Raziskovalec genomike UChicago je prejel nagrado NIH Directors New Innovator Award

Oni Basu, Doktor znanosti, docent za genetsko medicino na Univerzi v Chicagu, je prejel nagrado novega inovatorja direktorja Nacionalnega inštituta za zdravje (NIH).

Te nagrade, del NIH-jevega visokega tveganja, Visoko nagrajen raziskovalni program, so podeljeni izjemno ustvarjalnim znanstvenikom, ki predlagajo visoko tveganje, visoko učinkovite raziskave na vseh stopnjah kariere. Nagrada za novega inovatorja, financirano iz Skupnega sklada NIH, se osredotoča na podporo raziskovalcem v zgodnji karieri, podpiranje nenavadno inovativnih raziskav zgodnjih kariernih preiskovalcev, ki so v 10 letih po zaključku diplome. To leto, Nagrado je prejelo 53 raziskovalcev.

Širina inovativne znanosti, ki jo je predstavila skupina zgodnjih kariernih in izkušenih preiskovalcev leta 2020, je impresivna in navdihujoča. Prepričan sem, da bo njihovo delo spodbudilo biomedicinske in vedenjske raziskave ter vodilo k izboljšanju zdravja ljudi. "

Francis S. Collins, M.D., Doktor znanosti, Direktor NIH

Od prihoda na UChicago leta 2016, Basu je delal na različnih raziskovalnih projektih. Raziskuje kompleksne biološke sisteme z uporabo enocelične genomike - izolira posamezne celice in sekvencira njihove genetske podatke, da bi dobila boljšo sliko celičnih razlik v vzorcu tkiva. To, po vrsti, omogoča vpogled v edinstvene podtipe celic in njihove funkcije v danem tkivu.

Basu se je izobraževal v laboratorijih Aviv Regev, Doktor znanosti, in David Weitz, Doktor znanosti, oba pionirja na področju enocelične genomike in mikrofluidike. Basu je sama soustanoviteljica prve visokocenovne enocelične in enojedrne tehnologije RNA-seq, ki je omogočila njihovo široko uporabo po vsem svetu.

Raziskovalni laboratorij Basu razvija in uporablja nove tehnologije za izvajanje visoko zmogljivih enoceličnih epigenomskih in transkriptomskih profilov do 100, 000 celic hkrati. S tem pristopom, njena ekipa dela na analizi in razvrščanju edinstvenih tipov celic v različnih tkivih, vključno z mišjimi in človeškimi možgani ter populacijo mikrobnih celic.

Njene raziskave prispevajo tudi k atlasu človeških celic, globalni projekt, ki vključuje strokovnjake za genomiko po vsem svetu, katerega cilj je ustvariti popoln atlas vseh vrst celic v človeškem telesu, tako zdravja kot bolezni. Prizadeva si za identifikacijo in karakterizacijo celičnih tipov v človeškem črevesju, da bi vzpostavila celični atlas ileuma - končnega dela tankega črevesa. Z uporabo vzorcev biopsije črevesja pri bolnikih s in brez Crohnove bolezni, skuša bolje razumeti vzorce izražanja celičnega tipa in bolezni, povezane z izčrpavajočim stanjem.

S podporo nagrade New Innovator Award je Basu namerava to enocelično tehnologijo potisniti v mikrobni svet. Raznolikost edinstvenih tipov celic v večceličnih organizmih, kot so ljudje, je povzročila potrebo po preučevanju genoma na enocelični ravni; podobno stopnjo raznolikosti je mogoče pričakovati tudi v mikrobnih skupnostih. Boljše razumevanje te heterogenosti bo pomagalo odgovoriti na vprašanja o zapletenih temah, kot so evolucijska sposobnost in protimikrobna odpornost.

Izdelava orodij, ki bi lahko raziskovala razlike med mikrobnimi celicami pri ločljivosti z eno celico, ostaja izziv. Basu in njena ekipa si prizadevata razviti mikrofluidna in genomska orodja, ki bodo raziskovalcem omogočila dešifriranje zapletenih interakcij med mikrobnimi populacijami, interakcija gostitelj-patogen in mikrobiom.

Visoko tveganje, Raziskovalni program z visoko nagrado spodbuja znanstvena odkritja in podpira raziskovalne predloge, ki, zaradi lastnega tveganja, se lahko kljub svojemu transformacijskemu potencialu spopadajo s tradicionalnim procesom medsebojnega pregleda. Kandidate za program spodbujajo k razmišljanju "izven okvira" in iskanju inovativnih idej na katerem koli področju raziskav, ki so pomembne za poslanstvo NIH za napredovanje znanja in krepitev zdravja.

• Študija lahko pojasni, zakaj lahko rastlina konoplje zmanjša simptome različnih črevesnih stanj
• Tiopurini bi lahko pomagali ustaviti replikacijo virusa pri človeških koronavirusih