Микробиом полости рта - совокупность микроорганизмов, включая бактерии и грибки, которые занимают человеческий рот - было предметом краудсорсинга, гражданское научное исследование, проведенное исследовательской лабораторией Джессики Меткалф в CSU и исследовательской группой Николь Гарно в Денверском музее природы и науки. Опубликовано в Научные отчеты , найденное исследование, среди прочего, корреляция между людьми, которые не посещали стоматолога регулярно, и повышенным присутствием патогена, вызывающего заболевания пародонта.
Для экспериментов проведенный научным коллективом Гарно в лаборатории генетики вкуса в музее, широкий круг посетителей музеев сдал мазок со щеки и ответил на простые вопросы об их демографии, образ жизни и привычки в отношении здоровья. Данные микробного секвенирования ДНК, проанализированные группой Меткалфа, показали:в широком смысле что привычки в отношении здоровья полости рта влияют на сообщества бактерий во рту. Исследование подчеркнуло необходимость думать о здоровье полости рта как о тесно связанном со здоровьем всего тела.
<цитата>Наше исследование также показало, что краудсорсинг и привлечение ученых из сообщества могут быть действительно хорошим способом получения данных такого типа. без необходимости использовать большие, кейс-контролируемые исследования ».
Зак Бурчам, постдокторант и ведущий автор статьи
Старший автор Меткалф - доцент кафедры зоотехники и член Микробиомной сети CSU.
Еще в 2015 году Соавтор статьи Гарно и ее команда обучили гражданских ученых-добровольцев использовать большие мазки для сбора клеток щек у посетителей музея - естественно разнообразного населения - которые согласились на исследование. Эти обученные гражданские ученые помогли собрать мазки у 366 человек - 181 взрослого и 185 молодых людей в возрасте от 8 до 17 лет.
Первоначальным стимулом для исследования было определить, влияет ли микробиом полости рта на то, как люди пробуют сладкое, и в какой степени. Собирая эти данные, о чем также сообщалось в газете, исследователи отметили более важные данные о привычках в отношении здоровья полости рта.
Чтобы помочь перевести данные, Гарно обратился к группе экспертов Меткалфа из CSU. Берчем и ученые-микробиомы использовали сложные инструменты секвенирования и анализа, чтобы определить, какие микробы присутствовали в каких ртах. Секвенирование данных было выполнено в сотрудничестве с учеными из группы Роба Найта из Калифорнийского университета в Сан-Диего. Группа диетологов из Университета штата Мичиган также внесла свой вклад в анализ данных о важности взаимоотношений ребенка и матери.
"Вместе, у нас была команда мечты об использовании науки сообщества для ответа на сложные вопросы о здоровье и питании человека, с использованием современного микробиологического секвенирования и анализа, "- сказал Гарно.
В исследовании были сгруппированы люди, которые чистили зубной нитью или не чистили зубной нитью (почти все сказали, что чистили щеткой, так что это не было полезной точкой данных). Было обнаружено, что участники, пользующиеся зубной нитью, имели более низкое микробное разнообразие во рту, чем участники, не пользующиеся зубной нитью. Скорее всего, это связано с физическим удалением бактерий, которые могут вызывать воспаление или заболевание.
У взрослых, которые обращались к стоматологу за последние три месяца, общее микробное разнообразие во рту было ниже, чем у тех, кто не ходил к стоматологу в течение 12 месяцев или дольше. и имели меньше оральных патогенов, вызывающих заболевания пародонта, Трепонема. Этот, опять таки, Вероятно, это было связано с чисткой зубов, удалявшей изо рта более редкие таксоны бактерий. Молодежь, как правило, посещала стоматолога позже, чем взрослые.
Микробиомы молодежи различались у мужчин и женщин. и по весу. Дети, считающиеся страдающими ожирением в соответствии с их индексами массы тела, имели различные микробиомы по сравнению с детьми, не страдающими ожирением. Дети с ожирением, как правило, имели более высокий уровень трепонемы, тот же патоген, обнаруженный у взрослых, которые не посещали стоматолога более года. Другими словами, исследователи увидели возможную связь между детским ожирением и заболеваниями пародонта. "Мне было очень интересно, что мы смогли обнаружить эти данные в такой общей популяции, с такой переменной группой людей, "Сказал Бурчем.
Другие обнаруженные данные:микробиомы более молодых участников, в основном в возрасте от 8 до 9 лет, было больше разнообразия, чем у взрослых. Тем не мение, микробиомы взрослых варьировались от человека к человеку в более широких пределах. Исследователи считают, что это связано с тем, что среда и диета взрослых более разнообразны, чем дети.
Они также увидели, что люди, живущие в одном доме, имели одинаковые микробиомы полости рта.
"Когда вы смотрите на семьи, которые живут вместе, вы обнаружите, что они разделяют больше этих редких таксонов, бактерии, которые не так часто встречаются в больших количествах, "Бёрчем объяснил. Это были данные, которые подчеркнули актуальность созданной человеком среды по отношению к микробным сообществам в наших телах.
Работа над исследованием рта была увлекательной, хотя и за пределами обычных возможностей Бурчама; он обычно сосредоточен на изучении микробной экологии разложения.
"Я думаю, что наша жизнь в основном определяется нашим микробиомом, и затронуты нашими микробиомами, интересно, независимо от того, на какую систему мы смотрим, "Сказал Бурчем.