Programmet Dynamics of Colonization and Infection av multiresistenta patogener i immunkompromitterade och kritiskt sjuka patienter fick ett bidrag på 11 miljoner dollar från National Institute of Allergy and Infectious Diseases för att genomföra denna femåriga studie.
Forskargruppen kommer att försöka förklara mikrobiell, klinisk, och antimikrobiella resistensfaktorer för tre stora multiresistenta patogener:Vancomycinresistenta enterokocker, Enterobacterales som producerar β-laktamaser/karbapenemaser med utökat spektrum, och Clostridioides difficile. Alla tre patogenerna är resistenta mot antimikrobiell behandling som antibiotika.
"Vi vill lära oss mer om hur dessa tre klasser av organismer koloniserar mag -tarmkanalen hos kritiskt sjuka patienter och, så småningom, orsaka infektioner hos dessa patientgrupper, "sa Cesar A. Arias, MD, MSc, Doktorsexamen, studiens huvudutredare och professor i infektionssjukdom vid McGovern Medical School vid UTHealth. Han är också Herbert L. och Margaret W. Dupont ordförande i infektionssjukdomar vid UTHealth School of Public Health.
Projektet kommer att använda state-of-the-art analys av patogenernas genom och deras potentiella produkter-i kombination med robusta mikrobiom (tarmflora) analyser med avföringsprov, orala pinnar, och blodprov.
En innovativ teknik, utvecklat i Texas Children's Hospital Microbiome Center, som använder mikrobiomdatauppsättningar med stora kliniska data, kommer att hjälpa oss att exakt förutsäga sjukdomens mottaglighet för varje patient för att underlätta personlig hantering av infektionssjukdomar. "
Tor Savidge, Doktorsexamen, docent i patologi och immunologi vid Baylor College of Medicine och co-principal investigator på studien
Forskargruppen planerar att följa studiedeltagarna under sjukhusvistelse på intensivvårdsavdelningar vid Memorial Hermann Hospital-Texas Medical Center, liksom de i benmärgstransplantationsenheten på MD Anderson, att förstå varför vissa patienter som har dessa patogener koloniserade i tarmen inte utvecklar infektioner, medan andra gör. Kolonisering innebär att patogenen finns i kroppen, och infektion innebär att patogenen är närvarande och gör patienten sjuk. Individer som löper större risk att utveckla en multiresistent bakteriell infektion är de med försvagade immunförsvar och de som tar antibiotika för andra infektioner.
"Målet är att ta data från denna studie för att utveckla en algoritm som kan avgöra om en patient är låg, medium, eller hög risk, och sedan baserat på den kunskapen, utveckla framtida insatser, sa Arias.
Den mänskliga mikrobioten är den kollektiva helheten av alla biljoner patogener (bakterier, svampar, protozoer, och virus) som lever inuti kroppen. Den största samlingen finns i tarmen. En av mikrobiotans huvudfunktioner är att hjälpa till att reglera immunsystemet, och varje förändring av mikrobioten kan påverka infektionsrisken från en patogen.
Programmet innehåller forskare från Center for Antimicrobial Resistance and Microbial Genomics vid McGovern Medical School, centrum för infektionssjukdomar vid UTHealth School of Public Health, MD Anderson, Texas barnsjukhus, Baylor College of Medicine, University of Houston, Rice University, och Gulf Coast Consortia.
"Denna studie är avgörande för att förbättra de kliniska resultaten för våra cancerpatienter eftersom de är mycket sårbara för dödliga infektioner med antimikrobiellt resistenta bakterier, "sade Samuel A. Shelburne, MD, Doktorsexamen, vice ordförande för Institutionen för infektionssjukdomar, Infektionskontroll och medarbetarhälsa vid MD Anderson och en co-principal investigator på studien. "Genom en kooperativ strategi som utnyttjar unika styrkor från utredare över Texas Medical Center, vi försöker utnyttja mikrobiombaserad vetenskap för att gå vidare mot vårt långsiktiga mål att göra cancerhistoria, " han sa.