Čeprav zanimanje za raziskave o pomenu človeškega črevesnega mikrobioma za splošno zdravje še naprej narašča, raziskovalcem in bolnikom trenutno ni na voljo celovitega referenčnega seznama črevesnih mikrobiomov. V tej študiji je King in sodelavci začnejo katalogizirati sestavo organizmov zdravih črevesnih mikrobiomov, in razvili prototipno poročilo za zdravnike, ki bolnikom posreduje rezultate.
Če želite sestaviti svojo bazo podatkov, avtorji so genetsko sekvencirali 48 vzorcev iztrebkov iz šestnajstih zdravih udeležencev, ki so bili zaposleni iz kampusa Univerze George Washington v Washingtonu, D.C., poleg uporabe 50 fekalnih metagenomskih vzorcev, prenesenih iz projekta Human Microbiome Project pri posameznikih, ki so bili pregledani kot "zdravi".
Po razčlenjevanju genomskih in metagenomskih sekvenc vseh vzorcev z uporabo novega toka dela, ki temelji na programski opremi, King in sodelavci so pripravili začetno bazo podatkov o potrjenih mikrobih in njihovi relativni številčnosti v vseh vzorcih, GutFeelingKB, z uporabo obsežnih in javno dostopnih genetskih informacij NCBI za zagotavljanje metapodatkov o opisanih organizmih.
GutFeelingKB opisuje 157 organizmov (155 bakterijskih in dva arhealna organizma) v 60 različnih rodovih. Največji zastopani tip bakterij je bil Firmicutes (40 odstotkov vseh organizmov na seznamu), ki je bila sestavljena iz 20 odstotkov klostridijev, 19 odstotkov bakterioidije, 17 odstotkov bifidobakterij, 14 odstotkov Enterobacterales, in 14 odstotkov bakterij Lactobacillales - razredi bakterij, ki jih najdemo tudi v jogurtu in drugih probiotičnih živilih. Avtorji tudi ugotavljajo, da je bilo 84 vzorcev skupnih vsem vzorcem, potencialno kaže, da so to lahko jedrne vrste človeškega črevesja.
Ta študija je vključila le šestnajst udeležencev, majhen vzorec. Čeprav bi lahko nadaljnje študije še naprej ugotavljale dodatne organizme, prisotne v zdravih črevesjih z vsega sveta, GutFeelingKB je pomemben prvi korak. Zbirka podatkov bi lahko delovala kot izhodišče za primerjalno analizo vzorcev in razvoj prihodnjih zdravljenj z mikrobiomi za bolnike.
Avtorji dodajajo:
Naš cilj je preslikati zdrav črevesni mikrobiom, tako da bomo lahko mi in drugi raziskovalci uporabili naše podatke za razvoj modelov napovedovanja bolezni. "