham in znanstveniki za mikrobiome so uporabili sofisticirana orodja za zaporedje in analizo, da bi ugotovili, kateri mikrobi so prisotni v katerih ustih. Zaporedje podatkov je bilo izvedeno v sodelovanju z znanstveniki iz skupine Roba Knighta na kalifornijski univerzi v San Diegu. Skupina za prehrano z univerze Michigan State je v analizo podatkov vključila tudi znanje o pomenu otrokovih in materinskih odnosov.
"Skupaj, imeli smo sanjsko ekipo za uporabo znanosti skupnosti za odgovarjanje na zapletena vprašanja o zdravju in prehrani ljudi, z uporabo najsodobnejšega sekvenciranja in analize mikrobov, "Je rekel Garneau.
Študija je združila ljudi, ki uporabljajo zobno nitko ali ne uporabljajo zobne nitke (skoraj vsi so rekli, da so ščetkali, torej to ni bil uporaben podatek). Udeleženci, ki so uporabljali zobno nitko, so imeli v ustih manjšo mikrobno raznolikost kot ne-flosserji. To je najverjetneje posledica fizičnega odstranjevanja bakterij, ki bi lahko povzročile vnetje ali bolezen.
Odrasli, ki so v zadnjih treh mesecih obiskali zobozdravnika, so imeli v ustih nižjo splošno mikrobiološko raznolikost kot tisti, ki niso šli 12 mesecev ali dlje, in je imel manj ustnega patogena, ki povzroča parodontalno bolezen, Treponema. To, ponovno, verjetno zaradi čiščenja zob, ki je odstranilo redkejše bakterijske taksone v ustih. Mladi so bili v zadnjem času pogosteje pri odraslih pri odraslih.
Mikrobiomi mladih so se med samci in samicami razlikovali, in po teži. Otroci, ki so glede na indekse telesne mase šteli za debele, so imeli v primerjavi z otroci brez debelosti različne mikrobiome. Debeli otroci so imeli tudi višjo stopnjo treponeme, isti patogen, ugotovljen pri odraslih, ki niso bili pri zobozdravniku več kot eno leto. Z drugimi besedami, raziskovalci so videli možno povezavo med debelostjo pri otrocih in parodontalno boleznijo. "To mi je bilo zelo zanimivo, da smo te podatke lahko odkrili pri tako splošni populaciji, s tako spremenljivo skupino ljudi, "Je rekel Burcham.
Drugi odkriti podatki:mikrobiomi mlajših udeležencev, večinoma v starosti od 8 do 9 let, imeli večjo raznolikost kot odrasli. Vendar pa odrasli mikrobiomi so bili od osebe do osebe bolj različni. Raziskovalci menijo, da je to posledica širšega okolja in prehrane odraslih kot otrok.
Ugotovili so tudi, da imajo ljudje, ki živijo v istem gospodinjstvu, podobne ustne mikrobiome.
"Ko pogledate družine, ki živijo skupaj, ugotovite, da si delijo več teh redkih taksonov, bakterije, ki jih v večji številčnosti ne najdemo tako pogosto, "Je pojasnil Burcham. To je bila podatkovna točka, ki je poudarila pomembnost lastnega zgrajenega okolja v odnosu do mikrobnih skupnosti v našem telesu.
Delo na študiji ust je bilo fascinantno, čeprav izven običajnega obsega Burchama; običajno se osredotoča na proučevanje mikrobne ekologije razgradnje.
"Mislim, da naše življenje v bistvu poganjajo naši mikrobiomi, na katere vplivajo naši mikrobiomi, je zanimivo, ne glede na to, na kakšen sistem gledamo, "Je rekel Burcham.